More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3321 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  100 
 
 
494 aa  969    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  81.17 
 
 
495 aa  758    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  55.94 
 
 
492 aa  527  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  50.43 
 
 
487 aa  476  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  51.56 
 
 
483 aa  475  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  51.77 
 
 
483 aa  472  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  51.77 
 
 
483 aa  472  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  51.77 
 
 
483 aa  472  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  51.77 
 
 
483 aa  472  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  51.77 
 
 
483 aa  472  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  51.77 
 
 
483 aa  472  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  51.77 
 
 
483 aa  472  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  51.77 
 
 
483 aa  472  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  52.97 
 
 
483 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  50.1 
 
 
483 aa  471  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  52.75 
 
 
483 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  52.97 
 
 
483 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  52.75 
 
 
483 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  52.97 
 
 
483 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  51.16 
 
 
481 aa  467  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  50.52 
 
 
484 aa  461  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  50.52 
 
 
484 aa  461  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  50.52 
 
 
484 aa  461  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  50.85 
 
 
483 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  45.76 
 
 
482 aa  457  1e-127  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  51.06 
 
 
483 aa  448  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  50.21 
 
 
483 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  51.06 
 
 
483 aa  449  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  46.43 
 
 
479 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  47.22 
 
 
477 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1657  sodium/panthothenate symporter  47.22 
 
 
477 aa  428  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343419 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  46.43 
 
 
479 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  46.43 
 
 
479 aa  430  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3660  sodium/panthothenate symporter  47.22 
 
 
477 aa  429  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  47.44 
 
 
477 aa  430  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  47.22 
 
 
477 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  46.43 
 
 
479 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  46.43 
 
 
479 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  46.57 
 
 
477 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0567  sodium/panthothenate symporter  47.15 
 
 
480 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.868181  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04650  sodium/panthothenate symporter  40.68 
 
 
496 aa  366  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00393427  hitchhiker  0.0000895838 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1901  sodium/panthothenate symporter  42.65 
 
 
512 aa  365  1e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000150828 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  41.4 
 
 
483 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1677  sodium/panthothenate symporter  42.77 
 
 
479 aa  354  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874122  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2877  sodium/panthothenate symporter  42.11 
 
 
481 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510653 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11200  sodium/panthothenate symporter  43.9 
 
 
540 aa  352  1e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0844  sodium/panthothenate symporter  33.33 
 
 
444 aa  259  5.0000000000000005e-68  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.18 
 
 
504 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  28.54 
 
 
513 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  30.43 
 
 
484 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2137  SSS sodium solute transporter superfamily  30.16 
 
 
528 aa  153  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00565072  normal  0.610314 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  30.21 
 
 
492 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  29.65 
 
 
492 aa  150  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  28.45 
 
 
491 aa  150  5e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  27.67 
 
 
488 aa  150  6e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05510  SSS sodium solute transporter  28.09 
 
 
536 aa  149  9e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  29.65 
 
 
492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  29.65 
 
 
492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  29.65 
 
 
492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  28.94 
 
 
492 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  28.94 
 
 
492 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  29.77 
 
 
483 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  29.44 
 
 
492 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  27.74 
 
 
487 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  28.4 
 
 
492 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  28.97 
 
 
484 aa  147  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.3 
 
 
504 aa  146  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  29.28 
 
 
483 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  28.21 
 
 
492 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  28.25 
 
 
492 aa  146  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  28.25 
 
 
493 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  28.25 
 
 
492 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  29.44 
 
 
493 aa  146  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  28.25 
 
 
493 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  28.25 
 
 
493 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  28.25 
 
 
492 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  28.26 
 
 
474 aa  144  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  29.03 
 
 
485 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  26.35 
 
 
492 aa  144  4e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  27.84 
 
 
492 aa  144  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  30.08 
 
 
488 aa  144  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  27.36 
 
 
482 aa  143  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  28.04 
 
 
492 aa  143  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  27.62 
 
 
492 aa  143  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  29.55 
 
 
488 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  28.26 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  29.3 
 
 
496 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  28.92 
 
 
497 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  27.97 
 
 
482 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  31.07 
 
 
483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  29.32 
 
 
486 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  29.55 
 
 
483 aa  141  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09750  sodium/proline symporter  28.69 
 
 
520 aa  140  4.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000003829  hitchhiker  0.000045945 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  28.63 
 
 
493 aa  139  8.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  29.34 
 
 
483 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  29.03 
 
 
483 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  28.99 
 
 
506 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  29.12 
 
 
483 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  29.12 
 
 
483 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  27.57 
 
 
486 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>