More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5121 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  72.39 
 
 		 459 aa  651    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  100 
 
 		 462 aa  897    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  71.3 
 
 		 459 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  71.3 
 
 		 459 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  71.59 
 
 		 463 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  71.84 
 
 		 459 aa  618  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  71.15 
 
 		 463 aa  620  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  72.06 
 
 		 459 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  57.52 
 
 		 461 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  57.74 
 
 		 461 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  58.31 
 
 		 460 aa  478  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  53.86 
 
 		 463 aa  408  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  48.82 
 
 		 500 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  46.45 
 
 		 508 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  50.11 
 
 		 479 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  46.5 
 
 		 507 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04330  Na+/proline symporter  47.16 
 
 		 497 aa  355  6.999999999999999e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.723621  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  39.6 
 
 		 472 aa  350  3e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  39.05 
 
 		 483 aa  315  9e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  32.14 
 
 		 474 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  30.9 
 
 		 483 aa  200  5e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  29.41 
 
 		 483 aa  166  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  29.45 
 
 		 487 aa  156  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  26.93 
 
 		 476 aa  156  8e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  30.23 
 
 		 460 aa  152  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.82 
 
 		 484 aa  150  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  28.03 
 
 		 486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  29.66 
 
 		 479 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  28.48 
 
 		 460 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  27.07 
 
 		 506 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  26.67 
 
 		 452 aa  133  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  28 
 
 		 482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.73 
 
 		 526 aa  129  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  26.55 
 
 		 483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  26.55 
 
 		 482 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  27.51 
 
 		 462 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  28.25 
 
 		 486 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  28.29 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  28.44 
 
 		 495 aa  124  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  27.55 
 
 		 479 aa  123  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  27.58 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  26.33 
 
 		 500 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3294  Na+/solute symporter  30.24 
 
 		 469 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  30.1 
 
 		 446 aa  121  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1041  hypothetical protein  26.4 
 
 		 485 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.880803 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  26.79 
 
 		 479 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1298  Na+/solute symporter  29.92 
 
 		 472 aa  120  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  27.65 
 
 		 489 aa  120  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  26.64 
 
 		 478 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  26.8 
 
 		 551 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  25.76 
 
 		 492 aa  119  9e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  26.12 
 
 		 461 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  30.39 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  26.68 
 
 		 479 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0089  Na+/solute symporter  27.59 
 
 		 496 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000762337  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  27.35 
 
 		 478 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  27.11 
 
 		 475 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  26.42 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.68 
 
 		 533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  26.2 
 
 		 524 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  28.19 
 
 		 466 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  26.74 
 
 		 493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  25.58 
 
 		 515 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  24.11 
 
 		 537 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1038  hypothetical protein  25.92 
 
 		 487 aa  108  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  25.38 
 
 		 564 aa  107  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  25.53 
 
 		 464 aa  107  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  26.07 
 
 		 475 aa  106  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  22.98 
 
 		 638 aa  106  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  25.17 
 
 		 511 aa  105  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0449  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1126 aa  103  8e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.812136 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  29.12 
 
 		 484 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  25.92 
 
 		 597 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  26.17 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1569  hypothetical protein  25.95 
 
 		 468 aa  101  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1384  sodium:solute symporter family protein  27.13 
 
 		 588 aa  101  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  22.41 
 
 		 639 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  24.42 
 
 		 482 aa  99.8  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  25.15 
 
 		 498 aa  99.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  26.48 
 
 		 485 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  25.28 
 
 		 492 aa  99  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  25.4 
 
 		 492 aa  98.2  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  24.54 
 
 		 489 aa  98.2  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0327  hypothetical protein  24.81 
 
 		 489 aa  97.8  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  24.72 
 
 		 512 aa  97.8  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  24.72 
 
 		 512 aa  97.8  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.16 
 
 		 504 aa  97.1  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  26.42 
 
 		 460 aa  96.7  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  25.06 
 
 		 492 aa  96.3  9e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1391  Na+/solute symporter  26.57 
 
 		 488 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000394975 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  25.86 
 
 		 490 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0446  hypothetical protein  27.19 
 
 		 726 aa  94.7  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.722173 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  28.41 
 
 		 505 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  26.61 
 
 		 486 aa  94.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  28.41 
 
 		 505 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  26.91 
 
 		 497 aa  94.4  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  25.76 
 
 		 523 aa  94.4  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  26.31 
 
 		 510 aa  94  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1146  Na+/solute symporter  24.69 
 
 		 469 aa  94  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.497129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  26.86 
 
 		 518 aa  93.6  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>