More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0642 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0093  Na+/solute symporter  77.64 
 
 		 505 aa  704    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.620511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  99.8 
 
 		 505 aa  976    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  99.8 
 
 		 505 aa  976    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  76.91 
 
 		 507 aa  713    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  100 
 
 		 505 aa  977    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  29.22 
 
 		 460 aa  146  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  29.17 
 
 		 449 aa  139  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  29.84 
 
 		 482 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50026  predicted protein  36.71 
 
 		 741 aa  130  5.0000000000000004e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.301248  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  29.78 
 
 		 483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  28.54 
 
 		 482 aa  130  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  29.56 
 
 		 479 aa  129  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  27.22 
 
 		 500 aa  123  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  27.21 
 
 		 486 aa  117  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  26.22 
 
 		 515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  26.44 
 
 		 492 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  26.96 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  26.43 
 
 		 479 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  26.53 
 
 		 479 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.01 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  26.64 
 
 		 479 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  26.59 
 
 		 478 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.34 
 
 		 483 aa  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  26.27 
 
 		 495 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  26.24 
 
 		 478 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  25.48 
 
 		 508 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  26.46 
 
 		 475 aa  98.6  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  25.51 
 
 		 459 aa  99  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  26.52 
 
 		 463 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  26.12 
 
 		 463 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  28.41 
 
 		 462 aa  97.8  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  25.77 
 
 		 507 aa  96.7  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  24.04 
 
 		 472 aa  95.9  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04330  Na+/proline symporter  26.98 
 
 		 497 aa  94.4  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.723621  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  25.81 
 
 		 459 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  25.58 
 
 		 459 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  28.19 
 
 		 479 aa  91.3  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  28 
 
 		 461 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  25.28 
 
 		 471 aa  90.9  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  26.34 
 
 		 459 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  25.49 
 
 		 459 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6434  Na+/solute symporter  23.35 
 
 		 473 aa  90.1  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922487 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  25.71 
 
 		 474 aa  90.1  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  27.25 
 
 		 487 aa  89.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  23.15 
 
 		 506 aa  87.4  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  24.24 
 
 		 523 aa  87.8  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5962  Na+/solute symporter  25.85 
 
 		 472 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  26.52 
 
 		 486 aa  84.3  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1533  Na+/solute symporter  26.09 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  27.14 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6296  Na+/solute symporter  26.09 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957255  normal  0.770519 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  27.94 
 
 		 460 aa  84  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6955  Na+/solute symporter  26.09 
 
 		 472 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.269545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8130  Na+/solute symporter  25.8 
 
 		 474 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580887  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  24.34 
 
 		 569 aa  82.8  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  29.18 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.73 
 
 		 613 aa  82  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  22.92 
 
 		 476 aa  80.9  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  23.02 
 
 		 483 aa  79.7  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  23.98 
 
 		 500 aa  79  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0563  Na+/solute symporter  25.89 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.379209 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  25.47 
 
 		 485 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  22 
 
 		 530 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.01 
 
 		 593 aa  76.6  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  26.27 
 
 		 484 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  26.51 
 
 		 460 aa  74.3  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  24.47 
 
 		 464 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  26.24 
 
 		 564 aa  73.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  26.77 
 
 		 517 aa  73.6  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  25.84 
 
 		 498 aa  73.6  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1298  Na+/solute symporter  28.46 
 
 		 472 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  22.01 
 
 		 489 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  23.52 
 
 		 519 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  26.87 
 
 		 460 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  24.94 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  27.46 
 
 		 463 aa  71.2  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  24.47 
 
 		 565 aa  70.9  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  26.67 
 
 		 551 aa  70.9  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25 
 
 		 523 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  22.93 
 
 		 566 aa  70.5  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  22.81 
 
 		 541 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  22.62 
 
 		 515 aa  68.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3710  Na+/solute symporter  23.53 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  22.81 
 
 		 541 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  25.79 
 
 		 476 aa  68.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  22.87 
 
 		 563 aa  68.6  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4529  Na+/solute symporter  24.12 
 
 		 525 aa  68.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.81 
 
 		 541 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  24.17 
 
 		 524 aa  68.2  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.71 
 
 		 522 aa  67  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3294  Na+/solute symporter  25.86 
 
 		 469 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  26.2 
 
 		 463 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  25.9 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  24.89 
 
 		 492 aa  65.5  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  26.47 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  24.32 
 
 		 492 aa  65.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.46 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  22.67 
 
 		 537 aa  65.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  25.11 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  25.11 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>