More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1951 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1087  Na+/solute symporter  60.83 
 
 		 671 aa  759    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.215072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  90.52 
 
 		 687 aa  1247    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0630  solute/sodium symporter (SSS) family protein  62.26 
 
 		 671 aa  793    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449761  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  100 
 
 		 688 aa  1378    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  62.78 
 
 		 672 aa  819    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  91.11 
 
 		 687 aa  1250    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1792  sodium:solute symporter family protein  61.87 
 
 		 671 aa  786    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.415447  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  52.83 
 
 		 678 aa  642    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1418  Na+/solute symporter  63.66 
 
 		 672 aa  822    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2228  Na+/solute symporter  76.84 
 
 		 683 aa  1025    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1079  sodium:solute symporter family protein  61.87 
 
 		 671 aa  786    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1940  sodium:solute symporter family protein  62.11 
 
 		 807 aa  788    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5518  Na+/solute symporter  60.98 
 
 		 671 aa  775    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0532  solute/sodium symporter (SSS) family protein  62.26 
 
 		 671 aa  791    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  61.72 
 
 		 671 aa  791    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3111  solute/Na+ symporter  64.11 
 
 		 672 aa  825    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392033  decreased coverage  0.0000204813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  77.03 
 
 		 683 aa  1042    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5888  Na+/solute symporter  61.28 
 
 		 671 aa  776    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2052  solute/sodium symporter (SSS) family protein  61.87 
 
 		 671 aa  786    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483179  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2228  Na+/solute symporter  59.94 
 
 		 671 aa  754    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2107  Na+/solute symporter  60.53 
 
 		 671 aa  757    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0786  solute/sodium symporter (SSS) family protein  61.87 
 
 		 671 aa  786    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2189  Na+/solute symporter  61.28 
 
 		 671 aa  776    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  55.54 
 
 		 681 aa  684    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2214  Na+/solute symporter  61.28 
 
 		 671 aa  776    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4144  Na+/solute symporter  50.93 
 
 		 705 aa  634  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269765  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3039  Na+/solute symporter  51.37 
 
 		 703 aa  625  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1525  putative membrane transport protein  51.74 
 
 		 713 aa  625  1e-178  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2831  Na+/solute symporter  50.29 
 
 		 703 aa  621  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2396  Na+/solute symporter  49.93 
 
 		 726 aa  588  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2052  Na+/solute symporter  47.61 
 
 		 702 aa  580  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.698797  normal  0.324787 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0866  putative membrane transport protein  49.93 
 
 		 699 aa  565  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.201818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5062  Na+/solute symporter  46.76 
 
 		 699 aa  556  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  46.12 
 
 		 637 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2364  Calcium-binding EF-hand-containing protein  47.88 
 
 		 695 aa  526  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267814  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2877  Na+/solute symporter  47.74 
 
 		 695 aa  524  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.81009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2192  Na+/solute symporter  47.1 
 
 		 769 aa  521  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.560167  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  41.71 
 
 		 722 aa  511  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  41.84 
 
 		 722 aa  490  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1384  Na+/solute symporter  46.99 
 
 		 676 aa  480  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.604499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  40.45 
 
 		 719 aa  464  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  47.38 
 
 		 614 aa  243  7e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  43.41 
 
 		 729 aa  238  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  48.29 
 
 		 759 aa  221  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  45.28 
 
 		 760 aa  213  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2479  putative sodium symporter protein  36.44 
 
 		 593 aa  207  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.025526 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2050  Na+/solute symporter  36.69 
 
 		 593 aa  205  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500291 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  37.46 
 
 		 592 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  36.88 
 
 		 573 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  39.44 
 
 		 586 aa  200  7e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1177  Na+/solute symporter  39.64 
 
 		 559 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4040  putative sodium symporter protein  40.54 
 
 		 551 aa  198  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0630  sodium:solute symporter family protein  38.73 
 
 		 591 aa  194  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1298  SSS sodium solute transporter superfamily  40.12 
 
 		 575 aa  193  8e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.883366 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  36.12 
 
 		 566 aa  192  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1651  Na+/solute symporter  36.54 
 
 		 590 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.466603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  37.03 
 
 		 591 aa  191  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00160  sodium/solute symporter  37.57 
 
 		 575 aa  191  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1439  Na+ symporter  39.82 
 
 		 588 aa  191  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1042  Na+/solute symporter  34.14 
 
 		 609 aa  191  5.999999999999999e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972047  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3406  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  40.24 
 
 		 560 aa  190  8e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210868 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1496  Na+/solute symporter  42.62 
 
 		 558 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289055  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1794  Na+/solute symporter  35.9 
 
 		 594 aa  188  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0136163  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  47.93 
 
 		 578 aa  187  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  47 
 
 		 572 aa  187  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  46.54 
 
 		 572 aa  187  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4790  SSS sodium solute transporter superfamily  38.24 
 
 		 563 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002207  acetate permease ActP (cation/acetate symporter)  37.18 
 
 		 575 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2278  putative sodium/solute symporter  46.01 
 
 		 567 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  46.08 
 
 		 572 aa  185  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  46.54 
 
 		 572 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.47 
 
 		 582 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  46.54 
 
 		 578 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3155  ribonuclease E and G  36.6 
 
 		 589 aa  184  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  46.54 
 
 		 578 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  46.54 
 
 		 578 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  46.54 
 
 		 578 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1771  Na+/solute symporter  35.43 
 
 		 589 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.509872 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  47 
 
 		 572 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  46.08 
 
 		 572 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  46.08 
 
 		 578 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4101  Na+/solute symporter  38.42 
 
 		 589 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  36.56 
 
 		 568 aa  183  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  46.08 
 
 		 572 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  47.47 
 
 		 582 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0486  sodium:solute symporter family protein  36.87 
 
 		 594 aa  182  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1514  Na+/solute symporter  46.08 
 
 		 578 aa  183  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1581  Na+/solute symporter  46.08 
 
 		 578 aa  183  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.292931  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  46.08 
 
 		 578 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  47.47 
 
 		 582 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  36.22 
 
 		 567 aa  180  8e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0871  Na+/solute symporter  36.92 
 
 		 593 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1570  Na+/solute symporter  25.83 
 
 		 693 aa  178  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2047  Na+/solute symporter  35.15 
 
 		 548 aa  178  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.91078  normal  0.880017 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1263  Na+/solute symporter  43.19 
 
 		 618 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625499  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5743  putative sodium symporter protein  50.46 
 
 		 619 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0088  sodium:solute symporter family protein  43.4 
 
 		 604 aa  172  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208798 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4552  Na+/solute symporter  45.26 
 
 		 603 aa  171  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4952  sodium/solute symporter family protein  35.96 
 
 		 596 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0900  Na+/solute symporter  37.17 
 
 		 588 aa  167  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>