More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2070 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  100 
 
 		 489 aa  958    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  48.14 
 
 		 526 aa  449  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  29.57 
 
 		 520 aa  210  4e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.57 
 
 		 542 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09590  Na+/proline symporter  30.45 
 
 		 501 aa  190  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974546  normal  0.236374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1825  SSS sodium solute transporter superfamily  31.28 
 
 		 533 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.915648  normal  0.529366 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3352  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.45 
 
 		 479 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  31.75 
 
 		 472 aa  159  7e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0206  Na+/solute symporter  31.92 
 
 		 470 aa  160  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  27.18 
 
 		 522 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  30.67 
 
 		 472 aa  154  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  28.42 
 
 		 883 aa  153  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  28.64 
 
 		 581 aa  152  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1227  Na+/solute symporter  31.52 
 
 		 517 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212817  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  27.54 
 
 		 530 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5947  Na+/solute symporter  30.22 
 
 		 509 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  31.53 
 
 		 468 aa  143  8e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4818  Na+/solute symporter  27.27 
 
 		 501 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0261  Na+/solute symporter  27.57 
 
 		 468 aa  137  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.728087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  28.35 
 
 		 467 aa  135  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.86 
 
 		 574 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  26.21 
 
 		 509 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  25.46 
 
 		 513 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2903  Na+/solute symporter  28.33 
 
 		 488 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  28.3 
 
 		 566 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1101  sodium:solute symporter family protein  25.64 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  30.34 
 
 		 547 aa  125  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1869  Na+/solute symporter  29.08 
 
 		 502 aa  123  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.319535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0043  Na+/solute symporter  29.8 
 
 		 565 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3029  Na+/solute symporter  24.88 
 
 		 492 aa  120  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.54 
 
 		 892 aa  119  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  30.03 
 
 		 581 aa  119  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  26.6 
 
 		 513 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  26.65 
 
 		 568 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1598  Na+/solute symporter  26.94 
 
 		 487 aa  117  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.414751 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1238  sodium-glucose/galactose cotransporter  28.05 
 
 		 498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.425742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  27.64 
 
 		 527 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  28.05 
 
 		 498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1203  sodium-glucose/galactose cotransporter  28.05 
 
 		 498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.410205 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1223  sodium-glucose/galactose cotransporter  28.05 
 
 		 498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2009  sodium:solute symporter family protein  28.24 
 
 		 473 aa  114  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  23.33 
 
 		 551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07575  putative transmembrane sodium-solute transporter  28.62 
 
 		 478 aa  114  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  26.4 
 
 		 527 aa  113  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  29.22 
 
 		 562 aa  113  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  26.95 
 
 		 529 aa  113  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1047  sodium/solute symporter  29.57 
 
 		 488 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322443  normal  0.451489 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.7 
 
 		 526 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.25 
 
 		 523 aa  107  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.14 
 
 		 510 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.73 
 
 		 526 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.14 
 
 		 510 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.11 
 
 		 519 aa  104  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.48 
 
 		 548 aa  103  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.53 
 
 		 533 aa  103  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6812  Na+/solute symporter  27.03 
 
 		 493 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641673  hitchhiker  0.00114247 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  24.69 
 
 		 523 aa  103  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  26.8 
 
 		 509 aa  103  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.59 
 
 		 522 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  23.81 
 
 		 539 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  23.09 
 
 		 520 aa  99.8  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.14 
 
 		 522 aa  99  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  24.59 
 
 		 562 aa  98.2  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  24.74 
 
 		 568 aa  97.1  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  24.94 
 
 		 520 aa  96.3  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  24.24 
 
 		 523 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  23.19 
 
 		 570 aa  95.5  2e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.04 
 
 		 520 aa  94.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2609  Na+/solute symporter  28.38 
 
 		 566 aa  94  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  26.9 
 
 		 505 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  22.16 
 
 		 592 aa  92.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  26.9 
 
 		 505 aa  91.3  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.18 
 
 		 520 aa  91.3  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  22.92 
 
 		 520 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  23.99 
 
 		 598 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  23.06 
 
 		 549 aa  87.4  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  23.33 
 
 		 532 aa  87  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.57 
 
 		 522 aa  86.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  24.29 
 
 		 461 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.61 
 
 		 561 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.61 
 
 		 486 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  23.4 
 
 		 556 aa  85.1  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  23.25 
 
 		 569 aa  84  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.92 
 
 		 526 aa  84  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  23.11 
 
 		 557 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  25.2 
 
 		 565 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  23.98 
 
 		 597 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  23.37 
 
 		 529 aa  81.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  23.74 
 
 		 557 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  23.96 
 
 		 517 aa  80.9  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  23.06 
 
 		 571 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  22.8 
 
 		 571 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  22.54 
 
 		 571 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  22.54 
 
 		 571 aa  80.1  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  22.54 
 
 		 571 aa  80.1  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  22.54 
 
 		 571 aa  80.1  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  23.48 
 
 		 561 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4098  Na+/solute symporter  25.81 
 
 		 486 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0584341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  21.65 
 
 		 596 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.89 
 
 		 474 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>