More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1268 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  100 
 
 		 474 aa  947    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  44.26 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  38.41 
 
 		 476 aa  303  5.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  33.17 
 
 		 472 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  32.14 
 
 		 462 aa  199  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  33.97 
 
 		 463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  33.97 
 
 		 463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  33.25 
 
 		 459 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  33.25 
 
 		 459 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  29.71 
 
 		 461 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  33.73 
 
 		 459 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  33.01 
 
 		 459 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  32.23 
 
 		 459 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  30.26 
 
 		 483 aa  186  7e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  32.02 
 
 		 500 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  30.16 
 
 		 461 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  32.69 
 
 		 463 aa  180  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  30.34 
 
 		 479 aa  171  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  31.22 
 
 		 462 aa  169  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  31.19 
 
 		 508 aa  169  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  33.85 
 
 		 460 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  27.21 
 
 		 486 aa  163  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  29.79 
 
 		 475 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04330  Na+/proline symporter  30.82 
 
 		 497 aa  160  6e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.723621  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  30.12 
 
 		 460 aa  160  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  31.34 
 
 		 507 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  27.82 
 
 		 537 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  26.07 
 
 		 490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  28.22 
 
 		 464 aa  148  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  29.44 
 
 		 564 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.07 
 
 		 533 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3294  Na+/solute symporter  29.74 
 
 		 469 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  27.7 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  25.35 
 
 		 459 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  26.29 
 
 		 452 aa  134  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  27.53 
 
 		 562 aa  133  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0563  Na+/solute symporter  28.64 
 
 		 476 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.379209 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  26.45 
 
 		 518 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1298  Na+/solute symporter  27.39 
 
 		 472 aa  131  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.76 
 
 		 526 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  27.74 
 
 		 460 aa  130  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  27.5 
 
 		 476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  27.79 
 
 		 493 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.09 
 
 		 567 aa  127  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  27.55 
 
 		 483 aa  127  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  27.98 
 
 		 468 aa  127  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  27.27 
 
 		 482 aa  127  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  26.85 
 
 		 493 aa  126  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  27.78 
 
 		 482 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6434  Na+/solute symporter  25.37 
 
 		 473 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922487 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  28.34 
 
 		 498 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  25.51 
 
 		 488 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  27.78 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  25.59 
 
 		 466 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  24.8 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5962  Na+/solute symporter  27.33 
 
 		 472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  26.67 
 
 		 460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  28.06 
 
 		 461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  24.79 
 
 		 483 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  26.51 
 
 		 523 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.9 
 
 		 613 aa  121  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  25.46 
 
 		 530 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  26.51 
 
 		 497 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  25.05 
 
 		 483 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  27.02 
 
 		 485 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.84 
 
 		 550 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  25.95 
 
 		 484 aa  117  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  26.13 
 
 		 484 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  27.62 
 
 		 479 aa  116  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.48 
 
 		 593 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  27.01 
 
 		 592 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0688  Na+/solute symporter  27.64 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.217002  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  24.84 
 
 		 482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1533  Na+/solute symporter  27.09 
 
 		 472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  25.16 
 
 		 496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6296  Na+/solute symporter  27.09 
 
 		 472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957255  normal  0.770519 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6955  Na+/solute symporter  27.09 
 
 		 472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.269545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  26.43 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  23.57 
 
 		 513 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  28.25 
 
 		 551 aa  113  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  23.97 
 
 		 493 aa  113  6e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  26.44 
 
 		 515 aa  113  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  24.31 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  26.09 
 
 		 509 aa  111  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  25.56 
 
 		 492 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  25.89 
 
 		 479 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8130  Na+/solute symporter  28.5 
 
 		 474 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580887  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  24.95 
 
 		 483 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  25.78 
 
 		 449 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  24.95 
 
 		 483 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  24.2 
 
 		 486 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  24.95 
 
 		 483 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  27.71 
 
 		 478 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0688  Na+/solute symporter  27.07 
 
 		 464 aa  110  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.52 
 
 		 542 aa  110  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  24.62 
 
 		 483 aa  110  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  24.45 
 
 		 489 aa  110  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  27.29 
 
 		 492 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  23.92 
 
 		 569 aa  110  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  27.11 
 
 		 492 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>