More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3191 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  100 
 
 		 504 aa  994    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  61.94 
 
 		 504 aa  551  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  48.56 
 
 		 489 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.74 
 
 		 489 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  47.94 
 
 		 489 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0612  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  49.3 
 
 		 503 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000214976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  44.83 
 
 		 508 aa  425  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1759  Na+ symporter  47.34 
 
 		 531 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0068  Na+/solute symporter  44.22 
 
 		 512 aa  366  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01330  Na+/proline symporter  44.69 
 
 		 525 aa  331  2e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.82 
 
 		 533 aa  189  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0975  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.22 
 
 		 533 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0971  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.06 
 
 		 533 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1706  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.49 
 
 		 533 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0425  Na+/solute symporter  29.33 
 
 		 530 aa  179  7e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0468  Na+/solute symporter  27.38 
 
 		 528 aa  178  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280127  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  29.36 
 
 		 537 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  31.32 
 
 		 484 aa  174  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  31.32 
 
 		 484 aa  174  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  31.32 
 
 		 484 aa  174  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  30.42 
 
 		 492 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  30.5 
 
 		 492 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  30.63 
 
 		 492 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  30.5 
 
 		 492 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  30.63 
 
 		 492 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  30.63 
 
 		 492 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  32.44 
 
 		 483 aa  171  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  32.44 
 
 		 483 aa  171  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3721  sodium:proline symporter (proline permease)  28.21 
 
 		 553 aa  170  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2326  Na+/solute symporter  29.21 
 
 		 520 aa  170  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  30.5 
 
 		 492 aa  170  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  29.98 
 
 		 492 aa  169  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  30.83 
 
 		 481 aa  169  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1134  Na+/solute symporter  30.67 
 
 		 527 aa  169  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  30.48 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  31.51 
 
 		 483 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  31.51 
 
 		 483 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  29.98 
 
 		 483 aa  164  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  31.51 
 
 		 483 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  31.51 
 
 		 483 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  31.51 
 
 		 483 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  31.19 
 
 		 483 aa  163  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  29.78 
 
 		 482 aa  162  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  31.29 
 
 		 483 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  31.29 
 
 		 483 aa  162  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  31.29 
 
 		 483 aa  162  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  31.06 
 
 		 483 aa  162  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  31.29 
 
 		 483 aa  162  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  31.29 
 
 		 483 aa  162  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  31.29 
 
 		 483 aa  162  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  31.29 
 
 		 483 aa  162  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  31.29 
 
 		 483 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  28.89 
 
 		 494 aa  162  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  30.67 
 
 		 483 aa  160  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1847  Na+/solute symporter  28.93 
 
 		 543 aa  160  6e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  30.18 
 
 		 483 aa  160  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  29.56 
 
 		 488 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  28.25 
 
 		 497 aa  158  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  27.95 
 
 		 492 aa  158  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  28.15 
 
 		 492 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  29.65 
 
 		 492 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  29.82 
 
 		 494 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  31.12 
 
 		 488 aa  156  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  30.48 
 
 		 492 aa  156  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  29.86 
 
 		 483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  28.27 
 
 		 493 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  28.11 
 
 		 482 aa  154  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1063  hypothetical protein  34.26 
 
 		 526 aa  154  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.771513 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  29.04 
 
 		 492 aa  154  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2930  sodium/proline symporter  28.89 
 
 		 494 aa  154  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0527151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  33.02 
 
 		 498 aa  154  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  29.46 
 
 		 493 aa  153  5e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0049  Na+/solute symporter  30.14 
 
 		 543 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  30.47 
 
 		 492 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  27.1 
 
 		 492 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  30.95 
 
 		 502 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0037  Na+/solute symporter  30.14 
 
 		 543 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0034  Na+/solute symporter  30.14 
 
 		 543 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.404882  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  29.37 
 
 		 497 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  28.4 
 
 		 499 aa  152  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3766  sodium/proline symporter  29.84 
 
 		 499 aa  152  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  30.14 
 
 		 483 aa  151  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  26.92 
 
 		 529 aa  151  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  30.47 
 
 		 492 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  26.69 
 
 		 492 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  29.1 
 
 		 483 aa  151  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  26.69 
 
 		 487 aa  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  25.85 
 
 		 498 aa  151  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  28.87 
 
 		 484 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0273  sodium/proline symporter  31.1 
 
 		 504 aa  150  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  26.69 
 
 		 493 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  26.28 
 
 		 492 aa  150  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1337  sodium/proline symporter (proline permease)  27.85 
 
 		 531 aa  150  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  26.69 
 
 		 492 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  26.69 
 
 		 493 aa  150  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  26.69 
 
 		 493 aa  150  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1200  sodium/proline symporter  30.02 
 
 		 502 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  29.23 
 
 		 494 aa  150  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  30.23 
 
 		 492 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1190  sodium/proline symporter  30.02 
 
 		 502 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.969329  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>