More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1072 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  100 
 
 		 527 aa  1043    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  62.23 
 
 		 500 aa  649    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  63.31 
 
 		 524 aa  659    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  58.55 
 
 		 510 aa  590  1e-167  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  28.49 
 
 		 497 aa  153  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  28.88 
 
 		 498 aa  150  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  27.2 
 
 		 518 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  29.38 
 
 		 493 aa  143  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  27.64 
 
 		 483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  28.66 
 
 		 498 aa  140  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  27.42 
 
 		 482 aa  140  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1943  Na+/solute symporter  28.7 
 
 		 526 aa  139  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  27.97 
 
 		 496 aa  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  28.1 
 
 		 483 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  28.63 
 
 		 483 aa  137  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  27.33 
 
 		 488 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  27.48 
 
 		 513 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  28.04 
 
 		 483 aa  134  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  27.57 
 
 		 484 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  27.33 
 
 		 485 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  27.74 
 
 		 483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  26.95 
 
 		 492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  26.97 
 
 		 492 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  27.42 
 
 		 499 aa  127  7e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  26.91 
 
 		 492 aa  127  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0817  proline permease  27.29 
 
 		 498 aa  126  9e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  27.07 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  27.07 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  27.02 
 
 		 492 aa  126  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  27.07 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  27.07 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  27.07 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  27.07 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  27.07 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  27.07 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  27.89 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  27.89 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  27.89 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  27.89 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  28.93 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  27.79 
 
 		 498 aa  124  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  28.25 
 
 		 483 aa  125  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  28.93 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  26.65 
 
 		 492 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  26.65 
 
 		 492 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  26.65 
 
 		 492 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  26.45 
 
 		 492 aa  124  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.45 
 
 		 492 aa  124  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  28.51 
 
 		 486 aa  124  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  27.12 
 
 		 497 aa  123  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  25.84 
 
 		 482 aa  123  8e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  26.62 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  26.62 
 
 		 483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  24.8 
 
 		 508 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  26.4 
 
 		 483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  27.29 
 
 		 492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  26.62 
 
 		 483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  25.41 
 
 		 492 aa  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  25.73 
 
 		 492 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  26.4 
 
 		 483 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1575  Sodium/proline symporter  28.83 
 
 		 498 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0675536  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  26.73 
 
 		 484 aa  120  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  25.28 
 
 		 492 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1576  Sodium/proline symporter  27.61 
 
 		 499 aa  120  7.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  25.06 
 
 		 492 aa  119  9e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  26.82 
 
 		 492 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4622  acetate permease  23.83 
 
 		 549 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  28.26 
 
 		 492 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  23.83 
 
 		 549 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4529  acetate permease  23.83 
 
 		 549 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  23.83 
 
 		 549 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  26.23 
 
 		 482 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  23.83 
 
 		 549 aa  118  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03939  acetate permease  23.83 
 
 		 549 aa  118  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.68156  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  23.83 
 
 		 549 aa  118  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  28.29 
 
 		 499 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  27.11 
 
 		 481 aa  117  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5016  proline permease  29.47 
 
 		 495 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  26.29 
 
 		 488 aa  117  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3925  cation/acetate symporter ActP  23.61 
 
 		 549 aa  117  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  25.98 
 
 		 492 aa  117  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  26.34 
 
 		 487 aa  117  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  24.44 
 
 		 492 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  24.89 
 
 		 494 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  25.92 
 
 		 496 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0567  sodium/panthothenate symporter  25.94 
 
 		 480 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.868181  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  25.36 
 
 		 483 aa  116  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4586  acetate permease  23.39 
 
 		 549 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  27.42 
 
 		 506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  24.04 
 
 		 492 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  24.44 
 
 		 492 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0507  Na+/solute symporter  29.07 
 
 		 519 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  28.29 
 
 		 493 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  26.01 
 
 		 486 aa  115  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  26.96 
 
 		 492 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  23.85 
 
 		 493 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  23.79 
 
 		 493 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  23.79 
 
 		 493 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  23.69 
 
 		 492 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4533  acetate permease  24.67 
 
 		 549 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.612121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>