More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2137 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_05510  SSS sodium solute transporter  69.68 
 
 
536 aa  746    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1396  Na+/proline symporter  71.24 
 
 
553 aa  762    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2137  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 
528 aa  1056    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00565072  normal  0.610314 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09750  sodium/proline symporter  72.04 
 
 
520 aa  727    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000003829  hitchhiker  0.000045945 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  42.61 
 
 
492 aa  412  1e-114  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  42.23 
 
 
492 aa  410  1e-113  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  42.23 
 
 
492 aa  410  1e-113  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  41.97 
 
 
498 aa  397  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  43.82 
 
 
498 aa  385  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  42.03 
 
 
496 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  43.41 
 
 
498 aa  385  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  40.85 
 
 
492 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  41.11 
 
 
486 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  40.12 
 
 
513 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  41.49 
 
 
484 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  40.42 
 
 
518 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  40.83 
 
 
492 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  40.63 
 
 
492 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  42.07 
 
 
485 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  40.63 
 
 
492 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  41.57 
 
 
491 aa  374  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  39.62 
 
 
492 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  40.43 
 
 
492 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  40.63 
 
 
493 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  40.63 
 
 
493 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  40.63 
 
 
492 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  40.63 
 
 
493 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  40.28 
 
 
487 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  40.63 
 
 
492 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  40.59 
 
 
492 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  39.77 
 
 
512 aa  369  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  39.77 
 
 
512 aa  369  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  39.88 
 
 
511 aa  368  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  42.09 
 
 
482 aa  366  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  40.04 
 
 
511 aa  364  2e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  39.54 
 
 
497 aa  364  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  38.81 
 
 
488 aa  364  2e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  39.25 
 
 
492 aa  362  8e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  39.25 
 
 
492 aa  362  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  39.45 
 
 
492 aa  362  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  39.45 
 
 
492 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  39.25 
 
 
492 aa  362  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  39.25 
 
 
492 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  39.56 
 
 
493 aa  361  2e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  41.25 
 
 
496 aa  360  3e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  39.64 
 
 
492 aa  360  3e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  40.23 
 
 
489 aa  360  5e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  40.68 
 
 
489 aa  359  8e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  40.88 
 
 
489 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  38.86 
 
 
482 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  40.43 
 
 
495 aa  357  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0817  proline permease  42.12 
 
 
498 aa  358  1.9999999999999998e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  40.36 
 
 
483 aa  354  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  38.97 
 
 
493 aa  354  2e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  40.31 
 
 
493 aa  354  2.9999999999999997e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1575  Sodium/proline symporter  40.6 
 
 
498 aa  353  4e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0675536  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  40.76 
 
 
497 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  40.16 
 
 
483 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  40.04 
 
 
483 aa  352  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  40.08 
 
 
483 aa  351  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  40.04 
 
 
492 aa  350  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  40.72 
 
 
483 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  40.72 
 
 
483 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  40.72 
 
 
483 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  40.44 
 
 
488 aa  349  5e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  40.72 
 
 
483 aa  349  7e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  38.26 
 
 
483 aa  349  7e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  39.29 
 
 
483 aa  347  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  38.94 
 
 
499 aa  348  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1229  sodium/proline symporter  40.38 
 
 
504 aa  345  1e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  37.67 
 
 
488 aa  344  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  38.7 
 
 
492 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  38.55 
 
 
506 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  38.55 
 
 
506 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1334  sodium/proline symporter  38.65 
 
 
499 aa  342  1e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  36.99 
 
 
494 aa  342  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  39.01 
 
 
492 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  38.51 
 
 
492 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1131  sodium/proline symporter  37.97 
 
 
502 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2580  sodium/proline symporter  37.97 
 
 
502 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0213742 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  37.5 
 
 
502 aa  340  2.9999999999999998e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4147  sodium/proline symporter  39.38 
 
 
497 aa  340  4e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  36.99 
 
 
494 aa  340  5e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1253  sodium/proline symporter  37.77 
 
 
502 aa  339  9e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.325594 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01018  proline:sodium symporter  37.77 
 
 
502 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2108  sodium/proline symporter  37.77 
 
 
502 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.275652  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1135  sodium/proline symporter  37.77 
 
 
502 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0465761  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0273  sodium/proline symporter  36.47 
 
 
504 aa  338  9.999999999999999e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5942  sodium/proline symporter  38.64 
 
 
500 aa  338  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2627  sodium/proline symporter  37.57 
 
 
502 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2302  sodium/proline symporter  37.77 
 
 
502 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04170  sodium/proline symporter  38.9 
 
 
499 aa  337  2.9999999999999997e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0302673 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3766  sodium/proline symporter  37.21 
 
 
499 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2265  sodium/proline symporter  36.67 
 
 
494 aa  335  7.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2039  proline permease  36.67 
 
 
494 aa  335  7.999999999999999e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2367  sodium/proline symporter  36.67 
 
 
494 aa  335  7.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0234397  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  38.1 
 
 
486 aa  334  2e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  37.38 
 
 
494 aa  334  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  37.9 
 
 
483 aa  334  3e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  38.67 
 
 
498 aa  334  3e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>