More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0245 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 
729 aa  1435    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  51.63 
 
 
760 aa  637    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  50.26 
 
 
759 aa  674    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  50.5 
 
 
719 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  48.22 
 
 
722 aa  581  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  48.64 
 
 
722 aa  570  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  46.82 
 
 
637 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2479  putative sodium symporter protein  43.64 
 
 
593 aa  451  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.025526 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  44.86 
 
 
614 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  42.55 
 
 
573 aa  437  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3406  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.93 
 
 
560 aa  428  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210868 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  43.01 
 
 
568 aa  424  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1177  Na+/solute symporter  45.34 
 
 
559 aa  422  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1651  Na+/solute symporter  41.68 
 
 
590 aa  415  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.466603  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1298  SSS sodium solute transporter superfamily  43.95 
 
 
575 aa  413  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.883366 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4040  putative sodium symporter protein  44.65 
 
 
551 aa  414  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1496  Na+/solute symporter  45.21 
 
 
558 aa  414  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289055  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  42.81 
 
 
566 aa  409  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1042  Na+/solute symporter  40.77 
 
 
609 aa  409  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972047  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0486  sodium:solute symporter family protein  41.84 
 
 
594 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355483  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1771  Na+/solute symporter  40.89 
 
 
589 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.509872 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  41.9 
 
 
586 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1794  Na+/solute symporter  41.67 
 
 
594 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0136163  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  41.76 
 
 
567 aa  397  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  41.49 
 
 
572 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  41.75 
 
 
591 aa  398  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  41.5 
 
 
572 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4790  SSS sodium solute transporter superfamily  42.96 
 
 
563 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2050  Na+/solute symporter  40.51 
 
 
593 aa  399  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500291 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  40.75 
 
 
572 aa  398  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  42.02 
 
 
578 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  42.02 
 
 
578 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  42.02 
 
 
578 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  42.38 
 
 
578 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  42.02 
 
 
578 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  41.22 
 
 
592 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1514  Na+/solute symporter  41.84 
 
 
578 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0136717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1581  Na+/solute symporter  41.84 
 
 
578 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.292931  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  42.42 
 
 
572 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  41.14 
 
 
572 aa  393  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  41.67 
 
 
578 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  41.4 
 
 
572 aa  395  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  41.79 
 
 
572 aa  395  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  41.31 
 
 
578 aa  389  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0630  sodium:solute symporter family protein  41.58 
 
 
591 aa  389  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2278  putative sodium/solute symporter  41.76 
 
 
567 aa  388  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00160  sodium/solute symporter  42.37 
 
 
575 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002207  acetate permease ActP (cation/acetate symporter)  42.73 
 
 
575 aa  383  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1439  Na+ symporter  40.62 
 
 
588 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5743  putative sodium symporter protein  42.4 
 
 
619 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3155  ribonuclease E and G  42.03 
 
 
589 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4552  Na+/solute symporter  40.68 
 
 
603 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.69 
 
 
582 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4101  Na+/solute symporter  39.21 
 
 
589 aa  361  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1263  Na+/solute symporter  38.8 
 
 
618 aa  359  9e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  43.64 
 
 
582 aa  356  7.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0279  Na+/solute symporter  38.01 
 
 
622 aa  354  2e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0772633  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  43.64 
 
 
582 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0088  sodium:solute symporter family protein  39.06 
 
 
604 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.208798 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0871  Na+/solute symporter  39.73 
 
 
593 aa  353  8.999999999999999e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0900  Na+/solute symporter  39.24 
 
 
588 aa  352  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3556  sodium/solute symporter family protein  40.27 
 
 
598 aa  352  2e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4952  sodium/solute symporter family protein  38.37 
 
 
596 aa  346  8e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3666  Na+/solute symporter  38.83 
 
 
594 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1960  SSS family Na(+)/solute symporter  36.45 
 
 
622 aa  336  7e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.753241 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2254  Na+/solute symporter  36.78 
 
 
622 aa  336  7.999999999999999e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.61978  normal  0.0640181 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2047  Na+/solute symporter  42.94 
 
 
548 aa  336  7.999999999999999e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.91078  normal  0.880017 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0507  Na+/solute symporter  39.42 
 
 
605 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.318357  normal  0.0591632 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0576  Na+/solute symporter  39.42 
 
 
605 aa  320  6e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2229  Na+/solute symporter  39.42 
 
 
605 aa  320  6e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.164942  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0518  sodium/solute symporter family protein  36.97 
 
 
507 aa  294  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0973  Na+/solute symporter  37.26 
 
 
509 aa  295  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2702  Na+/solute symporter  37.64 
 
 
506 aa  275  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000021967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1514  Na+/solute symporter  37.33 
 
 
506 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3031  Na+/solute symporter  36.79 
 
 
509 aa  265  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000436384  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  53.82 
 
 
678 aa  263  8e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  50.6 
 
 
681 aa  260  6e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3039  Na+/solute symporter  50.97 
 
 
703 aa  256  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0974  putative sodium symporter protein  34.93 
 
 
560 aa  254  5.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4144  Na+/solute symporter  50 
 
 
705 aa  253  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269765  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2831  Na+/solute symporter  47.62 
 
 
703 aa  253  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2908  Na+/solute symporter  35.19 
 
 
509 aa  251  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1525  putative membrane transport protein  52.23 
 
 
713 aa  251  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1223  Na+/solute symporter  34.55 
 
 
562 aa  248  3e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.704891  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3165  putative sodium symporter protein  34.15 
 
 
553 aa  244  3e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1308  Na+/solute symporter  34.66 
 
 
586 aa  244  5e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  46.24 
 
 
683 aa  238  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0866  putative membrane transport protein  46.67 
 
 
699 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.201818  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2396  Na+/solute symporter  50.9 
 
 
726 aa  233  7.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2228  Na+/solute symporter  44.53 
 
 
683 aa  230  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.44 
 
 
672 aa  226  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5062  Na+/solute symporter  44.97 
 
 
699 aa  225  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  43.41 
 
 
687 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  43.09 
 
 
687 aa  223  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  43.41 
 
 
688 aa  221  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1418  Na+/solute symporter  42.49 
 
 
672 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2052  Na+/solute symporter  46.06 
 
 
702 aa  215  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.698797  normal  0.324787 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  44 
 
 
671 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2192  Na+/solute symporter  40.9 
 
 
769 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.560167  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3111  solute/Na+ symporter  44.4 
 
 
672 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392033  decreased coverage  0.0000204813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>