More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1146 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1146  Na+/solute symporter  100 
 
 		 469 aa  936    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.497129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1569  hypothetical protein  41.42 
 
 		 468 aa  349  7e-95  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  26.99 
 
 		 452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  26.11 
 
 		 468 aa  109  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  26.2 
 
 		 472 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  27.39 
 
 		 479 aa  107  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1444  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1170 aa  101  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  23.88 
 
 		 483 aa  100  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  27.83 
 
 		 483 aa  99  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0449  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1126 aa  94.4  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.812136 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  25.9 
 
 		 461 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  23.72 
 
 		 459 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1041  hypothetical protein  26.77 
 
 		 485 aa  89.7  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.880803 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1038  hypothetical protein  27.4 
 
 		 487 aa  89  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  24.72 
 
 		 461 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  24.93 
 
 		 463 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  24.93 
 
 		 463 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  26.64 
 
 		 487 aa  88.2  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0446  hypothetical protein  24.68 
 
 		 726 aa  87.4  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.722173 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  24.95 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  24.69 
 
 		 462 aa  83.6  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.66 
 
 		 484 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  25.12 
 
 		 483 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  23.12 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  25.06 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  25.12 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  23.12 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.35 
 
 		 522 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.23 
 
 		 533 aa  80.5  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  25.12 
 
 		 483 aa  79.7  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  24.88 
 
 		 483 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  24.88 
 
 		 483 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  24.88 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  24.88 
 
 		 483 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  24.88 
 
 		 483 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  24.88 
 
 		 483 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  24.88 
 
 		 483 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  24.88 
 
 		 483 aa  79.7  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  24.88 
 
 		 483 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  25.12 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  24.88 
 
 		 483 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  24.88 
 
 		 483 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  24.66 
 
 		 460 aa  77.4  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.17 
 
 		 548 aa  77.4  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  22.41 
 
 		 461 aa  76.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.33 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  23.63 
 
 		 474 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  25.16 
 
 		 520 aa  75.9  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.16 
 
 		 519 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  24.37 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2974  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.88 
 
 		 478 aa  74.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  25.86 
 
 		 495 aa  74.7  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.78 
 
 		 520 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  28.81 
 
 		 523 aa  73.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  24.21 
 
 		 509 aa  73.6  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  24.42 
 
 		 515 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  23.24 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  25.38 
 
 		 520 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1600  Na+/solute symporter  27.27 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0101485  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.38 
 
 		 520 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  22.54 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  23.68 
 
 		 486 aa  70.1  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.44 
 
 		 523 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1660  Na+/solute symporter  28.7 
 
 		 489 aa  69.7  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139174  normal  0.613212 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  25.39 
 
 		 520 aa  68.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  30.05 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  25.95 
 
 		 492 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  22.2 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  23.76 
 
 		 484 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  23.76 
 
 		 484 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  23.06 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  27.09 
 
 		 483 aa  67.8  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  24.19 
 
 		 599 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  23.76 
 
 		 484 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  31.25 
 
 		 494 aa  66.6  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  26.09 
 
 		 500 aa  66.6  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  28.24 
 
 		 460 aa  66.6  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  23.97 
 
 		 508 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  23.27 
 
 		 476 aa  65.9  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  25.97 
 
 		 496 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  23.26 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  26.51 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  25.14 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  24.66 
 
 		 492 aa  64.3  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  22.44 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  25.27 
 
 		 487 aa  63.9  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2384  Na+/solute symporter  27.86 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  23.42 
 
 		 507 aa  63.2  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  23.39 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  26.33 
 
 		 489 aa  63.2  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  25.42 
 
 		 497 aa  62.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  24.92 
 
 		 513 aa  63.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.08 
 
 		 526 aa  62.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  23.48 
 
 		 446 aa  62.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  22.74 
 
 		 475 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  24.04 
 
 		 506 aa  62.4  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1657  sodium/panthothenate symporter  26.8 
 
 		 477 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343419 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  23.4 
 
 		 490 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  26 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  26 
 
 		 479 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>