More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2204 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 
537 aa  1061    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  59.47 
 
 
550 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  54.95 
 
 
567 aa  593  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  52.31 
 
 
593 aa  566  1e-160  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  49.55 
 
 
562 aa  495  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  49.73 
 
 
560 aa  486  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.86 
 
 
613 aa  484  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  47.15 
 
 
565 aa  473  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  48.59 
 
 
566 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  46.78 
 
 
564 aa  459  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  45.13 
 
 
569 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  27.32 
 
 
551 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  29.29 
 
 
557 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  30.13 
 
 
545 aa  190  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.14 
 
 
520 aa  188  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  28.62 
 
 
557 aa  187  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.09 
 
 
522 aa  186  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  29.05 
 
 
592 aa  186  9e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  29.68 
 
 
520 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.28 
 
 
565 aa  184  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.54 
 
 
520 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  26.51 
 
 
551 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  27.97 
 
 
562 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.42 
 
 
533 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.02 
 
 
548 aa  180  7e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  27.94 
 
 
539 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  27.31 
 
 
520 aa  178  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.31 
 
 
523 aa  178  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  28.05 
 
 
520 aa  176  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.92 
 
 
519 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  27.52 
 
 
549 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.75 
 
 
522 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.9 
 
 
561 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  25.96 
 
 
565 aa  173  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  28.26 
 
 
523 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  26.94 
 
 
530 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.27 
 
 
526 aa  169  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.08 
 
 
522 aa  167  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  28.05 
 
 
472 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  27.92 
 
 
561 aa  166  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.57 
 
 
542 aa  162  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  28.63 
 
 
568 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.73 
 
 
522 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  26.7 
 
 
509 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  28.13 
 
 
561 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  27.82 
 
 
474 aa  151  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.27 
 
 
526 aa  151  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  28.18 
 
 
529 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  26.86 
 
 
598 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  27.39 
 
 
551 aa  135  3e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  28.84 
 
 
596 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  24.83 
 
 
513 aa  130  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  25.6 
 
 
571 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  25.6 
 
 
571 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  25.6 
 
 
571 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  25.6 
 
 
571 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  26.4 
 
 
536 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  25.8 
 
 
513 aa  127  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  25.36 
 
 
571 aa  128  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  25.12 
 
 
571 aa  126  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  27.88 
 
 
529 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  26.12 
 
 
523 aa  124  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  24.82 
 
 
581 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.25 
 
 
526 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  23.68 
 
 
461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  25.17 
 
 
531 aa  114  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  25.52 
 
 
530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0303  Na+/solute symporter  24.58 
 
 
596 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  25.84 
 
 
522 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0129  Na+/solute symporter  25.11 
 
 
596 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  25.54 
 
 
520 aa  107  8e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.3 
 
 
474 aa  107  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.86 
 
 
474 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  22.27 
 
 
597 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.66 
 
 
483 aa  104  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  24.11 
 
 
498 aa  104  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  25.5 
 
 
476 aa  103  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  22.62 
 
 
483 aa  102  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  24.3 
 
 
486 aa  102  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  26.86 
 
 
638 aa  101  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  24.11 
 
 
462 aa  100  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.1 
 
 
473 aa  100  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.03 
 
 
574 aa  99.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  23.62 
 
 
575 aa  98.2  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  24.78 
 
 
483 aa  98.2  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  22.84 
 
 
599 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  23.36 
 
 
562 aa  98.2  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  23.14 
 
 
532 aa  97.1  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  24.2 
 
 
556 aa  96.7  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0970  SSS sodium solute transporter superfamily  26.11 
 
 
765 aa  96.3  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000363528  normal  0.258421 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.66 
 
 
892 aa  95.9  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  24.71 
 
 
603 aa  95.5  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  23.35 
 
 
505 aa  95.1  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  23.5 
 
 
459 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  23.62 
 
 
484 aa  94.4  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  22.4 
 
 
509 aa  94.4  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  23.5 
 
 
459 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  24.48 
 
 
468 aa  94  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  24.31 
 
 
517 aa  94  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  23.35 
 
 
505 aa  93.6  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>