More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8130 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8130  Na+/solute symporter  100 
 
 		 474 aa  937    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580887  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0645  Na+/solute symporter  60.98 
 
 		 472 aa  596  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.646028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3710  Na+/solute symporter  62.39 
 
 		 471 aa  592  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3539  Na+/solute symporter  62.61 
 
 		 471 aa  594  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0326627  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6434  Na+/solute symporter  62.25 
 
 		 473 aa  587  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922487 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0688  Na+/solute symporter  60.21 
 
 		 471 aa  587  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.217002  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0563  Na+/solute symporter  62.16 
 
 		 476 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.379209 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1533  Na+/solute symporter  60.59 
 
 		 472 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6296  Na+/solute symporter  60.59 
 
 		 472 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957255  normal  0.770519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5962  Na+/solute symporter  59.75 
 
 		 472 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6955  Na+/solute symporter  60.38 
 
 		 472 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.269545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3294  Na+/solute symporter  36.96 
 
 		 469 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1298  Na+/solute symporter  36.01 
 
 		 472 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  36.93 
 
 		 463 aa  300  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  27.15 
 
 		 472 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  28.5 
 
 		 474 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  24.93 
 
 		 461 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  26.6 
 
 		 475 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  27.43 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  25.21 
 
 		 461 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.25 
 
 		 533 aa  106  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0688  Na+/solute symporter  29.88 
 
 		 464 aa  99.8  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  25.86 
 
 		 459 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  24.71 
 
 		 459 aa  95.1  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  23.16 
 
 		 476 aa  91.3  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1337  Na+/solute symporter  25.43 
 
 		 461 aa  90.9  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.833142  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  23.18 
 
 		 459 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  23.18 
 
 		 459 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  23.12 
 
 		 459 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  26.36 
 
 		 483 aa  88.2  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  23.18 
 
 		 459 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  24.75 
 
 		 462 aa  87.8  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  23.73 
 
 		 523 aa  87  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  24.61 
 
 		 462 aa  86.7  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  26.05 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.65 
 
 		 522 aa  84  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  27.78 
 
 		 505 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  24.48 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  27.78 
 
 		 505 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  27.78 
 
 		 505 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  22.84 
 
 		 460 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  22.76 
 
 		 483 aa  82.4  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  25.24 
 
 		 506 aa  81.3  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  24.63 
 
 		 476 aa  80.9  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  25.89 
 
 		 592 aa  80.9  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  23.06 
 
 		 452 aa  80.5  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  24.24 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  24.24 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  25.36 
 
 		 492 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.73 
 
 		 519 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.73 
 
 		 522 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.32 
 
 		 520 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  24.06 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  24.65 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.65 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  24.3 
 
 		 508 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  24.05 
 
 		 520 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  24.65 
 
 		 492 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  24.42 
 
 		 492 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.42 
 
 		 492 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  24.42 
 
 		 492 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  24.42 
 
 		 492 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.98 
 
 		 523 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  24.42 
 
 		 492 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  24.19 
 
 		 492 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  23.4 
 
 		 479 aa  75.1  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  22.77 
 
 		 551 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  24.48 
 
 		 484 aa  73.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  24.56 
 
 		 507 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  21.97 
 
 		 509 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  22.01 
 
 		 530 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  23.74 
 
 		 485 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.12 
 
 		 520 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  23.56 
 
 		 460 aa  70.9  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  24.3 
 
 		 488 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  22.34 
 
 		 500 aa  70.1  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  25.28 
 
 		 490 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  21.65 
 
 		 487 aa  69.3  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  26.39 
 
 		 507 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1444  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1170 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  22.59 
 
 		 520 aa  68.2  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  26.33 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  23.61 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  22.69 
 
 		 468 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  25.42 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  21.59 
 
 		 520 aa  64.7  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.6 
 
 		 484 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.48 
 
 		 565 aa  63.9  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1898  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.16 
 
 		 514 aa  63.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  21.65 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  21.98 
 
 		 482 aa  63.5  0.000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  20.82 
 
 		 581 aa  63.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  26.69 
 
 		 486 aa  62.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  23.35 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  22.45 
 
 		 460 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0274  acetate permease  22.31 
 
 		 549 aa  62.4  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0721182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  22.56 
 
 		 551 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0034  Na+/solute symporter  26.43 
 
 		 543 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.404882  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  22.31 
 
 		 551 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.43 
 
 		 522 aa  61.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>