More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_11200 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04650  sodium/panthothenate symporter  71.1 
 
 		 496 aa  673    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00393427  hitchhiker  0.0000895838 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11200  sodium/panthothenate symporter  100 
 
 		 540 aa  1078    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1901  sodium/panthothenate symporter  73.7 
 
 		 512 aa  662    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000150828 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  42.47 
 
 		 487 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  43.9 
 
 		 494 aa  361  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  43.03 
 
 		 492 aa  359  8e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  42.42 
 
 		 495 aa  335  9e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  39.29 
 
 		 477 aa  323  5e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  39.7 
 
 		 477 aa  323  7e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  40.6 
 
 		 483 aa  322  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3660  sodium/panthothenate symporter  39.91 
 
 		 477 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  39.83 
 
 		 483 aa  322  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  39.48 
 
 		 477 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  40.6 
 
 		 483 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  40.6 
 
 		 483 aa  320  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  39.48 
 
 		 479 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  39.48 
 
 		 479 aa  320  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  39.48 
 
 		 479 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  39.48 
 
 		 479 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  40.6 
 
 		 483 aa  320  3e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  40.6 
 
 		 483 aa  320  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1657  sodium/panthothenate symporter  39.91 
 
 		 477 aa  320  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343419 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  40.6 
 
 		 483 aa  320  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  40.6 
 
 		 483 aa  320  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  40.6 
 
 		 483 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  39.48 
 
 		 479 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  40.43 
 
 		 481 aa  320  6e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  36.34 
 
 		 482 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  40.39 
 
 		 483 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  40.39 
 
 		 483 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  40.39 
 
 		 483 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  40.39 
 
 		 483 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  38.59 
 
 		 484 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  40.39 
 
 		 483 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  38.59 
 
 		 484 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  38.59 
 
 		 484 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  37.36 
 
 		 483 aa  312  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  38.22 
 
 		 483 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  37.26 
 
 		 483 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  39.4 
 
 		 477 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  38.62 
 
 		 483 aa  291  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  38.14 
 
 		 483 aa  290  7e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0567  sodium/panthothenate symporter  36.76 
 
 		 480 aa  289  1e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.868181  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  34.11 
 
 		 483 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1677  sodium/panthothenate symporter  33.33 
 
 		 479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874122  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2877  sodium/panthothenate symporter  32.99 
 
 		 481 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510653 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0844  sodium/panthothenate symporter  26.61 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  25.64 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  27.35 
 
 		 492 aa  141  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  25.93 
 
 		 492 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  25.35 
 
 		 544 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1334  sodium/proline symporter  29.4 
 
 		 499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  25.93 
 
 		 492 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  28.31 
 
 		 484 aa  134  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  27.51 
 
 		 493 aa  133  6.999999999999999e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  27.25 
 
 		 482 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  25.29 
 
 		 492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  25.29 
 
 		 492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  25.29 
 
 		 492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.1 
 
 		 492 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.1 
 
 		 492 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  25.1 
 
 		 492 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  26.39 
 
 		 492 aa  130  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.83 
 
 		 504 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2326  Na+/solute symporter  28.42 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  27.36 
 
 		 482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  26.73 
 
 		 484 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  27.02 
 
 		 487 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  26.13 
 
 		 492 aa  128  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  26.33 
 
 		 485 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  26.81 
 
 		 492 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  27.02 
 
 		 493 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.2 
 
 		 533 aa  126  9e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  24.95 
 
 		 512 aa  126  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  26.5 
 
 		 495 aa  126  9e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  24.95 
 
 		 512 aa  126  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  26.77 
 
 		 492 aa  126  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  27.02 
 
 		 493 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  27.02 
 
 		 493 aa  126  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  27.02 
 
 		 492 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  27.02 
 
 		 492 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  27.02 
 
 		 492 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  26.89 
 
 		 498 aa  125  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  26.61 
 
 		 491 aa  124  4e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  28.8 
 
 		 491 aa  124  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  24.08 
 
 		 513 aa  124  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  26.98 
 
 		 492 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1706  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.5 
 
 		 533 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  26.09 
 
 		 486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  28.16 
 
 		 488 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.41 
 
 		 489 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  24.56 
 
 		 492 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0975  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.32 
 
 		 533 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  26.27 
 
 		 496 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  25.97 
 
 		 489 aa  121  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  24.56 
 
 		 492 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  25.7 
 
 		 507 aa  120  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0971  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.32 
 
 		 533 aa  120  7e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  23.97 
 
 		 492 aa  120  9e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0468  Na+/solute symporter  25.6 
 
 		 528 aa  120  9e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>