More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4575 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  82.77 
 
 
484 aa  771    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  100 
 
 
483 aa  952    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  100 
 
 
483 aa  952    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  99.79 
 
 
483 aa  951    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  93.58 
 
 
483 aa  866    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  93.79 
 
 
483 aa  867    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  100 
 
 
483 aa  952    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  81.5 
 
 
481 aa  778    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  100 
 
 
483 aa  952    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  82.77 
 
 
484 aa  771    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  82.82 
 
 
483 aa  815    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  93.58 
 
 
483 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  72.26 
 
 
483 aa  694    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  100 
 
 
483 aa  952    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  100 
 
 
483 aa  952    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  73.83 
 
 
483 aa  701    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  93.37 
 
 
483 aa  866    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  100 
 
 
483 aa  952    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  82.77 
 
 
484 aa  771    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  76.58 
 
 
483 aa  697    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  76.58 
 
 
483 aa  694    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  93.58 
 
 
483 aa  866    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  98.96 
 
 
483 aa  947    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0567  sodium/panthothenate symporter  59.07 
 
 
480 aa  545  1e-154  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.868181  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  55.17 
 
 
492 aa  519  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  52.84 
 
 
494 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  51.37 
 
 
495 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  48.62 
 
 
477 aa  427  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  48.51 
 
 
477 aa  425  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1657  sodium/panthothenate symporter  48.41 
 
 
477 aa  424  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343419 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  48.09 
 
 
477 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3660  sodium/panthothenate symporter  48.3 
 
 
477 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  47.87 
 
 
479 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  47.87 
 
 
479 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  47.87 
 
 
479 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  47.87 
 
 
479 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  47.87 
 
 
479 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  44.18 
 
 
482 aa  419  1e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  45.83 
 
 
487 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  48.57 
 
 
477 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1677  sodium/panthothenate symporter  45.66 
 
 
479 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874122  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  43.28 
 
 
483 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2877  sodium/panthothenate symporter  42.95 
 
 
481 aa  361  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510653 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11200  sodium/panthothenate symporter  41.19 
 
 
540 aa  315  9.999999999999999e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1901  sodium/panthothenate symporter  37.5 
 
 
512 aa  302  9e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000150828 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04650  sodium/panthothenate symporter  37.42 
 
 
496 aa  298  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00393427  hitchhiker  0.0000895838 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0844  sodium/panthothenate symporter  33.56 
 
 
444 aa  257  3e-67  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.46 
 
 
504 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  30.61 
 
 
518 aa  166  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  30.92 
 
 
497 aa  161  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  28.03 
 
 
491 aa  160  4e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  29.8 
 
 
492 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  30.28 
 
 
492 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  29.79 
 
 
492 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  30.08 
 
 
492 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  29.18 
 
 
492 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  29.18 
 
 
492 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  30.14 
 
 
513 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  25.65 
 
 
492 aa  153  5.9999999999999996e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  28.98 
 
 
493 aa  153  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  29.59 
 
 
492 aa  153  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  28.98 
 
 
493 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  28.98 
 
 
493 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  29.09 
 
 
482 aa  151  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  26.89 
 
 
508 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  29.69 
 
 
487 aa  150  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  28.6 
 
 
529 aa  150  6e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  28.87 
 
 
482 aa  150  7e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  31.44 
 
 
498 aa  149  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  27.16 
 
 
493 aa  149  8e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  27.58 
 
 
492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  30.52 
 
 
493 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  26.49 
 
 
488 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.5 
 
 
533 aa  147  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04170  sodium/proline symporter  30.06 
 
 
499 aa  148  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0302673 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  27.58 
 
 
492 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  27.58 
 
 
492 aa  146  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  27.58 
 
 
492 aa  146  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  29.3 
 
 
474 aa  146  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  27.58 
 
 
492 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  27.58 
 
 
492 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  28.25 
 
 
483 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  27.58 
 
 
492 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  27.22 
 
 
495 aa  145  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  28.01 
 
 
486 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1525  Na+/solute symporter  27.69 
 
 
479 aa  144  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  29.38 
 
 
511 aa  143  6e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  27.04 
 
 
488 aa  143  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  27.16 
 
 
492 aa  143  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  27.14 
 
 
483 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  31.03 
 
 
498 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  28.9 
 
 
499 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  27.95 
 
 
486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  30.77 
 
 
496 aa  141  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  26.95 
 
 
492 aa  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  27.64 
 
 
492 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  27.87 
 
 
483 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  28.51 
 
 
488 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1248  Sodium/proline symporter  28.46 
 
 
496 aa  139  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  28.63 
 
 
496 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>