More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2949 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  100 
 
 		 500 aa  969    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  52.28 
 
 		 508 aa  464  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  53.91 
 
 		 507 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  53.12 
 
 		 461 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  53.12 
 
 		 461 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  48.84 
 
 		 460 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04330  Na+/proline symporter  51.8 
 
 		 497 aa  404  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.723621  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  47.55 
 
 		 459 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  49.68 
 
 		 463 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  45.7 
 
 		 459 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  45.91 
 
 		 459 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  49.25 
 
 		 463 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  48.61 
 
 		 462 aa  392  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  45.84 
 
 		 459 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  49.26 
 
 		 463 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  45.63 
 
 		 459 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  45.82 
 
 		 479 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  37.5 
 
 		 472 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  36.82 
 
 		 483 aa  290  4e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  32.23 
 
 		 474 aa  200  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  28.63 
 
 		 483 aa  180  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  31.34 
 
 		 483 aa  166  9e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  28.69 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  29.25 
 
 		 486 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  29.23 
 
 		 462 aa  148  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  29.68 
 
 		 487 aa  146  7.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  30.19 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  30.95 
 
 		 461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.85 
 
 		 484 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  29.12 
 
 		 460 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  28.83 
 
 		 506 aa  127  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  29.48 
 
 		 479 aa  126  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  26.54 
 
 		 523 aa  123  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  28.57 
 
 		 486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  26.48 
 
 		 452 aa  121  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  27.6 
 
 		 483 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  26.16 
 
 		 510 aa  119  9e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  26.84 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  27.51 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  26.04 
 
 		 524 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  27.39 
 
 		 515 aa  114  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.91 
 
 		 526 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  29.69 
 
 		 475 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  26.23 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  26.42 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  25.54 
 
 		 500 aa  108  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  27.22 
 
 		 505 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  27.22 
 
 		 505 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  27.22 
 
 		 505 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  24.71 
 
 		 492 aa  107  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  26.91 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  26.45 
 
 		 479 aa  105  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  26.02 
 
 		 475 aa  104  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  25.96 
 
 		 489 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  28.34 
 
 		 492 aa  103  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  27.49 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  28.08 
 
 		 478 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  25.76 
 
 		 490 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  25.77 
 
 		 489 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  27.79 
 
 		 478 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  29.19 
 
 		 495 aa  101  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  27.95 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  27.03 
 
 		 446 aa  101  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0672  Na+/solute symporter  26.44 
 
 		 633 aa  101  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.38 
 
 		 489 aa  100  8e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  28.4 
 
 		 485 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  25.9 
 
 		 463 aa  99  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  26.42 
 
 		 492 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  25.1 
 
 		 492 aa  97.8  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  24.68 
 
 		 449 aa  97.8  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  25.1 
 
 		 492 aa  96.3  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  24.77 
 
 		 527 aa  95.9  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1755  hypothetical protein  28.12 
 
 		 577 aa  95.9  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  25.74 
 
 		 482 aa  95.5  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  28.04 
 
 		 484 aa  94.4  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1358  Na+/solute symporter  27.2 
 
 		 587 aa  94.7  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00027915  normal  0.0566975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3294  Na+/solute symporter  27.49 
 
 		 469 aa  94  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  26.63 
 
 		 492 aa  94  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  26.63 
 
 		 492 aa  94  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  26.63 
 
 		 492 aa  94  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.65 
 
 		 492 aa  93.6  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.85 
 
 		 492 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  26.65 
 
 		 492 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  26.65 
 
 		 492 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1384  sodium:solute symporter family protein  27.68 
 
 		 588 aa  93.6  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  24.51 
 
 		 492 aa  93.2  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  23.63 
 
 		 537 aa  93.2  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  24.8 
 
 		 483 aa  92  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.95 
 
 		 567 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  26.67 
 
 		 599 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  23.97 
 
 		 483 aa  92  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  25.41 
 
 		 483 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1011  Na+/proline symporter  27.72 
 
 		 583 aa  91.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1569  hypothetical protein  24.76 
 
 		 468 aa  91.3  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18811  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  27.46 
 
 		 583 aa  90.1  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0257597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  26.68 
 
 		 488 aa  90.1  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  25.82 
 
 		 517 aa  90.1  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  26.36 
 
 		 481 aa  89.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  26.5 
 
 		 479 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  27.44 
 
 		 586 aa  89.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>