More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0122 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  100 
 
 		 449 aa  860    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  42.14 
 
 		 461 aa  347  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  41.18 
 
 		 460 aa  336  5e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  39.49 
 
 		 478 aa  296  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  37.72 
 
 		 479 aa  293  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  38.93 
 
 		 478 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  38.5 
 
 		 482 aa  289  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  38.07 
 
 		 471 aa  289  6e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  39.11 
 
 		 483 aa  288  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  36.64 
 
 		 479 aa  286  5e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  38.88 
 
 		 482 aa  286  7e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  36.78 
 
 		 486 aa  280  4e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  38.72 
 
 		 479 aa  275  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  35.13 
 
 		 495 aa  274  2.0000000000000002e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  36.49 
 
 		 479 aa  272  7e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  36.83 
 
 		 515 aa  270  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  34.77 
 
 		 492 aa  268  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  35.33 
 
 		 475 aa  251  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  32.24 
 
 		 460 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  29.75 
 
 		 507 aa  140  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  27.41 
 
 		 472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.71 
 
 		 483 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  28.19 
 
 		 459 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  29.17 
 
 		 505 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  29.17 
 
 		 505 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  29.17 
 
 		 505 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  27.22 
 
 		 510 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  26.68 
 
 		 459 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  26.68 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  26.25 
 
 		 459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  26.83 
 
 		 476 aa  111  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  25.78 
 
 		 474 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  24.94 
 
 		 463 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  24.94 
 
 		 463 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  25 
 
 		 459 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  27.58 
 
 		 462 aa  107  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  25.46 
 
 		 483 aa  106  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.85 
 
 		 492 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  30.68 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  26.33 
 
 		 493 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  26.33 
 
 		 493 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  26.33 
 
 		 493 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  26.33 
 
 		 492 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0093  Na+/solute symporter  28.01 
 
 		 505 aa  104  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.620511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  27.36 
 
 		 462 aa  104  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  26.33 
 
 		 492 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  27.18 
 
 		 492 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  25.26 
 
 		 492 aa  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  26.02 
 
 		 492 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  25.85 
 
 		 492 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  25.85 
 
 		 492 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  25.85 
 
 		 492 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  24 
 
 		 461 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  26.38 
 
 		 487 aa  103  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  25.85 
 
 		 492 aa  103  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  26.11 
 
 		 492 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  25.64 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  26.11 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  26.99 
 
 		 495 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.64 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  26.58 
 
 		 511 aa  102  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0769  Na+/solute symporter  26.86 
 
 		 487 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00939685 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  25.79 
 
 		 492 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  27.95 
 
 		 496 aa  100  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  25.31 
 
 		 511 aa  99.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  23.37 
 
 		 461 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  27.5 
 
 		 483 aa  99.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  25 
 
 		 492 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  26.04 
 
 		 488 aa  97.8  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  25.2 
 
 		 493 aa  96.7  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  26.73 
 
 		 485 aa  96.7  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  24.94 
 
 		 492 aa  94.7  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  27.07 
 
 		 518 aa  94.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4529  Na+/solute symporter  27.13 
 
 		 525 aa  94  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  25.26 
 
 		 524 aa  94  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  23.65 
 
 		 490 aa  93.6  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1533  Na+/solute symporter  25.06 
 
 		 472 aa  93.2  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6296  Na+/solute symporter  25.06 
 
 		 472 aa  93.2  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957255  normal  0.770519 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  26.26 
 
 		 488 aa  92.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  25.64 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  25.84 
 
 		 476 aa  92.8  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6955  Na+/solute symporter  25.06 
 
 		 472 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.269545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1444  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1170 aa  92.8  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  26.13 
 
 		 483 aa  92.4  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  25.38 
 
 		 492 aa  92  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  25.97 
 
 		 464 aa  92  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  26.36 
 
 		 479 aa  92.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  26.09 
 
 		 506 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  25.88 
 
 		 506 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  25.72 
 
 		 498 aa  92  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  24.55 
 
 		 484 aa  90.9  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  26.74 
 
 		 483 aa  91.3  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  26.86 
 
 		 479 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  23.67 
 
 		 487 aa  90.5  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  24.68 
 
 		 460 aa  90.1  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.9 
 
 		 548 aa  90.1  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  26.08 
 
 		 512 aa  89.7  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  26.08 
 
 		 512 aa  89.7  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  24.84 
 
 		 484 aa  89.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5962  Na+/solute symporter  24.12 
 
 		 472 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>