More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1190 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01018  proline:sodium symporter  94.6 
 
 		 502 aa  935    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  82.15 
 
 		 494 aa  821    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2627  sodium/proline symporter  94.8 
 
 		 502 aa  936    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2930  sodium/proline symporter  82.35 
 
 		 494 aa  808    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0527151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2302  sodium/proline symporter  94.4 
 
 		 502 aa  933    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  75.36 
 
 		 492 aa  750    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2108  sodium/proline symporter  94.6 
 
 		 502 aa  934    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.275652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1190  sodium/proline symporter  100 
 
 		 502 aa  1004    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.969329  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5016  proline permease  72.82 
 
 		 495 aa  721    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1131  sodium/proline symporter  94.4 
 
 		 502 aa  933    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1135  sodium/proline symporter  94.6 
 
 		 502 aa  935    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0465761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0507  Na+/solute symporter  73.83 
 
 		 519 aa  726    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1200  sodium/proline symporter  100 
 
 		 502 aa  1004    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  75.56 
 
 		 492 aa  752    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2580  sodium/proline symporter  94.4 
 
 		 502 aa  933    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0213742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  76.02 
 
 		 494 aa  758    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3766  sodium/proline symporter  79.11 
 
 		 499 aa  806    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  76.97 
 
 		 506 aa  769    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  75.76 
 
 		 492 aa  749    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  75.76 
 
 		 492 aa  753    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2265  sodium/proline symporter  80.93 
 
 		 494 aa  797    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1235  sodium/proline symporter  100 
 
 		 502 aa  1004    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0211084  normal  0.60164 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  81.74 
 
 		 494 aa  819    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  92.43 
 
 		 502 aa  948    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2367  sodium/proline symporter  80.93 
 
 		 494 aa  797    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0234397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1253  sodium/proline symporter  94.4 
 
 		 502 aa  934    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.325594 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1220  sodium/proline symporter  100 
 
 		 502 aa  1004    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  77.17 
 
 		 506 aa  769    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1085  sodium/proline symporter  99.8 
 
 		 503 aa  1003    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  78.9 
 
 		 499 aa  803    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2039  proline permease  80.93 
 
 		 494 aa  797    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5942  sodium/proline symporter  66.53 
 
 		 500 aa  634  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3408  sodium/proline symporter  63.35 
 
 		 497 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.704891  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4063  sodium/proline symporter  63.35 
 
 		 497 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0273  sodium/proline symporter  60.24 
 
 		 504 aa  598  1e-170  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  57.23 
 
 		 482 aa  558  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  54.29 
 
 		 493 aa  529  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  55.05 
 
 		 484 aa  525  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  54.16 
 
 		 492 aa  524  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  54.16 
 
 		 492 aa  524  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  53.96 
 
 		 492 aa  523  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  54.16 
 
 		 492 aa  524  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  53.96 
 
 		 492 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  53.83 
 
 		 492 aa  521  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  54.05 
 
 		 492 aa  520  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  53.75 
 
 		 492 aa  521  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  53.83 
 
 		 492 aa  520  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  54.07 
 
 		 488 aa  512  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  51.03 
 
 		 488 aa  511  1e-144  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  53.24 
 
 		 483 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  53.41 
 
 		 483 aa  510  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  53.46 
 
 		 483 aa  511  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  49.9 
 
 		 492 aa  508  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  54.43 
 
 		 482 aa  508  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  53.73 
 
 		 485 aa  510  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  50.1 
 
 		 487 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  49.28 
 
 		 493 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  49.28 
 
 		 493 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  53.43 
 
 		 492 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  49.9 
 
 		 492 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  49.79 
 
 		 492 aa  502  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  49.28 
 
 		 493 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  49.69 
 
 		 492 aa  503  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  49.69 
 
 		 492 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  49.69 
 
 		 492 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  52.25 
 
 		 491 aa  504  1e-141  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  49.39 
 
 		 492 aa  502  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  51.65 
 
 		 489 aa  499  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  54.76 
 
 		 488 aa  500  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  51.23 
 
 		 489 aa  496  1e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  53.44 
 
 		 483 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  52.83 
 
 		 486 aa  498  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  51.23 
 
 		 489 aa  496  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  53.24 
 
 		 483 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  52.83 
 
 		 483 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  52.83 
 
 		 483 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  52.83 
 
 		 483 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  51.05 
 
 		 493 aa  490  1e-137  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  52.83 
 
 		 483 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  52.83 
 
 		 483 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  53.24 
 
 		 497 aa  489  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  51.81 
 
 		 483 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  54.35 
 
 		 484 aa  484  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  52.3 
 
 		 493 aa  480  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  53.13 
 
 		 495 aa  477  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  51.03 
 
 		 496 aa  478  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  50.82 
 
 		 486 aa  472  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  50.6 
 
 		 498 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  47.59 
 
 		 513 aa  470  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  49.31 
 
 		 511 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  49.4 
 
 		 499 aa  464  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2670  sodium/proline symporter  49.81 
 
 		 541 aa  463  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1575  Sodium/proline symporter  51.24 
 
 		 498 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0675536  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  50.62 
 
 		 518 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  50.21 
 
 		 497 aa  451  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1576  Sodium/proline symporter  49.4 
 
 		 499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  50.82 
 
 		 498 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  49.59 
 
 		 492 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  48.57 
 
 		 492 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  45.29 
 
 		 492 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>