More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2702 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0518  sodium/solute symporter family protein  70.02 
 
 
507 aa  699    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1514  Na+/solute symporter  97.23 
 
 
506 aa  885    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2702  Na+/solute symporter  100 
 
 
506 aa  998    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000021967 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3031  Na+/solute symporter  69.54 
 
 
509 aa  646    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000436384  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0973  Na+/solute symporter  72.37 
 
 
509 aa  714    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2908  Na+/solute symporter  60.08 
 
 
509 aa  580  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1223  Na+/solute symporter  42.86 
 
 
562 aa  370  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.704891  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0974  putative sodium symporter protein  42.08 
 
 
560 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1308  Na+/solute symporter  42.17 
 
 
586 aa  369  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3165  putative sodium symporter protein  43.45 
 
 
553 aa  357  2.9999999999999997e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  37.45 
 
 
729 aa  298  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1496  Na+/solute symporter  37.8 
 
 
558 aa  298  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289055  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  35.73 
 
 
566 aa  293  5e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1177  Na+/solute symporter  37.11 
 
 
559 aa  290  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3406  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  35.23 
 
 
560 aa  286  5e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4040  putative sodium symporter protein  36.73 
 
 
551 aa  282  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2479  putative sodium symporter protein  32.48 
 
 
593 aa  277  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.025526 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1298  SSS sodium solute transporter superfamily  35.42 
 
 
575 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.883366 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  34.26 
 
 
573 aa  270  5e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4790  SSS sodium solute transporter superfamily  34.61 
 
 
563 aa  269  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  34.27 
 
 
567 aa  268  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  34.59 
 
 
586 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0630  sodium:solute symporter family protein  34.58 
 
 
591 aa  265  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  31.99 
 
 
572 aa  260  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  32.59 
 
 
572 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  35.11 
 
 
578 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  35.11 
 
 
578 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  33.6 
 
 
568 aa  257  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  35.11 
 
 
578 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  35.11 
 
 
578 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2278  putative sodium/solute symporter  34.48 
 
 
567 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  32.08 
 
 
572 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  35.34 
 
 
578 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002207  acetate permease ActP (cation/acetate symporter)  34.11 
 
 
575 aa  255  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  35.14 
 
 
578 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1439  Na+ symporter  33.03 
 
 
588 aa  253  5.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1514  Na+/solute symporter  35.14 
 
 
578 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0136717 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  33.94 
 
 
572 aa  253  5.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1581  Na+/solute symporter  35.14 
 
 
578 aa  253  6e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.292931  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00160  sodium/solute symporter  33.87 
 
 
575 aa  253  8.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  32.01 
 
 
572 aa  252  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  32.01 
 
 
572 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  35.14 
 
 
578 aa  250  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  34.53 
 
 
572 aa  250  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  35.51 
 
 
582 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4101  Na+/solute symporter  33.45 
 
 
589 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3666  Na+/solute symporter  32.53 
 
 
594 aa  239  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  33.04 
 
 
637 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  35.4 
 
 
582 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  35.2 
 
 
582 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0871  Na+/solute symporter  33.4 
 
 
593 aa  228  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  31.1 
 
 
614 aa  224  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1651  Na+/solute symporter  30.57 
 
 
590 aa  222  9.999999999999999e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.466603  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  38.68 
 
 
760 aa  215  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  39.94 
 
 
759 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0900  Na+/solute symporter  32.69 
 
 
588 aa  213  7e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  34.77 
 
 
722 aa  207  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0486  sodium:solute symporter family protein  38.94 
 
 
594 aa  206  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355483  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  34.77 
 
 
722 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2047  Na+/solute symporter  33.33 
 
 
548 aa  202  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.91078  normal  0.880017 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1794  Na+/solute symporter  40.46 
 
 
594 aa  201  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0136163  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  38.33 
 
 
592 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  38.59 
 
 
591 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1118  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.55 
 
 
552 aa  196  9e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.191913  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  33.58 
 
 
719 aa  196  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1263  Na+/solute symporter  35.21 
 
 
618 aa  194  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625499  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1042  Na+/solute symporter  42.36 
 
 
609 aa  194  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972047  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0088  sodium:solute symporter family protein  38.41 
 
 
604 aa  194  4e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.208798 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2050  Na+/solute symporter  39.8 
 
 
593 aa  193  8e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500291 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  29.43 
 
 
516 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3556  sodium/solute symporter family protein  36.81 
 
 
598 aa  188  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1771  Na+/solute symporter  39.93 
 
 
589 aa  188  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.509872 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  29.55 
 
 
516 aa  187  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  29.25 
 
 
516 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  29.25 
 
 
516 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.06 
 
 
516 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  29.25 
 
 
516 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  29.25 
 
 
516 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  29.25 
 
 
516 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  29.25 
 
 
516 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  29.25 
 
 
516 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4552  Na+/solute symporter  37.05 
 
 
603 aa  184  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2254  Na+/solute symporter  37.38 
 
 
622 aa  183  6e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.61978  normal  0.0640181 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1960  SSS family Na(+)/solute symporter  37.38 
 
 
622 aa  183  8.000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.753241 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  29.67 
 
 
513 aa  182  9.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5743  putative sodium symporter protein  38.11 
 
 
619 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.24 
 
 
516 aa  182  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0279  Na+/solute symporter  37.25 
 
 
622 aa  182  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0772633  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3155  ribonuclease E and G  41.57 
 
 
589 aa  180  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  30.26 
 
 
513 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4952  sodium/solute symporter family protein  40.68 
 
 
596 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0576  Na+/solute symporter  38.91 
 
 
605 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2229  Na+/solute symporter  38.91 
 
 
605 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.164942  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.53 
 
 
515 aa  177  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  28.37 
 
 
559 aa  176  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0507  Na+/solute symporter  37.74 
 
 
605 aa  174  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.318357  normal  0.0591632 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12120  predicted symporter  30.92 
 
 
591 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593677  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  31.1 
 
 
553 aa  172  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0428  Na+/solute symporter  27.49 
 
 
559 aa  170  7e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00400759  decreased coverage  0.0000917486 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.88 
 
 
539 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.808948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>