More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2857 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0279  Na+/solute symporter  55.14 
 
 		 622 aa  639    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0772633  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  100 
 
 		 578 aa  1159    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1263  Na+/solute symporter  56.47 
 
 		 618 aa  647    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625499  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  65.28 
 
 		 586 aa  751    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1960  SSS family Na(+)/solute symporter  55.57 
 
 		 622 aa  638    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.753241 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1771  Na+/solute symporter  67.17 
 
 		 589 aa  770    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.509872 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0088  sodium:solute symporter family protein  62.91 
 
 		 604 aa  730    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4101  Na+/solute symporter  58.21 
 
 		 589 aa  650    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002207  acetate permease ActP (cation/acetate symporter)  61.03 
 
 		 575 aa  690    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0486  sodium:solute symporter family protein  66.45 
 
 		 594 aa  760    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  91.7 
 
 		 578 aa  1042    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0630  sodium:solute symporter family protein  59.8 
 
 		 591 aa  656    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  70.93 
 
 		 567 aa  841    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  85.47 
 
 		 572 aa  981    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  85.81 
 
 		 572 aa  986    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3155  ribonuclease E and G  61.36 
 
 		 589 aa  681    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0871  Na+/solute symporter  58.38 
 
 		 593 aa  634    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2254  Na+/solute symporter  54.93 
 
 		 622 aa  636    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.61978  normal  0.0640181 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  62.19 
 
 		 591 aa  673    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1439  Na+ symporter  58.67 
 
 		 588 aa  651    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  73.93 
 
 		 573 aa  898    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1514  Na+/solute symporter  94.98 
 
 		 578 aa  1071    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1581  Na+/solute symporter  94.81 
 
 		 578 aa  1070    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.292931  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2050  Na+/solute symporter  56.18 
 
 		 593 aa  659    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  84.08 
 
 		 572 aa  970    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  61.39 
 
 		 566 aa  669    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2479  putative sodium symporter protein  59.04 
 
 		 593 aa  689    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.025526 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  91.52 
 
 		 578 aa  1041    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  92.73 
 
 		 578 aa  1052    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  85.81 
 
 		 572 aa  990    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  56.76 
 
 		 592 aa  664    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1651  Na+/solute symporter  68.67 
 
 		 590 aa  798    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.466603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1042  Na+/solute symporter  62.21 
 
 		 609 aa  739    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972047  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  95.67 
 
 		 578 aa  1077    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  85.99 
 
 		 572 aa  984    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  91.7 
 
 		 578 aa  1042    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4552  Na+/solute symporter  56.72 
 
 		 603 aa  640    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2278  putative sodium/solute symporter  72.15 
 
 		 567 aa  828    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  92.04 
 
 		 578 aa  1046    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  85.99 
 
 		 572 aa  969    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  81.14 
 
 		 572 aa  939    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00160  sodium/solute symporter  61.03 
 
 		 575 aa  694    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  75.61 
 
 		 568 aa  879    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1794  Na+/solute symporter  67.49 
 
 		 594 aa  780    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0136163  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0900  Na+/solute symporter  58.8 
 
 		 588 aa  634  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2229  Na+/solute symporter  57.88 
 
 		 605 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.164942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0576  Na+/solute symporter  57.88 
 
 		 605 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4952  sodium/solute symporter family protein  55.65 
 
 		 596 aa  617  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  56.45 
 
 		 582 aa  618  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  57.49 
 
 		 582 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0507  Na+/solute symporter  57.38 
 
 		 605 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.318357  normal  0.0591632 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3556  sodium/solute symporter family protein  55.93 
 
 		 598 aa  612  9.999999999999999e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  57.14 
 
 		 582 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3666  Na+/solute symporter  56.73 
 
 		 594 aa  609  1e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3406  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  58.32 
 
 		 560 aa  610  1e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1177  Na+/solute symporter  58.3 
 
 		 559 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4040  putative sodium symporter protein  57.69 
 
 		 551 aa  595  1e-169  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1298  SSS sodium solute transporter superfamily  54.44 
 
 		 575 aa  586  1e-166  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.883366 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4790  SSS sodium solute transporter superfamily  57.29 
 
 		 563 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5743  putative sodium symporter protein  53.32 
 
 		 619 aa  555  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1496  Na+/solute symporter  52.15 
 
 		 558 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289055  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2047  Na+/solute symporter  52.15 
 
 		 548 aa  471  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.91078  normal  0.880017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  39.55 
 
 		 722 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  41.31 
 
 		 729 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  39.85 
 
 		 722 aa  395  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  38.8 
 
 		 637 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  38.93 
 
 		 759 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  40.41 
 
 		 760 aa  382  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  37.5 
 
 		 719 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  38.08 
 
 		 614 aa  356  7.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0973  Na+/solute symporter  36.36 
 
 		 509 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0518  sodium/solute symporter family protein  34.14 
 
 		 507 aa  261  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2702  Na+/solute symporter  35.07 
 
 		 506 aa  253  6e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000021967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1514  Na+/solute symporter  35.27 
 
 		 506 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0974  putative sodium symporter protein  31.44 
 
 		 560 aa  243  7.999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3031  Na+/solute symporter  33.07 
 
 		 509 aa  240  5e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000436384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3165  putative sodium symporter protein  32.34 
 
 		 553 aa  237  4e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1308  Na+/solute symporter  31.07 
 
 		 586 aa  225  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2908  Na+/solute symporter  32.23 
 
 		 509 aa  225  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1223  Na+/solute symporter  30.61 
 
 		 562 aa  219  1e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.704891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1525  putative membrane transport protein  51.24 
 
 		 713 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  49.77 
 
 		 681 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3039  Na+/solute symporter  48.84 
 
 		 703 aa  209  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2396  Na+/solute symporter  48.1 
 
 		 726 aa  206  8e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4144  Na+/solute symporter  47.83 
 
 		 705 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269765  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  49.05 
 
 		 678 aa  194  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0866  putative membrane transport protein  47.62 
 
 		 699 aa  192  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.201818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.41 
 
 		 672 aa  190  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  45.12 
 
 		 683 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  47.93 
 
 		 688 aa  187  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  47 
 
 		 687 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  47 
 
 		 687 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2228  Na+/solute symporter  44.65 
 
 		 683 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3111  solute/Na+ symporter  39.24 
 
 		 672 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392033  decreased coverage  0.0000204813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1418  Na+/solute symporter  44.14 
 
 		 672 aa  179  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181341 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  45.1 
 
 		 671 aa  180  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1940  sodium:solute symporter family protein  41.03 
 
 		 807 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0786  solute/sodium symporter (SSS) family protein  41.03 
 
 		 671 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2052  solute/sodium symporter (SSS) family protein  41.03 
 
 		 671 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483179  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1079  sodium:solute symporter family protein  41.03 
 
 		 671 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>