More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0630 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5743  putative sodium symporter protein  59.55 
 
 
619 aa  645    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  58.87 
 
 
578 aa  650    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  58.87 
 
 
578 aa  650    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  59.8 
 
 
578 aa  657    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1794  Na+/solute symporter  62.75 
 
 
594 aa  721    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0136163  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  60.47 
 
 
586 aa  672    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  58.54 
 
 
572 aa  661    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  58.87 
 
 
578 aa  650    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1177  Na+/solute symporter  63.25 
 
 
559 aa  677    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  59.2 
 
 
572 aa  665    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4790  SSS sodium solute transporter superfamily  61.76 
 
 
563 aa  654    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  58.87 
 
 
572 aa  668    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0486  sodium:solute symporter family protein  63.95 
 
 
594 aa  713    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355483  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2479  putative sodium symporter protein  76.1 
 
 
593 aa  922    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.025526 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0630  sodium:solute symporter family protein  100 
 
 
591 aa  1181    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  59.57 
 
 
567 aa  665    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  59.37 
 
 
572 aa  666    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4040  putative sodium symporter protein  60.85 
 
 
551 aa  655    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1651  Na+/solute symporter  66 
 
 
590 aa  759    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.466603  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1298  SSS sodium solute transporter superfamily  60.03 
 
 
575 aa  637    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.883366 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  58.87 
 
 
578 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  59.2 
 
 
568 aa  664    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  59.77 
 
 
578 aa  652    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  59.54 
 
 
573 aa  692    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3406  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  62.44 
 
 
560 aa  683    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210868 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1514  Na+/solute symporter  60.27 
 
 
578 aa  654    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0136717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1581  Na+/solute symporter  60.1 
 
 
578 aa  653    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.292931  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  59.04 
 
 
572 aa  665    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  77.66 
 
 
591 aa  910    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1771  Na+/solute symporter  64.49 
 
 
589 aa  739    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.509872 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1042  Na+/solute symporter  59.45 
 
 
609 aa  678    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972047  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  60.3 
 
 
578 aa  657    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  60.17 
 
 
572 aa  662    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2278  putative sodium/solute symporter  59.23 
 
 
567 aa  652    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  57.85 
 
 
572 aa  652    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0088  sodium:solute symporter family protein  57.77 
 
 
604 aa  628  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.208798 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  56.69 
 
 
566 aa  616  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00160  sodium/solute symporter  56.34 
 
 
575 aa  608  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002207  acetate permease ActP (cation/acetate symporter)  56.49 
 
 
575 aa  611  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3155  ribonuclease E and G  55.76 
 
 
589 aa  609  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2050  Na+/solute symporter  53.48 
 
 
593 aa  610  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500291 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  54.06 
 
 
592 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4952  sodium/solute symporter family protein  54.97 
 
 
596 aa  592  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1496  Na+/solute symporter  56.08 
 
 
558 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289055  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1439  Na+ symporter  53.58 
 
 
588 aa  574  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4101  Na+/solute symporter  53.11 
 
 
589 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1960  SSS family Na(+)/solute symporter  52.62 
 
 
622 aa  569  1e-161  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.753241 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  55.72 
 
 
582 aa  568  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2254  Na+/solute symporter  52.46 
 
 
622 aa  568  1e-160  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.61978  normal  0.0640181 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1263  Na+/solute symporter  51.19 
 
 
618 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625499  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4552  Na+/solute symporter  51.94 
 
 
603 aa  565  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0279  Na+/solute symporter  51.99 
 
 
622 aa  560  1e-158  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0772633  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  55.89 
 
 
582 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  55.89 
 
 
582 aa  555  1e-156  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3556  sodium/solute symporter family protein  51.71 
 
 
598 aa  548  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0871  Na+/solute symporter  50.97 
 
 
593 aa  543  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0900  Na+/solute symporter  52.71 
 
 
588 aa  544  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3666  Na+/solute symporter  51.24 
 
 
594 aa  523  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0507  Na+/solute symporter  53.75 
 
 
605 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.318357  normal  0.0591632 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2047  Na+/solute symporter  53.81 
 
 
548 aa  518  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.91078  normal  0.880017 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2229  Na+/solute symporter  53.17 
 
 
605 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.164942  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0576  Na+/solute symporter  53.17 
 
 
605 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  42.3 
 
 
722 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  39.55 
 
 
637 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  41.58 
 
 
729 aa  419  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  41.97 
 
 
722 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  40.4 
 
 
759 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  40.65 
 
 
719 aa  397  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  41.21 
 
 
760 aa  379  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  39.4 
 
 
614 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  36.68 
 
 
687 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0518  sodium/solute symporter family protein  35.83 
 
 
507 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3031  Na+/solute symporter  34.77 
 
 
509 aa  274  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000436384  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0974  putative sodium symporter protein  32.39 
 
 
560 aa  274  3e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0973  Na+/solute symporter  34.94 
 
 
509 aa  271  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2702  Na+/solute symporter  34.58 
 
 
506 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000021967 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1223  Na+/solute symporter  32.23 
 
 
562 aa  248  3e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.704891  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2908  Na+/solute symporter  31.15 
 
 
509 aa  239  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  40.11 
 
 
681 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  37.24 
 
 
678 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1525  putative membrane transport protein  39.71 
 
 
713 aa  207  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4144  Na+/solute symporter  38.75 
 
 
705 aa  206  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269765  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3039  Na+/solute symporter  38.95 
 
 
703 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  36.22 
 
 
687 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  42.35 
 
 
683 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  37.57 
 
 
688 aa  200  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2396  Na+/solute symporter  47.98 
 
 
726 aa  195  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.8 
 
 
672 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2228  Na+/solute symporter  43.16 
 
 
683 aa  192  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2831  Na+/solute symporter  36.03 
 
 
703 aa  190  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1308  Na+/solute symporter  38.69 
 
 
586 aa  187  6e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  36.59 
 
 
671 aa  186  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1514  Na+/solute symporter  39.23 
 
 
506 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1418  Na+/solute symporter  35.37 
 
 
672 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181341 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1079  sodium:solute symporter family protein  41.99 
 
 
671 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1792  sodium:solute symporter family protein  41.99 
 
 
671 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.415447  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0786  solute/sodium symporter (SSS) family protein  41.99 
 
 
671 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1940  sodium:solute symporter family protein  41.99 
 
 
807 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0630  solute/sodium symporter (SSS) family protein  41.99 
 
 
671 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449761  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2052  solute/sodium symporter (SSS) family protein  41.99 
 
 
671 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>