More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0279 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1651  Na+/solute symporter  58.63 
 
 		 590 aa  645    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.466603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1794  Na+/solute symporter  57.72 
 
 		 594 aa  641    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0136163  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4952  sodium/solute symporter family protein  60.94 
 
 		 596 aa  685    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4101  Na+/solute symporter  73.79 
 
 		 589 aa  890    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3556  sodium/solute symporter family protein  68.67 
 
 		 598 aa  793    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  55.18 
 
 		 572 aa  637    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1960  SSS family Na(+)/solute symporter  85.85 
 
 		 622 aa  1035    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.753241 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0279  Na+/solute symporter  100 
 
 		 622 aa  1239    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0772633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2229  Na+/solute symporter  65.52 
 
 		 605 aa  743    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.164942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0088  sodium:solute symporter family protein  62 
 
 		 604 aa  679    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208798 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0576  Na+/solute symporter  65.52 
 
 		 605 aa  743    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  63 
 
 		 592 aa  739    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0486  sodium:solute symporter family protein  59.71 
 
 		 594 aa  645    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  56.7 
 
 		 568 aa  660    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0507  Na+/solute symporter  65.2 
 
 		 605 aa  738    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.318357  normal  0.0591632 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002207  acetate permease ActP (cation/acetate symporter)  63.52 
 
 		 575 aa  716    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3155  ribonuclease E and G  64.15 
 
 		 589 aa  749    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1263  Na+/solute symporter  62.23 
 
 		 618 aa  729    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625499  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0871  Na+/solute symporter  73.22 
 
 		 593 aa  873    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2254  Na+/solute symporter  86.01 
 
 		 622 aa  1038    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.61978  normal  0.0640181 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3666  Na+/solute symporter  67.3 
 
 		 594 aa  780    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2278  putative sodium/solute symporter  57.93 
 
 		 567 aa  639    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  56.52 
 
 		 573 aa  672    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2050  Na+/solute symporter  62.58 
 
 		 593 aa  737    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  55.02 
 
 		 572 aa  638    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1771  Na+/solute symporter  58.96 
 
 		 589 aa  646    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.509872 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1439  Na+ symporter  77.33 
 
 		 588 aa  915    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  55.99 
 
 		 567 aa  645    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1042  Na+/solute symporter  58.16 
 
 		 609 aa  668    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972047  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00160  sodium/solute symporter  62.72 
 
 		 575 aa  713    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4552  Na+/solute symporter  66.03 
 
 		 603 aa  779    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  54.7 
 
 		 572 aa  637    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0900  Na+/solute symporter  75.4 
 
 		 588 aa  884    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  55.31 
 
 		 578 aa  632  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  54.86 
 
 		 572 aa  634  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  55.18 
 
 		 578 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  55.18 
 
 		 578 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  54.23 
 
 		 572 aa  629  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  55.5 
 
 		 572 aa  631  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  55.18 
 
 		 578 aa  628  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  55.18 
 
 		 578 aa  628  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  52.95 
 
 		 572 aa  625  1e-178  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  54.66 
 
 		 578 aa  623  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  54.34 
 
 		 578 aa  619  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1514  Na+/solute symporter  54.5 
 
 		 578 aa  621  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1581  Na+/solute symporter  54.34 
 
 		 578 aa  620  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.292931  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2479  putative sodium symporter protein  53.61 
 
 		 593 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.025526 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  55.41 
 
 		 566 aa  613  9.999999999999999e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  53.16 
 
 		 586 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  53.62 
 
 		 591 aa  569  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0630  sodium:solute symporter family protein  52.46 
 
 		 591 aa  550  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1298  SSS sodium solute transporter superfamily  52.03 
 
 		 575 aa  534  1e-150  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.883366 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3406  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  50 
 
 		 560 aa  529  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1177  Na+/solute symporter  50.66 
 
 		 559 aa  528  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  50.49 
 
 		 582 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  50.65 
 
 		 582 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  50.97 
 
 		 582 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5743  putative sodium symporter protein  49.84 
 
 		 619 aa  508  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4040  putative sodium symporter protein  49.02 
 
 		 551 aa  503  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4790  SSS sodium solute transporter superfamily  49.6 
 
 		 563 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1496  Na+/solute symporter  46.68 
 
 		 558 aa  462  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289055  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2047  Na+/solute symporter  45.08 
 
 		 548 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.91078  normal  0.880017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  40.65 
 
 		 722 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  37.29 
 
 		 637 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  39.85 
 
 		 719 aa  363  4e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  37.36 
 
 		 729 aa  352  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  37.64 
 
 		 759 aa  336  7.999999999999999e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  36.36 
 
 		 614 aa  324  3e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  37.22 
 
 		 760 aa  322  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  55.39 
 
 		 722 aa  213  7.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  48.54 
 
 		 681 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1525  putative membrane transport protein  48.76 
 
 		 713 aa  194  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4144  Na+/solute symporter  47.76 
 
 		 705 aa  192  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269765  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0973  Na+/solute symporter  42.59 
 
 		 509 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0518  sodium/solute symporter family protein  41.63 
 
 		 507 aa  186  9e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3039  Na+/solute symporter  45.19 
 
 		 703 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  50 
 
 		 678 aa  185  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2396  Na+/solute symporter  43.2 
 
 		 726 aa  180  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  29.66 
 
 		 577 aa  177  7e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3165  putative sodium symporter protein  36.75 
 
 		 553 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0866  putative membrane transport protein  44.78 
 
 		 699 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.201818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2908  Na+/solute symporter  35.95 
 
 		 509 aa  172  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1940  sodium:solute symporter family protein  44.28 
 
 		 807 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  44.28 
 
 		 671 aa  171  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2052  solute/sodium symporter (SSS) family protein  44.28 
 
 		 671 aa  171  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483179  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0630  solute/sodium symporter (SSS) family protein  44.28 
 
 		 671 aa  171  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449761  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1792  sodium:solute symporter family protein  44.28 
 
 		 671 aa  171  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.415447  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1079  sodium:solute symporter family protein  44.28 
 
 		 671 aa  171  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2052  Na+/solute symporter  42.45 
 
 		 702 aa  171  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.698797  normal  0.324787 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0532  solute/sodium symporter (SSS) family protein  44.28 
 
 		 671 aa  171  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0786  solute/sodium symporter (SSS) family protein  44.28 
 
 		 671 aa  171  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1087  Na+/solute symporter  43.78 
 
 		 671 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.215072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2107  Na+/solute symporter  43.78 
 
 		 671 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2214  Na+/solute symporter  43.78 
 
 		 671 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5888  Na+/solute symporter  43.78 
 
 		 671 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2228  Na+/solute symporter  43.78 
 
 		 671 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2189  Na+/solute symporter  43.78 
 
 		 671 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.79 
 
 		 672 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5518  Na+/solute symporter  36.99 
 
 		 671 aa  169  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3031  Na+/solute symporter  40.08 
 
 		 509 aa  167  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000436384  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>