More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0695 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  71.77 
 
 
515 aa  726    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  100 
 
 
492 aa  992    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  59.09 
 
 
479 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  60 
 
 
478 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  58.16 
 
 
479 aa  569  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  58.95 
 
 
478 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  58.68 
 
 
479 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  57.91 
 
 
471 aa  553  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  53.05 
 
 
486 aa  524  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  50.11 
 
 
482 aa  465  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  49.16 
 
 
483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  48.85 
 
 
482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  49.03 
 
 
479 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  49.58 
 
 
475 aa  428  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  45.53 
 
 
495 aa  410  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  37.89 
 
 
460 aa  325  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  38.06 
 
 
461 aa  324  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  34.77 
 
 
449 aa  268  2e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  32.71 
 
 
460 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  27.44 
 
 
472 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  27.19 
 
 
486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  27.53 
 
 
490 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  26.07 
 
 
483 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  28.12 
 
 
460 aa  116  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  26.33 
 
 
464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  25.96 
 
 
474 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  25.6 
 
 
479 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  27.9 
 
 
506 aa  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  25 
 
 
476 aa  103  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  25.17 
 
 
500 aa  103  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  26.42 
 
 
462 aa  103  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  26.89 
 
 
483 aa  101  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  26.29 
 
 
462 aa  99.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  25.1 
 
 
500 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  25.63 
 
 
459 aa  99  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  26.03 
 
 
507 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  25.94 
 
 
463 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  26.2 
 
 
463 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  26.3 
 
 
505 aa  96.7  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  26.3 
 
 
505 aa  96.7  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  25.42 
 
 
459 aa  96.7  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  25.42 
 
 
459 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  25.36 
 
 
452 aa  95.9  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  23.99 
 
 
527 aa  95.1  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  25.47 
 
 
505 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  25.53 
 
 
459 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  24.49 
 
 
461 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  25.16 
 
 
463 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  25 
 
 
459 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  24.69 
 
 
492 aa  88.6  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  26.85 
 
 
506 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.17 
 
 
523 aa  89  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  27.26 
 
 
506 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.72 
 
 
522 aa  88.2  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  26.07 
 
 
492 aa  87.8  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  24.49 
 
 
461 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  26.92 
 
 
460 aa  87.4  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  22.46 
 
 
524 aa  87.4  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4529  Na+/solute symporter  21.65 
 
 
525 aa  87  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  27.65 
 
 
557 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.74 
 
 
526 aa  84  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  25.5 
 
 
493 aa  84  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  25.48 
 
 
520 aa  83.2  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0093  Na+/solute symporter  25 
 
 
505 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.620511  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  24.12 
 
 
508 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  22.29 
 
 
466 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  27.21 
 
 
498 aa  81.3  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1131  sodium/proline symporter  26.37 
 
 
502 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276577  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  27.11 
 
 
557 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2580  sodium/proline symporter  26.37 
 
 
502 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0213742 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2627  sodium/proline symporter  26.21 
 
 
502 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1253  sodium/proline symporter  26.21 
 
 
502 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.325594 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01018  proline:sodium symporter  26.21 
 
 
502 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1135  sodium/proline symporter  26.21 
 
 
502 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0465761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2108  sodium/proline symporter  26.21 
 
 
502 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.275652  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.08 
 
 
522 aa  80.1  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2302  sodium/proline symporter  26.21 
 
 
502 aa  79.7  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1223  Na+/solute symporter  26.71 
 
 
562 aa  79.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.704891  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1525  Na+/solute symporter  25.6 
 
 
479 aa  79.7  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  25.54 
 
 
493 aa  79.7  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  25.15 
 
 
492 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  23.54 
 
 
529 aa  79  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  23.21 
 
 
468 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  26.13 
 
 
492 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  26.03 
 
 
483 aa  79  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  22.68 
 
 
489 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0089  Na+/solute symporter  25.12 
 
 
496 aa  78.2  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000762337  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  23.06 
 
 
551 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  24.45 
 
 
492 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.27 
 
 
489 aa  77  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0047  Na+/solute symporter  26.01 
 
 
508 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  23.9 
 
 
492 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1235  sodium/proline symporter  25.49 
 
 
502 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0211084  normal  0.60164 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1200  sodium/proline symporter  25.49 
 
 
502 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133838  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  24.65 
 
 
482 aa  75.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1220  sodium/proline symporter  25.49 
 
 
502 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1899  Na+/solute symporter  30.54 
 
 
763 aa  76.6  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0612  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.64 
 
 
503 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000214976  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1190  sodium/proline symporter  25.49 
 
 
502 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.969329  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  23.2 
 
 
497 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>