More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0672 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0672  Na+/solute symporter  100 
 
 		 633 aa  1259    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  46.83 
 
 		 638 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  46.32 
 
 		 639 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  26.99 
 
 		 464 aa  124  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  28.73 
 
 		 484 aa  116  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  23.82 
 
 		 599 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05410  Sodium:solute symporter  27.27 
 
 		 542 aa  115  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000184365  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  25.62 
 
 		 461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.04 
 
 		 504 aa  113  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  25.6 
 
 		 524 aa  108  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.29 
 
 		 492 aa  108  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  23.33 
 
 		 498 aa  107  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  26.09 
 
 		 492 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  26.09 
 
 		 492 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  26.09 
 
 		 492 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  26.09 
 
 		 492 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  25.56 
 
 		 492 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  26.09 
 
 		 492 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  25.52 
 
 		 461 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  23.28 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  25.88 
 
 		 492 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0638  Na+/solute symporter  25 
 
 		 538 aa  104  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  24.74 
 
 		 488 aa  104  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  26.03 
 
 		 492 aa  104  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  25.1 
 
 		 483 aa  103  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  24.89 
 
 		 498 aa  103  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  25.52 
 
 		 497 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  26.41 
 
 		 493 aa  101  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  25.86 
 
 		 518 aa  100  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  25.96 
 
 		 463 aa  100  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.07 
 
 		 483 aa  100  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  24.19 
 
 		 500 aa  100  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  23.86 
 
 		 472 aa  100  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  26.24 
 
 		 492 aa  100  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  25.91 
 
 		 483 aa  100  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  25.84 
 
 		 495 aa  99.8  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  26.83 
 
 		 488 aa  98.6  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  24.61 
 
 		 496 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  27.13 
 
 		 500 aa  98.2  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2908  Na+/solute symporter  23.63 
 
 		 509 aa  97.8  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.83 
 
 		 504 aa  98.2  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  26.91 
 
 		 523 aa  97.4  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  24.74 
 
 		 483 aa  97.1  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  24.58 
 
 		 492 aa  97.1  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  25 
 
 		 507 aa  96.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  26.95 
 
 		 460 aa  96.3  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  24.19 
 
 		 492 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  23.65 
 
 		 508 aa  95.9  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1575  Sodium/proline symporter  26.7 
 
 		 498 aa  95.5  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0675536  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  24.05 
 
 		 459 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  24.54 
 
 		 487 aa  95.5  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  24.71 
 
 		 492 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  25.71 
 
 		 527 aa  94.7  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  26.02 
 
 		 496 aa  94.4  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  26.24 
 
 		 492 aa  93.6  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  24.65 
 
 		 537 aa  93.6  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  23.15 
 
 		 482 aa  93.2  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.16 
 
 		 567 aa  93.2  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  25.57 
 
 		 479 aa  93.6  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  25.46 
 
 		 483 aa  92.8  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  25.2 
 
 		 508 aa  92.4  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1229  sodium/proline symporter  24.45 
 
 		 504 aa  92.4  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0518  sodium/solute symporter family protein  24.04 
 
 		 507 aa  91.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  22.65 
 
 		 463 aa  92  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  25.45 
 
 		 510 aa  92  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  24.49 
 
 		 492 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  24.03 
 
 		 492 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3031  Na+/solute symporter  24.53 
 
 		 509 aa  91.3  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000436384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  23.4 
 
 		 463 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  24.03 
 
 		 492 aa  91.3  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  24.45 
 
 		 486 aa  91.3  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  24.03 
 
 		 492 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  24.03 
 
 		 493 aa  90.9  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  24.03 
 
 		 493 aa  90.5  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  24.03 
 
 		 493 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  27.46 
 
 		 474 aa  90.9  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  25.64 
 
 		 482 aa  90.9  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  23.8 
 
 		 476 aa  90.5  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  24.25 
 
 		 588 aa  90.1  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  24.39 
 
 		 511 aa  89  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2137  SSS sodium solute transporter superfamily  24.32 
 
 		 528 aa  89.4  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00565072  normal  0.610314 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0817  proline permease  24.6 
 
 		 498 aa  88.6  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  24.72 
 
 		 498 aa  88.6  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  22.53 
 
 		 459 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  24.02 
 
 		 482 aa  88.6  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  24.05 
 
 		 459 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  23.73 
 
 		 459 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  23.73 
 
 		 459 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  22.83 
 
 		 491 aa  88.2  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  26.39 
 
 		 492 aa  87.4  8e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  22.15 
 
 		 493 aa  87  8e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1358  Na+/solute symporter  24.9 
 
 		 587 aa  87  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00027915  normal  0.0566975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  23.82 
 
 		 492 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  22.2 
 
 		 487 aa  87  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.42 
 
 		 542 aa  86.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  22.99 
 
 		 489 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  24.43 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1278  Na+/solute symporter  23.71 
 
 		 473 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000360509  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  24.43 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  22.22 
 
 		 586 aa  85.9  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>