More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_54150 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01018  proline:sodium symporter  78.38 
 
 
502 aa  761    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2367  sodium/proline symporter  76.67 
 
 
494 aa  749    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0234397  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2265  sodium/proline symporter  76.67 
 
 
494 aa  749    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2627  sodium/proline symporter  78.38 
 
 
502 aa  761    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  83.1 
 
 
492 aa  808    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  82.69 
 
 
492 aa  800    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1190  sodium/proline symporter  77.17 
 
 
502 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.969329  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5016  proline permease  85.4 
 
 
495 aa  826    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2930  sodium/proline symporter  78.3 
 
 
494 aa  766    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0527151  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2580  sodium/proline symporter  78.38 
 
 
502 aa  761    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0213742 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  77.13 
 
 
494 aa  778    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0507  Na+/solute symporter  84.99 
 
 
519 aa  823    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.550362  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  76.77 
 
 
502 aa  769    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2039  proline permease  76.67 
 
 
494 aa  749    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  82.96 
 
 
494 aa  822    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  98.62 
 
 
506 aa  997    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2108  sodium/proline symporter  78.38 
 
 
502 aa  760    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.275652  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1085  sodium/proline symporter  76.97 
 
 
503 aa  748    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5942  sodium/proline symporter  70.33 
 
 
500 aa  666    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1131  sodium/proline symporter  78.38 
 
 
502 aa  761    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276577  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1235  sodium/proline symporter  77.17 
 
 
502 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0211084  normal  0.60164 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2302  sodium/proline symporter  78.18 
 
 
502 aa  759    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  80.86 
 
 
492 aa  794    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3408  sodium/proline symporter  68.88 
 
 
497 aa  637    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.704891  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1200  sodium/proline symporter  77.17 
 
 
502 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133838  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  82.89 
 
 
492 aa  807    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1220  sodium/proline symporter  77.17 
 
 
502 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  100 
 
 
506 aa  1007    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1135  sodium/proline symporter  78.38 
 
 
502 aa  761    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0465761  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3766  sodium/proline symporter  76.47 
 
 
499 aa  764    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  76.52 
 
 
499 aa  767    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  76.52 
 
 
494 aa  775    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4063  sodium/proline symporter  68.88 
 
 
497 aa  637    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1253  sodium/proline symporter  78.38 
 
 
502 aa  761    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.325594 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0273  sodium/proline symporter  63.47 
 
 
504 aa  623  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  57.53 
 
 
482 aa  559  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  57.61 
 
 
484 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  55.47 
 
 
493 aa  533  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  54.14 
 
 
492 aa  529  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  53.54 
 
 
492 aa  526  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  53.74 
 
 
492 aa  527  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  53.54 
 
 
492 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  55.99 
 
 
485 aa  525  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  52.64 
 
 
488 aa  525  1e-148  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  56.59 
 
 
483 aa  528  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  53.54 
 
 
492 aa  525  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  53.54 
 
 
492 aa  525  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  53.54 
 
 
492 aa  525  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  53.33 
 
 
492 aa  519  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  51.53 
 
 
487 aa  520  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  56.15 
 
 
488 aa  518  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  55.06 
 
 
483 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  54.77 
 
 
492 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  51.12 
 
 
492 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  51.12 
 
 
492 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  53.13 
 
 
492 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  51.32 
 
 
492 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  50.92 
 
 
492 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  56.22 
 
 
484 aa  514  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  50.6 
 
 
493 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  51.73 
 
 
492 aa  514  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  50.6 
 
 
493 aa  514  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  50.6 
 
 
493 aa  514  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  55.74 
 
 
483 aa  513  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  50.92 
 
 
492 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  51.12 
 
 
492 aa  511  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  54.71 
 
 
482 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  53.41 
 
 
493 aa  501  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  53.36 
 
 
488 aa  503  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  51.84 
 
 
489 aa  499  1e-140  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  52.7 
 
 
486 aa  499  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  55.21 
 
 
483 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  53.24 
 
 
486 aa  499  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  51.84 
 
 
489 aa  501  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  55.21 
 
 
483 aa  498  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  51.63 
 
 
489 aa  500  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  55.42 
 
 
483 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  54.11 
 
 
495 aa  496  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  55.42 
 
 
483 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  55.83 
 
 
497 aa  497  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  55.21 
 
 
483 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  55.42 
 
 
483 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  51.52 
 
 
493 aa  496  1e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  55.42 
 
 
483 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  52.67 
 
 
496 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  54.13 
 
 
483 aa  489  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  52.39 
 
 
499 aa  486  1e-136  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  53.94 
 
 
498 aa  487  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  52.74 
 
 
491 aa  488  1e-136  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1575  Sodium/proline symporter  54.34 
 
 
498 aa  481  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0675536  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  50.49 
 
 
511 aa  484  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  50.4 
 
 
513 aa  480  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2670  sodium/proline symporter  49.54 
 
 
541 aa  476  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  51.9 
 
 
492 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1576  Sodium/proline symporter  52.19 
 
 
499 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84214  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  51.1 
 
 
492 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  51.3 
 
 
492 aa  461  1e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  47.15 
 
 
492 aa  455  1.0000000000000001e-126  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  49.11 
 
 
512 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  49.11 
 
 
512 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>