More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0552 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  100 
 
 
482 aa  938    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  52.58 
 
 
487 aa  498  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  46.11 
 
 
492 aa  455  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  45.76 
 
 
494 aa  450  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  44.56 
 
 
495 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  46.23 
 
 
479 aa  425  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  46.23 
 
 
479 aa  425  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0567  sodium/panthothenate symporter  47.72 
 
 
480 aa  426  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.868181  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  46.38 
 
 
477 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  46.23 
 
 
479 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  44.64 
 
 
483 aa  424  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  46.23 
 
 
479 aa  424  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  46.23 
 
 
479 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  44.4 
 
 
483 aa  422  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  46.64 
 
 
477 aa  423  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  46.38 
 
 
477 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3660  sodium/panthothenate symporter  46.38 
 
 
477 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  45.41 
 
 
484 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  45.41 
 
 
484 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  42.65 
 
 
481 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  45.41 
 
 
484 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1657  sodium/panthothenate symporter  46.38 
 
 
477 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343419 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  44.18 
 
 
483 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  44.18 
 
 
483 aa  414  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  44.18 
 
 
483 aa  414  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  44.18 
 
 
483 aa  414  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  44.18 
 
 
483 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  44.18 
 
 
483 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  44.18 
 
 
483 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  44.18 
 
 
483 aa  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  42.58 
 
 
483 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  44.59 
 
 
483 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  44.59 
 
 
483 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  44.59 
 
 
483 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  44.81 
 
 
483 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  44.81 
 
 
483 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  46.09 
 
 
477 aa  404  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  42.58 
 
 
483 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  44.14 
 
 
483 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  44.37 
 
 
483 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04650  sodium/panthothenate symporter  39.71 
 
 
496 aa  338  9.999999999999999e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00393427  hitchhiker  0.0000895838 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1901  sodium/panthothenate symporter  35.22 
 
 
512 aa  312  9e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000150828 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11200  sodium/panthothenate symporter  36.42 
 
 
540 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  36.97 
 
 
483 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1677  sodium/panthothenate symporter  35.02 
 
 
479 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874122  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2877  sodium/panthothenate symporter  35.28 
 
 
481 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510653 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0844  sodium/panthothenate symporter  37.64 
 
 
444 aa  258  2e-67  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  28.04 
 
 
492 aa  187  3e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  27.14 
 
 
518 aa  180  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  29.71 
 
 
513 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  29.75 
 
 
498 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  28.28 
 
 
492 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  29.69 
 
 
493 aa  174  3.9999999999999995e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  29.42 
 
 
491 aa  171  3e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  29.01 
 
 
492 aa  171  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  26.9 
 
 
497 aa  171  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  28.6 
 
 
492 aa  170  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  28.39 
 
 
492 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  28.8 
 
 
492 aa  170  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  28.94 
 
 
487 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  28.51 
 
 
493 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  28.48 
 
 
493 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  28.48 
 
 
493 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  28.42 
 
 
492 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  27.35 
 
 
544 aa  167  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  30.02 
 
 
486 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  28.39 
 
 
492 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  31.29 
 
 
483 aa  166  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  31.29 
 
 
483 aa  166  9e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  29.13 
 
 
496 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  29.5 
 
 
483 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  26.68 
 
 
482 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  31.08 
 
 
483 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0817  proline permease  28.95 
 
 
498 aa  164  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  28.25 
 
 
498 aa  164  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  26.88 
 
 
496 aa  163  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  27.39 
 
 
488 aa  162  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  28.72 
 
 
492 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  28.25 
 
 
492 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  28.42 
 
 
492 aa  160  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  28.87 
 
 
492 aa  160  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  28.87 
 
 
492 aa  160  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  27.98 
 
 
492 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  28.4 
 
 
492 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  27.5 
 
 
492 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  28.4 
 
 
492 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  28.4 
 
 
492 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  29.02 
 
 
486 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  29.55 
 
 
483 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  29.55 
 
 
483 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  29.55 
 
 
483 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  29.55 
 
 
483 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  29.29 
 
 
497 aa  157  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  28.02 
 
 
500 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  30.94 
 
 
488 aa  156  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  29.46 
 
 
483 aa  156  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  28.18 
 
 
492 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  27.58 
 
 
492 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  28.06 
 
 
489 aa  154  4e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  27.64 
 
 
489 aa  153  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>