More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0378 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  97.18 
 
 		 461 aa  846    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  100 
 
 		 461 aa  885    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  56.64 
 
 		 463 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  56.29 
 
 		 459 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  56.29 
 
 		 459 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  55.77 
 
 		 463 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  57.52 
 
 		 462 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  56.7 
 
 		 459 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  56.1 
 
 		 459 aa  477  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  56.04 
 
 		 459 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  55.53 
 
 		 460 aa  468  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  60 
 
 		 463 aa  461  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  54.37 
 
 		 479 aa  439  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  53.12 
 
 		 500 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  48.43 
 
 		 508 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  50 
 
 		 507 aa  408  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  43.54 
 
 		 472 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04330  Na+/proline symporter  47.8 
 
 		 497 aa  359  6e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.723621  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  37.58 
 
 		 483 aa  331  1e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  29.71 
 
 		 474 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  28.45 
 
 		 483 aa  173  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  30.55 
 
 		 460 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  30.05 
 
 		 483 aa  160  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.32 
 
 		 484 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  28.78 
 
 		 487 aa  152  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  27.59 
 
 		 476 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  28.6 
 
 		 486 aa  152  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  26.37 
 
 		 464 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  29.89 
 
 		 460 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  28.36 
 
 		 452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  24.04 
 
 		 638 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  28.36 
 
 		 506 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  27.53 
 
 		 510 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  26.15 
 
 		 462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  27.08 
 
 		 524 aa  127  6e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  25.15 
 
 		 639 aa  126  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  28.14 
 
 		 482 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  26.43 
 
 		 461 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  27.54 
 
 		 483 aa  123  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  29.18 
 
 		 489 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  27.54 
 
 		 482 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  28.21 
 
 		 479 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  26.8 
 
 		 517 aa  119  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  26.34 
 
 		 475 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  27.29 
 
 		 586 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  26.2 
 
 		 479 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  26.39 
 
 		 479 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  26.29 
 
 		 493 aa  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  29.11 
 
 		 483 aa  116  8.999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  29.03 
 
 		 468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  27.31 
 
 		 492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  27.29 
 
 		 497 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  26.57 
 
 		 483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  26.43 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  28.06 
 
 		 495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  27.93 
 
 		 485 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.34 
 
 		 492 aa  114  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  25.52 
 
 		 486 aa  114  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  26.23 
 
 		 492 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  26.23 
 
 		 492 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  26.23 
 
 		 492 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  29.84 
 
 		 446 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.02 
 
 		 492 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  26.02 
 
 		 492 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  25.49 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  26.95 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05410  Sodium:solute symporter  26.27 
 
 		 542 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000184365  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  25.98 
 
 		 492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  26.09 
 
 		 483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  25.16 
 
 		 500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  25.41 
 
 		 599 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  27.65 
 
 		 483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8130  Na+/solute symporter  24.93 
 
 		 474 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580887  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  26.25 
 
 		 597 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1384  sodium:solute symporter family protein  29.03 
 
 		 588 aa  110  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  26.91 
 
 		 484 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  26.5 
 
 		 515 aa  110  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  27.29 
 
 		 483 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.4 
 
 		 526 aa  110  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  27.29 
 
 		 483 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0672  Na+/solute symporter  25.05 
 
 		 633 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  25.74 
 
 		 478 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  26.88 
 
 		 587 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  25.49 
 
 		 478 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  25 
 
 		 490 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  26.04 
 
 		 588 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  25.67 
 
 		 488 aa  107  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0645  Na+/solute symporter  23.46 
 
 		 472 aa  107  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.646028  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0563  Na+/solute symporter  24.11 
 
 		 476 aa  107  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.379209 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0688  Na+/solute symporter  23.04 
 
 		 471 aa  107  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.217002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  25.61 
 
 		 492 aa  106  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  30.07 
 
 		 484 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0089  Na+/solute symporter  26.74 
 
 		 496 aa  104  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000762337  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  25.85 
 
 		 488 aa  104  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3539  Na+/solute symporter  22.86 
 
 		 471 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0326627  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3710  Na+/solute symporter  22.62 
 
 		 471 aa  103  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  24 
 
 		 449 aa  103  7e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0154  Na+/solute symporter  24.26 
 
 		 531 aa  103  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.535073  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  27.96 
 
 		 496 aa  103  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  25.97 
 
 		 512 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>