More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6434 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6434  Na+/solute symporter  100 
 
 		 473 aa  940    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922487 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3539  Na+/solute symporter  59.57 
 
 		 471 aa  593  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0326627  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3710  Na+/solute symporter  59.79 
 
 		 471 aa  588  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0645  Na+/solute symporter  60 
 
 		 472 aa  587  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.646028  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0688  Na+/solute symporter  58 
 
 		 471 aa  580  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.217002  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8130  Na+/solute symporter  62.25 
 
 		 474 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580887  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1533  Na+/solute symporter  57.69 
 
 		 472 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5962  Na+/solute symporter  57.26 
 
 		 472 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6296  Na+/solute symporter  57.69 
 
 		 472 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957255  normal  0.770519 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6955  Na+/solute symporter  57.48 
 
 		 472 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.269545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0563  Na+/solute symporter  57.69 
 
 		 476 aa  554  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.379209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1298  Na+/solute symporter  36.36 
 
 		 472 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3294  Na+/solute symporter  36.73 
 
 		 469 aa  312  9e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  36.74 
 
 		 463 aa  310  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  25.37 
 
 		 474 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  26.01 
 
 		 475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  23.38 
 
 		 472 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  24.12 
 
 		 466 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  25.7 
 
 		 459 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  23.4 
 
 		 461 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  24.65 
 
 		 459 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  24.65 
 
 		 459 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  24.65 
 
 		 459 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  24.94 
 
 		 459 aa  97.1  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.93 
 
 		 522 aa  94.4  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  25.7 
 
 		 483 aa  92  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0688  Na+/solute symporter  28.16 
 
 		 464 aa  91.3  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  22.52 
 
 		 476 aa  90.5  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  23.65 
 
 		 462 aa  90.1  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  24.79 
 
 		 462 aa  89  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  25.45 
 
 		 463 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  23.68 
 
 		 461 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  25.45 
 
 		 463 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  23.04 
 
 		 505 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  23.04 
 
 		 505 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1337  Na+/solute symporter  23.95 
 
 		 461 aa  87.8  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.833142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  23.04 
 
 		 505 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  23.27 
 
 		 507 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  25.55 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  25.78 
 
 		 486 aa  84  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  24.16 
 
 		 507 aa  84  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.03 
 
 		 523 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  22.66 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.61 
 
 		 522 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  23.44 
 
 		 508 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  24.87 
 
 		 530 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  23.1 
 
 		 500 aa  81.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.29 
 
 		 519 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.51 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  23.23 
 
 		 520 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1444  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1170 aa  77  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  23.57 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0093  Na+/solute symporter  24.1 
 
 		 505 aa  77  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.620511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  24.28 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  23.39 
 
 		 479 aa  76.6  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0089  Na+/solute symporter  24.94 
 
 		 496 aa  75.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000762337  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  23.45 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.18 
 
 		 533 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  26.08 
 
 		 506 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  22.71 
 
 		 520 aa  72.4  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  26.76 
 
 		 490 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  24.38 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  23.46 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1898  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.57 
 
 		 514 aa  70.1  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  23.15 
 
 		 592 aa  70.5  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  21.26 
 
 		 520 aa  70.5  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  20.17 
 
 		 523 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.85 
 
 		 520 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  21.69 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.21 
 
 		 565 aa  68.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  27.68 
 
 		 523 aa  67.8  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  20.44 
 
 		 476 aa  67.8  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.71 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  24.09 
 
 		 482 aa  66.6  0.0000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  22.1 
 
 		 487 aa  66.6  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.7 
 
 		 526 aa  66.6  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  22.59 
 
 		 509 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  20.67 
 
 		 483 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50026  predicted protein  28.4 
 
 		 741 aa  66.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.301248  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  21.73 
 
 		 556 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  26.85 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.28 
 
 		 522 aa  64.3  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  21.25 
 
 		 551 aa  64.3  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  29.19 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  29.19 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0449  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1126 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.812136 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  23.43 
 
 		 489 aa  62  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  22.22 
 
 		 468 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  29.74 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.2 
 
 		 526 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  23.01 
 
 		 489 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  23.1 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  23.85 
 
 		 486 aa  60.5  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.54 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  23.57 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  22.65 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  22.18 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  23.34 
 
 		 484 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  22.64 
 
 		 485 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  24.32 
 
 		 581 aa  59.7  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>