More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0815 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0093  Na+/solute symporter  88.05 
 
 
505 aa  815    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.620511  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  75.45 
 
 
505 aa  718    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  75.45 
 
 
505 aa  717    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  75.45 
 
 
505 aa  717    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  100 
 
 
507 aa  996    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  29.93 
 
 
449 aa  147  6e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  28.63 
 
 
482 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  28.41 
 
 
460 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50026  predicted protein  38.95 
 
 
741 aa  135  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.301248  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  27.78 
 
 
483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  27.56 
 
 
482 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  27.92 
 
 
479 aa  127  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  26.59 
 
 
515 aa  121  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  27.65 
 
 
486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  27.01 
 
 
479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  26.53 
 
 
492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  26.55 
 
 
479 aa  111  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  27.92 
 
 
479 aa  110  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  24.94 
 
 
461 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  27.02 
 
 
478 aa  107  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  26.2 
 
 
507 aa  106  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  24.03 
 
 
472 aa  105  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  24.14 
 
 
500 aa  104  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  23.89 
 
 
463 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  26.28 
 
 
478 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  26.82 
 
 
475 aa  103  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  23.89 
 
 
463 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  25.42 
 
 
459 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  25.63 
 
 
508 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.32 
 
 
483 aa  99  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  25.42 
 
 
459 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.33 
 
 
526 aa  97.4  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  29.53 
 
 
460 aa  95.9  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  25.06 
 
 
474 aa  94.4  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  26.13 
 
 
471 aa  93.2  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  26.22 
 
 
461 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  27.6 
 
 
462 aa  92.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  25.68 
 
 
459 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  27.82 
 
 
551 aa  90.9  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.14 
 
 
593 aa  89.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.38 
 
 
613 aa  89.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  26.04 
 
 
459 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  24.35 
 
 
495 aa  89.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6434  Na+/solute symporter  23.75 
 
 
473 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00922487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  24.53 
 
 
523 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  23.33 
 
 
506 aa  87.8  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  24.42 
 
 
459 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  26.68 
 
 
479 aa  86.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  24.63 
 
 
461 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  24.94 
 
 
498 aa  85.9  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  25.45 
 
 
486 aa  85.1  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.59 
 
 
523 aa  84  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  23.48 
 
 
500 aa  83.6  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  25.42 
 
 
487 aa  82.4  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  23.26 
 
 
483 aa  82  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04330  Na+/proline symporter  26.61 
 
 
497 aa  80.1  0.00000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.723621  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  24.31 
 
 
569 aa  79.7  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  25.54 
 
 
492 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  27.15 
 
 
492 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  25.74 
 
 
492 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25 
 
 
519 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.16 
 
 
526 aa  78.2  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  25.09 
 
 
492 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  26.8 
 
 
517 aa  77.4  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  24.56 
 
 
463 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  22.93 
 
 
483 aa  76.6  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1396  Na+/proline symporter  25.45 
 
 
553 aa  76.3  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  25.27 
 
 
566 aa  76.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25 
 
 
492 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.77 
 
 
492 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  25 
 
 
492 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0563  Na+/solute symporter  25 
 
 
476 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.379209 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  24.25 
 
 
509 aa  75.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.73 
 
 
522 aa  75.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  27.52 
 
 
562 aa  75.1  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  25.05 
 
 
492 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  26.18 
 
 
492 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  26.16 
 
 
484 aa  74.3  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  26.18 
 
 
492 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  26.18 
 
 
492 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  25.89 
 
 
460 aa  74.3  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  25.7 
 
 
565 aa  73.9  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  26.04 
 
 
460 aa  73.6  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  23.68 
 
 
554 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  23.68 
 
 
554 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  24.29 
 
 
466 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  24.06 
 
 
551 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  27.38 
 
 
446 aa  73.2  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  25.22 
 
 
519 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1533  Na+/solute symporter  25.28 
 
 
472 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6955  Na+/solute symporter  25.28 
 
 
472 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.269545  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6296  Na+/solute symporter  25.28 
 
 
472 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957255  normal  0.770519 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  25.34 
 
 
492 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  23.46 
 
 
554 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  27.6 
 
 
492 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  22.77 
 
 
489 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  24 
 
 
463 aa  71.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  22.91 
 
 
537 aa  71.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  22.7 
 
 
530 aa  71.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  23.84 
 
 
551 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>