More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1220 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  100 
 
 		 489 aa  969    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  95.71 
 
 		 489 aa  941    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  96.93 
 
 		 489 aa  951    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.74 
 
 		 504 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  50.41 
 
 		 504 aa  444  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0612  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.11 
 
 		 503 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000214976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  40.99 
 
 		 508 aa  348  2e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1759  Na+ symporter  41.8 
 
 		 531 aa  347  4e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0068  Na+/solute symporter  40.88 
 
 		 512 aa  333  3e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01330  Na+/proline symporter  41.75 
 
 		 525 aa  298  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  29.27 
 
 		 492 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  29.07 
 
 		 492 aa  177  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  29.07 
 
 		 492 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  29.07 
 
 		 492 aa  177  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  29.07 
 
 		 492 aa  177  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  29.07 
 
 		 492 aa  177  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  27.61 
 
 		 487 aa  173  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  28.22 
 
 		 483 aa  173  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  27.81 
 
 		 492 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  28.67 
 
 		 492 aa  172  9e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  29.39 
 
 		 492 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  28.81 
 
 		 482 aa  172  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  28.22 
 
 		 492 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  28.57 
 
 		 488 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  27.61 
 
 		 492 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  28.37 
 
 		 492 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  26.92 
 
 		 492 aa  170  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  28.37 
 
 		 493 aa  170  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  28.92 
 
 		 492 aa  169  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  28.16 
 
 		 493 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  28.16 
 
 		 493 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  28.16 
 
 		 492 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  26.92 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  28.57 
 
 		 483 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  28.24 
 
 		 483 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.12 
 
 		 533 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  28.24 
 
 		 483 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  28.03 
 
 		 483 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  27.57 
 
 		 483 aa  167  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  28.19 
 
 		 497 aa  166  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  29.92 
 
 		 484 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  26.7 
 
 		 493 aa  166  8e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  27.61 
 
 		 482 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  28.93 
 
 		 498 aa  164  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  27.85 
 
 		 486 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  27.07 
 
 		 483 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  27.07 
 
 		 483 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  27.07 
 
 		 483 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  27.07 
 
 		 483 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  28.83 
 
 		 488 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  28.47 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  28.77 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  29.22 
 
 		 492 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  28.64 
 
 		 497 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1248  Sodium/proline symporter  29.34 
 
 		 496 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  28.77 
 
 		 492 aa  161  3e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2326  Na+/solute symporter  28.57 
 
 		 520 aa  159  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  29.14 
 
 		 495 aa  157  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  27.84 
 
 		 518 aa  156  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  29.07 
 
 		 485 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0971  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.27 
 
 		 533 aa  154  4e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1334  sodium/proline symporter  28.42 
 
 		 499 aa  154  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  28.37 
 
 		 496 aa  154  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0425  Na+/solute symporter  26.7 
 
 		 530 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1860  sodium/proline symporter  27.89 
 
 		 496 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0914218  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  26.48 
 
 		 492 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  27.17 
 
 		 483 aa  150  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  28.23 
 
 		 491 aa  150  7e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0975  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.88 
 
 		 533 aa  149  9e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  26.85 
 
 		 492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  28.7 
 
 		 496 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1706  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.6 
 
 		 533 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  27.44 
 
 		 506 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  27.21 
 
 		 502 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  27.79 
 
 		 512 aa  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  27.79 
 
 		 512 aa  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  29 
 
 		 493 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  26.53 
 
 		 492 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  26.3 
 
 		 492 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  27.33 
 
 		 506 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1847  Na+/solute symporter  29.55 
 
 		 543 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1200  sodium/proline symporter  27.15 
 
 		 502 aa  146  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1190  sodium/proline symporter  27.15 
 
 		 502 aa  146  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.969329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1235  sodium/proline symporter  27.15 
 
 		 502 aa  146  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0211084  normal  0.60164 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1220  sodium/proline symporter  27.15 
 
 		 502 aa  146  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3721  sodium:proline symporter (proline permease)  26.91 
 
 		 553 aa  146  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  25.91 
 
 		 495 aa  145  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2627  sodium/proline symporter  27.38 
 
 		 502 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1253  sodium/proline symporter  27.38 
 
 		 502 aa  144  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.325594 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  28.37 
 
 		 498 aa  144  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1134  Na+/solute symporter  27.02 
 
 		 527 aa  144  5e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0468  Na+/solute symporter  24.41 
 
 		 528 aa  144  5e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280127  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1085  sodium/proline symporter  26.91 
 
 		 503 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  27.89 
 
 		 488 aa  143  6e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  26.41 
 
 		 513 aa  143  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  24.02 
 
 		 537 aa  143  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01018  proline:sodium symporter  27.15 
 
 		 502 aa  143  9e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2580  sodium/proline symporter  27.15 
 
 		 502 aa  143  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0213742 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1135  sodium/proline symporter  27.15 
 
 		 502 aa  143  9e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0465761  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1131  sodium/proline symporter  27.15 
 
 		 502 aa  143  9e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>