More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3031 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0518  sodium/solute symporter family protein  86.84 
 
 		 507 aa  847    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2702  Na+/solute symporter  69.54 
 
 		 506 aa  664    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000021967 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3031  Na+/solute symporter  100 
 
 		 509 aa  996    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000436384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1514  Na+/solute symporter  68.94 
 
 		 506 aa  645    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0973  Na+/solute symporter  76.03 
 
 		 509 aa  758    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2908  Na+/solute symporter  61.34 
 
 		 509 aa  593  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0974  putative sodium symporter protein  40.91 
 
 		 560 aa  372  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1223  Na+/solute symporter  41.71 
 
 		 562 aa  375  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.704891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1308  Na+/solute symporter  41.63 
 
 		 586 aa  375  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3165  putative sodium symporter protein  42.08 
 
 		 553 aa  368  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1496  Na+/solute symporter  36.06 
 
 		 558 aa  296  7e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289055  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  36.79 
 
 		 729 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1177  Na+/solute symporter  34.64 
 
 		 559 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  32.21 
 
 		 573 aa  276  7e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3406  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.03 
 
 		 560 aa  275  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210868 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  34.17 
 
 		 566 aa  271  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4040  putative sodium symporter protein  34.38 
 
 		 551 aa  268  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0630  sodium:solute symporter family protein  34.05 
 
 		 591 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2479  putative sodium symporter protein  32.03 
 
 		 593 aa  264  4e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.025526 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  32.34 
 
 		 586 aa  262  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1298  SSS sodium solute transporter superfamily  33.45 
 
 		 575 aa  262  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.883366 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4790  SSS sodium solute transporter superfamily  33.64 
 
 		 563 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  32.08 
 
 		 568 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  31.59 
 
 		 567 aa  251  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  31.46 
 
 		 572 aa  246  6e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002207  acetate permease ActP (cation/acetate symporter)  33.76 
 
 		 575 aa  246  6.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00160  sodium/solute symporter  33.89 
 
 		 575 aa  246  6.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2278  putative sodium/solute symporter  31.33 
 
 		 567 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  33.07 
 
 		 572 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  31.63 
 
 		 572 aa  243  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  33.07 
 
 		 572 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  32.88 
 
 		 578 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  32.88 
 
 		 578 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  32.88 
 
 		 578 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  32.88 
 
 		 578 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4101  Na+/solute symporter  32.12 
 
 		 589 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  32.5 
 
 		 578 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  31.63 
 
 		 572 aa  238  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  32.07 
 
 		 572 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1514  Na+/solute symporter  32.88 
 
 		 578 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1581  Na+/solute symporter  32.88 
 
 		 578 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.292931  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  32.88 
 
 		 578 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  33.07 
 
 		 578 aa  234  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.57 
 
 		 582 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  32.09 
 
 		 572 aa  232  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  30.14 
 
 		 614 aa  226  9e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0900  Na+/solute symporter  33.04 
 
 		 588 aa  223  8e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  33.73 
 
 		 582 aa  223  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  33.53 
 
 		 582 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  38.92 
 
 		 760 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  38.11 
 
 		 759 aa  206  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  35.9 
 
 		 722 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4952  sodium/solute symporter family protein  31.44 
 
 		 596 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  36.18 
 
 		 722 aa  203  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2047  Na+/solute symporter  33.02 
 
 		 548 aa  202  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.91078  normal  0.880017 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0486  sodium:solute symporter family protein  39.6 
 
 		 594 aa  190  4e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  31.63 
 
 		 513 aa  187  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1794  Na+/solute symporter  39.86 
 
 		 594 aa  186  7e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0136163  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1263  Na+/solute symporter  34.29 
 
 		 618 aa  186  9e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  37.62 
 
 		 591 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  33.01 
 
 		 719 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0279  Na+/solute symporter  38.93 
 
 		 622 aa  186  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0772633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1651  Na+/solute symporter  38.67 
 
 		 590 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.466603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1439  Na+ symporter  38.08 
 
 		 588 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2254  Na+/solute symporter  36.79 
 
 		 622 aa  183  6e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.61978  normal  0.0640181 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1960  SSS family Na(+)/solute symporter  36.79 
 
 		 622 aa  183  7e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.753241 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2050  Na+/solute symporter  36.6 
 
 		 593 aa  183  8.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500291 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1771  Na+/solute symporter  39.6 
 
 		 589 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.509872 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  36 
 
 		 592 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3666  Na+/solute symporter  38.26 
 
 		 594 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1042  Na+/solute symporter  38.05 
 
 		 609 aa  179  9e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972047  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0088  sodium:solute symporter family protein  37.29 
 
 		 604 aa  179  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208798 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3155  ribonuclease E and G  37.24 
 
 		 589 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3556  sodium/solute symporter family protein  36.75 
 
 		 598 aa  178  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4552  Na+/solute symporter  35.88 
 
 		 603 aa  176  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0871  Na+/solute symporter  36.33 
 
 		 593 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5743  putative sodium symporter protein  36.36 
 
 		 619 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1118  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.93 
 
 		 552 aa  171  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.191913  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  30.77 
 
 		 516 aa  171  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0576  Na+/solute symporter  37.05 
 
 		 605 aa  171  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2229  Na+/solute symporter  37.05 
 
 		 605 aa  171  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.164942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  36.61 
 
 		 637 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0507  Na+/solute symporter  35.86 
 
 		 605 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.318357  normal  0.0591632 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  30.56 
 
 		 516 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.56 
 
 		 516 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.16 
 
 		 515 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  30.56 
 
 		 516 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  30.56 
 
 		 516 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  30.56 
 
 		 516 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.44 
 
 		 539 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  30.56 
 
 		 516 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  29.14 
 
 		 516 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  30.34 
 
 		 516 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  30.56 
 
 		 516 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  31.65 
 
 		 515 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  31.18 
 
 		 513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  31.59 
 
 		 554 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.34 
 
 		 516 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  38.91 
 
 		 681 aa  163  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  31.54 
 
 		 519 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>