More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0436 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  82.28 
 
 		 479 aa  791    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  70.75 
 
 		 471 aa  676    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  100 
 
 		 478 aa  957    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  80.38 
 
 		 479 aa  753    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  95.61 
 
 		 478 aa  923    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  80.8 
 
 		 479 aa  781    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  58.87 
 
 		 515 aa  581  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  60 
 
 		 492 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  57.97 
 
 		 486 aa  541  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  53.28 
 
 		 482 aa  488  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  53.86 
 
 		 483 aa  486  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  53.35 
 
 		 482 aa  481  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  55.26 
 
 		 479 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  52.56 
 
 		 475 aa  443  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  47.64 
 
 		 495 aa  430  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  42 
 
 		 460 aa  349  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  39.21 
 
 		 461 aa  335  7.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  38.93 
 
 		 449 aa  290  3e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  33.73 
 
 		 460 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  27.45 
 
 		 472 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  25.75 
 
 		 483 aa  117  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  27.36 
 
 		 460 aa  117  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  28.33 
 
 		 462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  27.71 
 
 		 474 aa  110  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  28.21 
 
 		 459 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  28.21 
 
 		 459 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  25.74 
 
 		 461 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  26.64 
 
 		 462 aa  108  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  25.38 
 
 		 466 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  26.01 
 
 		 452 aa  103  8e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  27.97 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  24.13 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  27.16 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  26.04 
 
 		 476 aa  102  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  24.4 
 
 		 506 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  24.25 
 
 		 486 aa  101  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  25.78 
 
 		 463 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  25.33 
 
 		 500 aa  98.6  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  25.56 
 
 		 463 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  23.5 
 
 		 527 aa  98.2  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  23.96 
 
 		 483 aa  97.8  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  25.62 
 
 		 468 aa  96.7  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2635  sodium/solute transporter family urea transporter  29.36 
 
 		 476 aa  95.9  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.451328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  26.19 
 
 		 507 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50026  predicted protein  26.39 
 
 		 741 aa  94.7  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.301248  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  23.89 
 
 		 510 aa  94.4  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  22.5 
 
 		 524 aa  94.4  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  27.79 
 
 		 500 aa  94  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  26.38 
 
 		 459 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  25.78 
 
 		 479 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  25.86 
 
 		 484 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  24.29 
 
 		 490 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  25.25 
 
 		 487 aa  86.7  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0089  Na+/solute symporter  22.97 
 
 		 496 aa  86.7  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000762337  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  26.5 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  24.72 
 
 		 493 aa  84.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.3 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  25.26 
 
 		 492 aa  82  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  25.67 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.1 
 
 		 492 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  25.67 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  25.1 
 
 		 492 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  27.54 
 
 		 460 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  25.67 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  27.59 
 
 		 508 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  25.57 
 
 		 505 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  25.57 
 
 		 505 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  25.62 
 
 		 506 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  25.57 
 
 		 505 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  23.22 
 
 		 492 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  22.63 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0671  Na+/solute symporter  31.12 
 
 		 701 aa  80.9  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  22.78 
 
 		 529 aa  80.9  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  26.05 
 
 		 557 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  24.49 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  25.68 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  24.22 
 
 		 523 aa  80.5  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  23.81 
 
 		 492 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  25.57 
 
 		 506 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2263  sodium/solute transporter family urea transporter  26.62 
 
 		 474 aa  79.7  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  23.67 
 
 		 488 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1899  Na+/solute symporter  30.54 
 
 		 763 aa  79.7  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  23.13 
 
 		 520 aa  79  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  24.63 
 
 		 484 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  24.63 
 
 		 484 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  25.31 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  24.49 
 
 		 489 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  23.76 
 
 		 483 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  24.48 
 
 		 493 aa  79  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  24.63 
 
 		 484 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  23.43 
 
 		 492 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0093  Na+/solute symporter  25.69 
 
 		 505 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.620511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  22.92 
 
 		 492 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  23.61 
 
 		 483 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  22.97 
 
 		 492 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  22.92 
 
 		 493 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  22.92 
 
 		 493 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  22.56 
 
 		 475 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  25.36 
 
 		 492 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09750  sodium/proline symporter  28.08 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000003829  hitchhiker  0.000045945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>