More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2435 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  80.12 
 
 		 497 aa  774    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  80.75 
 
 		 483 aa  792    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  85.51 
 
 		 488 aa  847    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  80.75 
 
 		 483 aa  792    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  83.44 
 
 		 483 aa  830    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  75.78 
 
 		 483 aa  758    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  80.75 
 
 		 483 aa  792    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  80.75 
 
 		 483 aa  793    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  82.61 
 
 		 483 aa  801    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  82.61 
 
 		 483 aa  800    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  79.3 
 
 		 486 aa  787    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  100 
 
 		 483 aa  956    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  85.92 
 
 		 483 aa  851    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  82.19 
 
 		 483 aa  798    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  78.67 
 
 		 482 aa  769    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  56.96 
 
 		 482 aa  550  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  55.03 
 
 		 493 aa  539  9.999999999999999e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  54.64 
 
 		 492 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  54.02 
 
 		 492 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  54.43 
 
 		 492 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  55.06 
 
 		 506 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  53.94 
 
 		 492 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  55.06 
 
 		 506 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5016  proline permease  54.66 
 
 		 495 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0507  Na+/solute symporter  55.26 
 
 		 519 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  54 
 
 		 494 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  57.05 
 
 		 484 aa  510  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  51.02 
 
 		 492 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  52.15 
 
 		 494 aa  502  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  53.28 
 
 		 499 aa  504  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2039  proline permease  52.63 
 
 		 494 aa  498  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  50 
 
 		 492 aa  498  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  50.82 
 
 		 492 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  50 
 
 		 493 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  50.61 
 
 		 492 aa  498  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  50 
 
 		 493 aa  499  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  50.61 
 
 		 492 aa  498  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  50 
 
 		 493 aa  499  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2930  sodium/proline symporter  53.78 
 
 		 494 aa  498  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0527151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  50.82 
 
 		 492 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  50 
 
 		 492 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  52.23 
 
 		 502 aa  501  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2367  sodium/proline symporter  52.63 
 
 		 494 aa  498  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0234397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  49.59 
 
 		 492 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  50.92 
 
 		 492 aa  500  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  50.61 
 
 		 492 aa  498  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2265  sodium/proline symporter  52.63 
 
 		 494 aa  498  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  50.82 
 
 		 492 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  50 
 
 		 492 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  51.53 
 
 		 491 aa  499  1e-140  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  52.69 
 
 		 484 aa  497  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1235  sodium/proline symporter  53.24 
 
 		 502 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0211084  normal  0.60164 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  53.46 
 
 		 485 aa  498  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  50.52 
 
 		 487 aa  497  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1085  sodium/proline symporter  53.24 
 
 		 503 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  51.94 
 
 		 494 aa  498  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  49.39 
 
 		 492 aa  496  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1220  sodium/proline symporter  53.24 
 
 		 502 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1190  sodium/proline symporter  53.24 
 
 		 502 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.969329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  50.61 
 
 		 492 aa  498  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1200  sodium/proline symporter  53.24 
 
 		 502 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133838  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2627  sodium/proline symporter  52.43 
 
 		 502 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  50.2 
 
 		 492 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1131  sodium/proline symporter  52.23 
 
 		 502 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276577  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  51.64 
 
 		 488 aa  494  9.999999999999999e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  52.57 
 
 		 518 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3766  sodium/proline symporter  52.57 
 
 		 499 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2580  sodium/proline symporter  52.23 
 
 		 502 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0213742 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01018  proline:sodium symporter  52.23 
 
 		 502 aa  491  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2302  sodium/proline symporter  52.23 
 
 		 502 aa  490  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1135  sodium/proline symporter  52.23 
 
 		 502 aa  491  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0465761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2108  sodium/proline symporter  52.23 
 
 		 502 aa  490  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.275652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  48.98 
 
 		 492 aa  488  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1253  sodium/proline symporter  52.23 
 
 		 502 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.325594 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  50.71 
 
 		 493 aa  486  1e-136  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  52.77 
 
 		 497 aa  486  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  54.85 
 
 		 498 aa  486  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  50.41 
 
 		 492 aa  487  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  51.77 
 
 		 496 aa  484  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  51.12 
 
 		 489 aa  480  1e-134  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  49.9 
 
 		 493 aa  478  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  50.51 
 
 		 489 aa  478  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5942  sodium/proline symporter  53.31 
 
 		 500 aa  480  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  52.97 
 
 		 498 aa  480  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  50.1 
 
 		 488 aa  481  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  50.72 
 
 		 489 aa  479  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  53.18 
 
 		 495 aa  474  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  51.73 
 
 		 499 aa  472  1e-132  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3408  sodium/proline symporter  54.86 
 
 		 497 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.704891  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4063  sodium/proline symporter  54.86 
 
 		 497 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  50.71 
 
 		 511 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0273  sodium/proline symporter  51.02 
 
 		 504 aa  464  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  50.3 
 
 		 498 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1576  Sodium/proline symporter  51.73 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  50 
 
 		 513 aa  456  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  48.97 
 
 		 492 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  48.97 
 
 		 492 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0817  proline permease  52.77 
 
 		 498 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  48.55 
 
 		 492 aa  450  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  48.42 
 
 		 486 aa  451  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>