More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1113 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 
529 aa  1045    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  38.25 
 
 
493 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  38.32 
 
 
493 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  38.32 
 
 
493 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  38.14 
 
 
492 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  38.22 
 
 
492 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  38.74 
 
 
492 aa  336  5e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  37.8 
 
 
492 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  37.75 
 
 
492 aa  336  7e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  37.6 
 
 
487 aa  333  6e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  37.82 
 
 
492 aa  332  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  37.55 
 
 
492 aa  330  3e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  37.74 
 
 
493 aa  322  7e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  38.24 
 
 
482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  38.1 
 
 
492 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  36.22 
 
 
492 aa  317  2e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  37.53 
 
 
489 aa  316  6e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  38.84 
 
 
497 aa  315  9e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  37.76 
 
 
492 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  37.53 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  37.78 
 
 
492 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  37.07 
 
 
492 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  37.37 
 
 
492 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  37.35 
 
 
492 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  37.37 
 
 
492 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  37.35 
 
 
492 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  37.35 
 
 
492 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  38.43 
 
 
489 aa  313  5.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  38.41 
 
 
491 aa  311  2e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  35.98 
 
 
493 aa  311  2e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  38.46 
 
 
485 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  40.14 
 
 
488 aa  309  8e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  37.45 
 
 
518 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  38.29 
 
 
496 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  40.14 
 
 
492 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  38.03 
 
 
498 aa  307  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  37.2 
 
 
484 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  36.73 
 
 
499 aa  300  5e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  37.5 
 
 
506 aa  300  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  37.4 
 
 
494 aa  299  8e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  37.4 
 
 
506 aa  299  9e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04170  sodium/proline symporter  38.36 
 
 
499 aa  296  6e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0302673 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  37.47 
 
 
496 aa  296  8e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  36.81 
 
 
494 aa  296  9e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3766  sodium/proline symporter  37.6 
 
 
499 aa  295  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  37.75 
 
 
498 aa  295  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  37.74 
 
 
495 aa  291  2e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  36.23 
 
 
498 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  36.79 
 
 
486 aa  286  9e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  36.16 
 
 
492 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  36.03 
 
 
495 aa  285  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  35.41 
 
 
492 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  37.53 
 
 
502 aa  284  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  36.36 
 
 
492 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  35.88 
 
 
492 aa  282  1e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2930  sodium/proline symporter  36.33 
 
 
494 aa  282  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0527151  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  36.64 
 
 
492 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2039  proline permease  36.35 
 
 
494 aa  281  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  36.57 
 
 
492 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2265  sodium/proline symporter  36.35 
 
 
494 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2367  sodium/proline symporter  36.35 
 
 
494 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0234397  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  36.9 
 
 
483 aa  280  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0817  proline permease  39.16 
 
 
498 aa  281  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  36.44 
 
 
492 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1229  sodium/proline symporter  37.47 
 
 
504 aa  280  5e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  36.18 
 
 
494 aa  280  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  35.94 
 
 
488 aa  278  2e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  35.56 
 
 
488 aa  277  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  36.77 
 
 
511 aa  276  5e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  34.71 
 
 
513 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2580  sodium/proline symporter  35.35 
 
 
502 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0213742 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1131  sodium/proline symporter  35.35 
 
 
502 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276577  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  35.48 
 
 
483 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  36.97 
 
 
482 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01018  proline:sodium symporter  35.35 
 
 
502 aa  274  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2108  sodium/proline symporter  35.35 
 
 
502 aa  274  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.275652  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1135  sodium/proline symporter  35.35 
 
 
502 aa  274  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0465761  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2627  sodium/proline symporter  35.35 
 
 
502 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1253  sodium/proline symporter  35.35 
 
 
502 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.325594 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  35.27 
 
 
483 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2302  sodium/proline symporter  35.35 
 
 
502 aa  272  9e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0491  sodium/proline symporter  36.36 
 
 
495 aa  272  1e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1235  sodium/proline symporter  35.34 
 
 
502 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0211084  normal  0.60164 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1220  sodium/proline symporter  35.34 
 
 
502 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1190  sodium/proline symporter  35.34 
 
 
502 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.969329  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1200  sodium/proline symporter  35.34 
 
 
502 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133838  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  33.61 
 
 
484 aa  270  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1085  sodium/proline symporter  35.14 
 
 
503 aa  270  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5016  proline permease  36.22 
 
 
495 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0507  Na+/solute symporter  36.02 
 
 
519 aa  267  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.550362  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  34.95 
 
 
512 aa  267  4e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  34.95 
 
 
512 aa  267  4e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  33.07 
 
 
493 aa  267  4e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  33.14 
 
 
511 aa  266  5e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  34.92 
 
 
486 aa  266  8e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  36.22 
 
 
499 aa  265  2e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1575  Sodium/proline symporter  34.95 
 
 
498 aa  264  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0675536  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1248  Sodium/proline symporter  37.04 
 
 
496 aa  263  4e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  36.69 
 
 
498 aa  262  1e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1731  sodium/proline symporter  38.52 
 
 
496 aa  261  2e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.253035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>