More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0351 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  100 
 
 		 759 aa  1480    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  81.05 
 
 		 760 aa  1158    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  49.94 
 
 		 729 aa  672    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  50 
 
 		 722 aa  602  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  51.06 
 
 		 722 aa  593  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  50 
 
 		 719 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  43.9 
 
 		 637 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2479  putative sodium symporter protein  44.37 
 
 		 593 aa  436  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.025526 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  40.93 
 
 		 614 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3406  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.55 
 
 		 560 aa  398  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210868 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1651  Na+/solute symporter  41.64 
 
 		 590 aa  395  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.466603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  41.51 
 
 		 566 aa  391  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1177  Na+/solute symporter  44.14 
 
 		 559 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4040  putative sodium symporter protein  42.07 
 
 		 551 aa  383  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0486  sodium:solute symporter family protein  42.28 
 
 		 594 aa  383  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  37.9 
 
 		 573 aa  385  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1042  Na+/solute symporter  38.9 
 
 		 609 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972047  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1771  Na+/solute symporter  42.11 
 
 		 589 aa  382  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.509872 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  41.18 
 
 		 591 aa  378  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1794  Na+/solute symporter  41.69 
 
 		 594 aa  377  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0136163  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  39.5 
 
 		 572 aa  376  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0630  sodium:solute symporter family protein  40.4 
 
 		 591 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4790  SSS sodium solute transporter superfamily  43.55 
 
 		 563 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2050  Na+/solute symporter  38.02 
 
 		 593 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500291 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  38.84 
 
 		 568 aa  371  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  38.93 
 
 		 578 aa  368  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1298  SSS sodium solute transporter superfamily  41.68 
 
 		 575 aa  369  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.883366 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  38.59 
 
 		 578 aa  366  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  39.09 
 
 		 578 aa  364  3e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1514  Na+/solute symporter  38.59 
 
 		 578 aa  364  3e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1581  Na+/solute symporter  38.59 
 
 		 578 aa  364  3e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.292931  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  39.09 
 
 		 578 aa  364  3e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  39.09 
 
 		 578 aa  364  4e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  38.53 
 
 		 592 aa  363  9e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  38.05 
 
 		 567 aa  362  1e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  38.93 
 
 		 578 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  38.59 
 
 		 578 aa  362  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  38.63 
 
 		 572 aa  361  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  38.8 
 
 		 572 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  38.29 
 
 		 572 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0088  sodium:solute symporter family protein  38.08 
 
 		 604 aa  357  6.999999999999999e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  38.13 
 
 		 572 aa  356  7.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2278  putative sodium/solute symporter  38.1 
 
 		 567 aa  356  8.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1263  Na+/solute symporter  38.35 
 
 		 618 aa  355  2.9999999999999997e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625499  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1439  Na+ symporter  38.96 
 
 		 588 aa  354  4e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  37.81 
 
 		 572 aa  352  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  37.96 
 
 		 572 aa  351  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5743  putative sodium symporter protein  42.81 
 
 		 619 aa  351  3e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  37.12 
 
 		 586 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3155  ribonuclease E and G  39.09 
 
 		 589 aa  343  5e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4101  Na+/solute symporter  38.01 
 
 		 589 aa  341  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4552  Na+/solute symporter  38.56 
 
 		 603 aa  340  7e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0871  Na+/solute symporter  38.72 
 
 		 593 aa  335  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002207  acetate permease ActP (cation/acetate symporter)  37.82 
 
 		 575 aa  333  9e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3556  sodium/solute symporter family protein  38.17 
 
 		 598 aa  331  3e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0900  Na+/solute symporter  38.15 
 
 		 588 aa  331  3e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1960  SSS family Na(+)/solute symporter  37.44 
 
 		 622 aa  330  5.0000000000000004e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.753241 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00160  sodium/solute symporter  37.18 
 
 		 575 aa  330  8e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2254  Na+/solute symporter  37.44 
 
 		 622 aa  329  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.61978  normal  0.0640181 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  39.83 
 
 		 582 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  40.33 
 
 		 582 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  40 
 
 		 582 aa  325  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0279  Na+/solute symporter  35.79 
 
 		 622 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0772633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3666  Na+/solute symporter  37.61 
 
 		 594 aa  318  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4952  sodium/solute symporter family protein  35.36 
 
 		 596 aa  314  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0576  Na+/solute symporter  39.07 
 
 		 605 aa  313  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2229  Na+/solute symporter  39.07 
 
 		 605 aa  313  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.164942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0507  Na+/solute symporter  38.17 
 
 		 605 aa  308  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.318357  normal  0.0591632 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2047  Na+/solute symporter  40.52 
 
 		 548 aa  308  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.91078  normal  0.880017 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1496  Na+/solute symporter  41.95 
 
 		 558 aa  295  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289055  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  53.99 
 
 		 681 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  53.85 
 
 		 678 aa  258  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1525  putative membrane transport protein  55.2 
 
 		 713 aa  257  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3039  Na+/solute symporter  55.41 
 
 		 703 aa  256  9e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4144  Na+/solute symporter  53.6 
 
 		 705 aa  255  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269765  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2396  Na+/solute symporter  53.45 
 
 		 726 aa  255  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  51.26 
 
 		 672 aa  249  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  54.46 
 
 		 683 aa  249  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0866  putative membrane transport protein  56.94 
 
 		 699 aa  248  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.201818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2228  Na+/solute symporter  52.02 
 
 		 683 aa  242  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  51.77 
 
 		 671 aa  236  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3111  solute/Na+ symporter  50.88 
 
 		 672 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392033  decreased coverage  0.0000204813 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0630  solute/sodium symporter (SSS) family protein  51.77 
 
 		 671 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449761  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1792  sodium:solute symporter family protein  51.77 
 
 		 671 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.415447  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1087  Na+/solute symporter  52.78 
 
 		 671 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.215072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1079  sodium:solute symporter family protein  51.77 
 
 		 671 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0786  solute/sodium symporter (SSS) family protein  51.77 
 
 		 671 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1940  sodium:solute symporter family protein  51.77 
 
 		 807 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2052  solute/sodium symporter (SSS) family protein  51.77 
 
 		 671 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483179  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0532  solute/sodium symporter (SSS) family protein  51.77 
 
 		 671 aa  235  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1418  Na+/solute symporter  51.34 
 
 		 672 aa  234  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181341 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5518  Na+/solute symporter  51.8 
 
 		 671 aa  233  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2107  Na+/solute symporter  50.66 
 
 		 671 aa  233  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  51.05 
 
 		 687 aa  233  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5888  Na+/solute symporter  50.66 
 
 		 671 aa  233  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2228  Na+/solute symporter  50.66 
 
 		 671 aa  233  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2189  Na+/solute symporter  50.66 
 
 		 671 aa  233  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  50.63 
 
 		 687 aa  232  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  48.29 
 
 		 688 aa  231  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2214  Na+/solute symporter  50.66 
 
 		 671 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397969  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>