More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0610 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1011  Na+/proline symporter  65.18 
 
 		 583 aa  781    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0610  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  100 
 
 		 587 aa  1136    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.922091  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2062  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  84.25 
 
 		 584 aa  891    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16021  Na+/proline symporter  69.49 
 
 		 587 aa  773    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18811  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  64.67 
 
 		 583 aa  777    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0257597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04421  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  75.82 
 
 		 589 aa  754    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1755  hypothetical protein  57.22 
 
 		 577 aa  594  1e-168  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  51.11 
 
 		 603 aa  564  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  35.75 
 
 		 599 aa  337  5e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  34.21 
 
 		 575 aa  311  2e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  34.85 
 
 		 586 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2245  Na+/solute symporter  39.44 
 
 		 609 aa  306  7e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  35.51 
 
 		 585 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1384  sodium:solute symporter family protein  35.17 
 
 		 588 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  34.51 
 
 		 587 aa  300  4e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  35.95 
 
 		 588 aa  298  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1358  Na+/solute symporter  35.59 
 
 		 587 aa  295  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00027915  normal  0.0566975 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1120  Na+/solute symporter  33.39 
 
 		 587 aa  273  9e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.13754  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0638  Na+/solute symporter  31 
 
 		 538 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0129  Na+/solute symporter  27.8 
 
 		 596 aa  156  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0303  Na+/solute symporter  27.24 
 
 		 596 aa  144  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2072  Na+/solute symporter  26.96 
 
 		 609 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0164847 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  31.32 
 
 		 592 aa  137  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2441  Na+/solute symporter  27.36 
 
 		 625 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  27.8 
 
 		 523 aa  135  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2033  Na+/solute symporter  27.24 
 
 		 625 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  26.53 
 
 		 551 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0565  Na+/solute symporter  26.43 
 
 		 594 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.426275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2288  Na+/solute symporter  27.36 
 
 		 593 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.77 
 
 		 565 aa  120  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  31.35 
 
 		 509 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  27.36 
 
 		 487 aa  111  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  24.28 
 
 		 529 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  30.14 
 
 		 551 aa  110  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  29.08 
 
 		 460 aa  106  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  24.01 
 
 		 597 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  30.19 
 
 		 557 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.79 
 
 		 522 aa  103  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  26.65 
 
 		 483 aa  103  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  29.95 
 
 		 557 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  26.3 
 
 		 520 aa  101  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.14 
 
 		 483 aa  101  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.9 
 
 		 520 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  28.05 
 
 		 498 aa  100  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  25.78 
 
 		 520 aa  100  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  27.65 
 
 		 520 aa  100  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.6 
 
 		 542 aa  100  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  26.7 
 
 		 509 aa  99.4  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  22.04 
 
 		 556 aa  99.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  26.44 
 
 		 530 aa  99  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.88 
 
 		 526 aa  97.4  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.57 
 
 		 484 aa  96.3  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2893  Na+/solute symporter  27.39 
 
 		 604 aa  95.5  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.61 
 
 		 522 aa  95.1  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1660  Na+/solute symporter  29.18 
 
 		 489 aa  95.1  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139174  normal  0.613212 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  27.86 
 
 		 483 aa  94.7  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  27.95 
 
 		 461 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  24.18 
 
 		 527 aa  94  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  24.56 
 
 		 474 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  23.95 
 
 		 476 aa  93.6  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  26.62 
 
 		 517 aa  92.4  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.52 
 
 		 567 aa  91.7  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.21 
 
 		 523 aa  91.3  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0672  Na+/solute symporter  25.95 
 
 		 633 aa  90.9  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  25.26 
 
 		 562 aa  90.5  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  28.05 
 
 		 461 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.06 
 
 		 533 aa  89.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  24.34 
 
 		 564 aa  90.1  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  23 
 
 		 472 aa  89.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  28.19 
 
 		 479 aa  89  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.85 
 
 		 522 aa  89  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  24.76 
 
 		 513 aa  87.8  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  23.97 
 
 		 571 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  23.97 
 
 		 571 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  23.97 
 
 		 571 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  23.97 
 
 		 571 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  23.7 
 
 		 571 aa  87  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.88 
 
 		 519 aa  87  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  23.84 
 
 		 562 aa  86.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  23.7 
 
 		 571 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  22.77 
 
 		 638 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  24.95 
 
 		 529 aa  86.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  26.5 
 
 		 484 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  26.48 
 
 		 598 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.56 
 
 		 520 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4604  sodium/proline symporter  27.54 
 
 		 520 aa  85.5  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  27.49 
 
 		 500 aa  84.7  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1860  sodium/proline symporter  28.36 
 
 		 496 aa  85.1  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0914218  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  25.79 
 
 		 498 aa  84.7  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.93 
 
 		 526 aa  84  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  24.94 
 
 		 474 aa  84  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  24.01 
 
 		 537 aa  84  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  23.61 
 
 		 561 aa  83.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  24.06 
 
 		 513 aa  83.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  25.59 
 
 		 482 aa  82.4  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  26.51 
 
 		 491 aa  82.4  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  24.37 
 
 		 544 aa  82.4  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0350  Na+/solute symporter  22.88 
 
 		 489 aa  81.6  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  23.17 
 
 		 475 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05510  SSS sodium solute transporter  24.68 
 
 		 536 aa  80.9  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>