More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0367 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  100 
 
 
446 aa  871    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0701  putative Na+/solute symporter  30.26 
 
 
438 aa  154  4e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.48 
 
 
484 aa  143  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  31.2 
 
 
487 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  27.68 
 
 
483 aa  139  8.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  30.48 
 
 
459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  27.78 
 
 
474 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  27.52 
 
 
483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  26.92 
 
 
472 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  26.05 
 
 
476 aa  123  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  30.13 
 
 
461 aa  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  28.18 
 
 
506 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  30.1 
 
 
462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  28.93 
 
 
461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  28.89 
 
 
459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  28.89 
 
 
459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  30.23 
 
 
463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  29.97 
 
 
463 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  30.75 
 
 
460 aa  112  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  28.18 
 
 
483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  28.4 
 
 
459 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  28.78 
 
 
459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  26.17 
 
 
464 aa  109  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  27.56 
 
 
481 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  27.25 
 
 
483 aa  109  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  27.45 
 
 
479 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  26.14 
 
 
462 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  28.27 
 
 
463 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  28.47 
 
 
508 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  25.06 
 
 
486 aa  103  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  26.39 
 
 
489 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  28.12 
 
 
507 aa  100  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  27.25 
 
 
483 aa  99.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  27.58 
 
 
483 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  27.25 
 
 
483 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  27.25 
 
 
483 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  27.25 
 
 
483 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  28.89 
 
 
483 aa  99  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.88 
 
 
526 aa  99  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  26.91 
 
 
483 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  27.13 
 
 
483 aa  99  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  26.91 
 
 
483 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  26.91 
 
 
483 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  26.91 
 
 
483 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  28.65 
 
 
484 aa  97.4  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  28.65 
 
 
484 aa  97.4  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  26.91 
 
 
483 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  26.91 
 
 
483 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  26.91 
 
 
483 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  26.91 
 
 
483 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  28.65 
 
 
484 aa  97.4  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  26.71 
 
 
500 aa  95.9  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.53 
 
 
533 aa  95.9  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  27.4 
 
 
492 aa  93.2  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  29.38 
 
 
483 aa  93.2  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  27.42 
 
 
460 aa  92.8  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  30.25 
 
 
483 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  30.25 
 
 
483 aa  92  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  26.88 
 
 
466 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  26.89 
 
 
523 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2877  sodium/panthothenate symporter  26.36 
 
 
481 aa  91.3  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510653 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  29.27 
 
 
460 aa  91.3  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  27.69 
 
 
498 aa  90.9  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  27.14 
 
 
509 aa  90.1  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0089  Na+/solute symporter  28.08 
 
 
496 aa  89.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000762337  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.35 
 
 
522 aa  88.6  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  26.27 
 
 
483 aa  88.2  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  24.19 
 
 
490 aa  87.8  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04330  Na+/proline symporter  27.39 
 
 
497 aa  86.7  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.723621  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.66 
 
 
523 aa  86.7  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  27.32 
 
 
494 aa  86.7  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.65 
 
 
522 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.1 
 
 
520 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  26.1 
 
 
520 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.66 
 
 
519 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  26.37 
 
 
452 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1444  hypothetical protein  25.89 
 
 
1170 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  25.98 
 
 
459 aa  80.9  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1569  hypothetical protein  24.71 
 
 
468 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1600  Na+/solute symporter  26.69 
 
 
473 aa  80.5  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0101485  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  26.77 
 
 
551 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.32 
 
 
504 aa  80.1  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.68 
 
 
504 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0093  Na+/solute symporter  27.44 
 
 
505 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.620511  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  26.94 
 
 
468 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  26.28 
 
 
520 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  24.7 
 
 
487 aa  79.7  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  26.35 
 
 
520 aa  79  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  29.05 
 
 
492 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  25.37 
 
 
592 aa  79  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  27.36 
 
 
507 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  29.63 
 
 
488 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  25.11 
 
 
482 aa  77.4  0.0000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.28 
 
 
565 aa  77  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0939  hypothetical protein  25.06 
 
 
1157 aa  77  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.186942 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  25.95 
 
 
529 aa  76.6  0.0000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0844  sodium/panthothenate symporter  25.1 
 
 
444 aa  76.6  0.0000000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  25 
 
 
544 aa  76.3  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0688  Na+/solute symporter  24.01 
 
 
471 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.217002  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0507  Na+/solute symporter  28.73 
 
 
519 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.550362  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>