More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3840 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  70.25 
 
 		 520 aa  744    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  100 
 
 		 523 aa  1053    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  60.77 
 
 		 592 aa  636    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  66.22 
 
 		 520 aa  700    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  63.85 
 
 		 522 aa  642    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  64.3 
 
 		 522 aa  693    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  63.92 
 
 		 520 aa  646    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  68.65 
 
 		 520 aa  715    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  63.72 
 
 		 520 aa  646    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  67.5 
 
 		 519 aa  687    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  60.11 
 
 		 522 aa  610  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  52.64 
 
 		 548 aa  572  1.0000000000000001e-162  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  46.64 
 
 		 562 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  46.55 
 
 		 561 aa  483  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  47.8 
 
 		 539 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  45.61 
 
 		 568 aa  476  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  46.18 
 
 		 545 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  47.71 
 
 		 549 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.58 
 
 		 522 aa  458  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  47.4 
 
 		 536 aa  442  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  42.63 
 
 		 565 aa  415  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  44.33 
 
 		 561 aa  409  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.55 
 
 		 561 aa  409  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  38.7 
 
 		 509 aa  335  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  36.02 
 
 		 523 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  36.3 
 
 		 526 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.85 
 
 		 533 aa  261  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  34.24 
 
 		 551 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  32.09 
 
 		 598 aa  230  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.7 
 
 		 565 aa  227  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  32.01 
 
 		 562 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  33.26 
 
 		 571 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  33.26 
 
 		 571 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  33.26 
 
 		 571 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.37 
 
 		 526 aa  215  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  33.26 
 
 		 571 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  34.02 
 
 		 571 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  34.02 
 
 		 571 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  33.18 
 
 		 531 aa  213  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  30.17 
 
 		 529 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  28.37 
 
 		 551 aa  211  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0970  SSS sodium solute transporter superfamily  38.26 
 
 		 765 aa  206  8e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000363528  normal  0.258421 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  31.16 
 
 		 551 aa  204  2e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  33.19 
 
 		 557 aa  204  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.03 
 
 		 473 aa  203  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  32.75 
 
 		 557 aa  204  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.82 
 
 		 474 aa  203  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.74 
 
 		 474 aa  194  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  28.66 
 
 		 596 aa  194  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  28.71 
 
 		 532 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  28.81 
 
 		 529 aa  192  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  29.32 
 
 		 562 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  28.4 
 
 		 530 aa  184  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.27 
 
 		 613 aa  183  8.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  28.64 
 
 		 537 aa  176  9e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.83 
 
 		 486 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  27.21 
 
 		 565 aa  168  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  29.52 
 
 		 566 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  25.62 
 
 		 569 aa  162  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.22 
 
 		 593 aa  161  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  27.67 
 
 		 564 aa  160  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.39 
 
 		 567 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  27.23 
 
 		 560 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.26 
 
 		 550 aa  154  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  26.16 
 
 		 526 aa  150  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4098  Na+/solute symporter  26.6 
 
 		 486 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0584341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.1 
 
 		 542 aa  140  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  25.43 
 
 		 505 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  25.92 
 
 		 505 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  25.06 
 
 		 581 aa  136  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  27.8 
 
 		 530 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  26 
 
 		 513 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  24.55 
 
 		 472 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  28.99 
 
 		 517 aa  119  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  26.32 
 
 		 520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  26.26 
 
 		 883 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  26.38 
 
 		 566 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  24.6 
 
 		 527 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  25.25 
 
 		 513 aa  114  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  25 
 
 		 575 aa  114  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  25.98 
 
 		 509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  23.36 
 
 		 522 aa  110  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  28.12 
 
 		 581 aa  110  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  24.89 
 
 		 506 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.08 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  27.59 
 
 		 523 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  25.25 
 
 		 489 aa  107  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.69 
 
 		 892 aa  107  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  25.54 
 
 		 527 aa  106  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  24.95 
 
 		 556 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  25.49 
 
 		 482 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.94 
 
 		 574 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  23.54 
 
 		 529 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  27.08 
 
 		 492 aa  103  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  25.23 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  24.48 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  26.88 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  25.49 
 
 		 491 aa  100  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  26.08 
 
 		 463 aa  100  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  25.65 
 
 		 603 aa  100  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.54237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>