294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1337 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1337  Na+/solute symporter  100 
 
 		 461 aa  883    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.833142  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  40.98 
 
 		 459 aa  300  5e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0688  Na+/solute symporter  42.08 
 
 		 464 aa  300  5e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  37.42 
 
 		 466 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  29.61 
 
 		 475 aa  131  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  28.5 
 
 		 474 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0563  Na+/solute symporter  28.53 
 
 		 476 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.379209 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5962  Na+/solute symporter  28.12 
 
 		 472 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1533  Na+/solute symporter  29.38 
 
 		 472 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6296  Na+/solute symporter  29.38 
 
 		 472 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957255  normal  0.770519 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6955  Na+/solute symporter  29.38 
 
 		 472 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.269545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3539  Na+/solute symporter  25 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0326627  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0645  Na+/solute symporter  25 
 
 		 472 aa  113  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.646028  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0688  Na+/solute symporter  25 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.217002  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3710  Na+/solute symporter  24.37 
 
 		 471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  25.78 
 
 		 472 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6434  Na+/solute symporter  24.54 
 
 		 473 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  26.43 
 
 		 463 aa  107  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  27.49 
 
 		 460 aa  100  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3294  Na+/solute symporter  27.56 
 
 		 469 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8130  Na+/solute symporter  25.43 
 
 		 474 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580887  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1298  Na+/solute symporter  26.85 
 
 		 472 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  27.32 
 
 		 459 aa  92  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  24.21 
 
 		 483 aa  91.3  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  25.16 
 
 		 476 aa  89  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  30.9 
 
 		 446 aa  88.6  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  27.16 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.42 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  25.88 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  26.92 
 
 		 461 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  26.97 
 
 		 462 aa  83.6  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  25.37 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  23.16 
 
 		 461 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  26.68 
 
 		 461 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  24.67 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  26.02 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  26.02 
 
 		 459 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  24.73 
 
 		 463 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  26.44 
 
 		 460 aa  79  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  23.38 
 
 		 490 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.82 
 
 		 484 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  29.7 
 
 		 479 aa  75.5  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  27.88 
 
 		 463 aa  74.7  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  23.91 
 
 		 551 aa  73.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  22 
 
 		 486 aa  70.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  26.25 
 
 		 500 aa  70.5  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.38 
 
 		 565 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  25.66 
 
 		 487 aa  69.3  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  24.84 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1569  hypothetical protein  22.63 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  23.74 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.22 
 
 		 526 aa  67  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0154  Na+/solute symporter  25.06 
 
 		 531 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.535073  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  24.72 
 
 		 557 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  23.04 
 
 		 529 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  25.08 
 
 		 508 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  23.19 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  25.33 
 
 		 557 aa  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0028  Na+/solute symporter  23.79 
 
 		 530 aa  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00419856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  25.56 
 
 		 468 aa  63.9  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  23.16 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  24.78 
 
 		 598 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  24.21 
 
 		 551 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1391  Na+/solute symporter  28.96 
 
 		 488 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000394975 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0089  Na+/solute symporter  25.96 
 
 		 496 aa  61.6  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000762337  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  25.31 
 
 		 544 aa  60.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  22.77 
 
 		 500 aa  61.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  25.34 
 
 		 506 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  21.41 
 
 		 516 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  21.41 
 
 		 516 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  21.41 
 
 		 516 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  21.41 
 
 		 516 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  21.41 
 
 		 516 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.39 
 
 		 516 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.75 
 
 		 567 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  21.41 
 
 		 516 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1146  Na+/solute symporter  22.79 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.497129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  21.14 
 
 		 516 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  21.14 
 
 		 516 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  25.11 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  22.45 
 
 		 520 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  23.57 
 
 		 495 aa  57.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  20.56 
 
 		 526 aa  57.4  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.19 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.64 
 
 		 519 aa  57.4  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  23.89 
 
 		 537 aa  57.4  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  24.34 
 
 		 518 aa  57.4  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0449  hypothetical protein  20.87 
 
 		 1126 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.812136 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0355  Na+/solute symporter  27.17 
 
 		 505 aa  57  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  20.87 
 
 		 516 aa  57  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  25.26 
 
 		 507 aa  57  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1538  SSS sodium solute transporter superfamily protein  26.6 
 
 		 551 aa  56.6  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.535704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  25.08 
 
 		 506 aa  56.6  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  20.87 
 
 		 516 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1444  hypothetical protein  20.87 
 
 		 1170 aa  55.8  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1575  Sodium/proline symporter  26.4 
 
 		 498 aa  56.6  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0675536  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3675  hypothetical protein  23.67 
 
 		 554 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.834284 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  23.99 
 
 		 492 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4562  Na+/solute symporter  33.56 
 
 		 580 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5016  proline permease  24.19 
 
 		 495 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>