More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0630 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1087  Na+/solute symporter  88.23 
 
 
671 aa  1118    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.215072  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2214  Na+/solute symporter  89.12 
 
 
671 aa  1150    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397969  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1079  sodium:solute symporter family protein  99.25 
 
 
671 aa  1326    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  62.17 
 
 
688 aa  811    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  61.13 
 
 
687 aa  809    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1792  sodium:solute symporter family protein  99.25 
 
 
671 aa  1326    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.415447  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2228  Na+/solute symporter  61.37 
 
 
683 aa  780    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0532  solute/sodium symporter (SSS) family protein  99.55 
 
 
671 aa  1330    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1940  sodium:solute symporter family protein  99.55 
 
 
807 aa  1326    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5518  Na+/solute symporter  88.97 
 
 
671 aa  1147    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2052  solute/sodium symporter (SSS) family protein  99.25 
 
 
671 aa  1326    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483179  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  79.4 
 
 
672 aa  1053    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1418  Na+/solute symporter  82.69 
 
 
672 aa  1073    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181341 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  60.83 
 
 
687 aa  806    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2107  Na+/solute symporter  87.63 
 
 
671 aa  1120    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911895  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  97.47 
 
 
671 aa  1248    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3039  Na+/solute symporter  53.02 
 
 
703 aa  644    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4144  Na+/solute symporter  53.33 
 
 
705 aa  652    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269765  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3111  solute/Na+ symporter  82.99 
 
 
672 aa  1075    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392033  decreased coverage  0.0000204813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  62.2 
 
 
683 aa  804    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5888  Na+/solute symporter  89.27 
 
 
671 aa  1153    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0786  solute/sodium symporter (SSS) family protein  99.25 
 
 
671 aa  1326    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2228  Na+/solute symporter  87.63 
 
 
671 aa  1120    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  55.77 
 
 
681 aa  688    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2189  Na+/solute symporter  89.27 
 
 
671 aa  1153    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0630  solute/sodium symporter (SSS) family protein  100 
 
 
671 aa  1337    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449761  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1525  putative membrane transport protein  52.57 
 
 
713 aa  653    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2831  Na+/solute symporter  50.59 
 
 
703 aa  633  1e-180  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  51.83 
 
 
678 aa  625  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2396  Na+/solute symporter  51.84 
 
 
726 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2052  Na+/solute symporter  51.03 
 
 
702 aa  604  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.698797  normal  0.324787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5062  Na+/solute symporter  49.49 
 
 
699 aa  591  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0866  putative membrane transport protein  50.82 
 
 
699 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.201818  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2192  Na+/solute symporter  50.87 
 
 
769 aa  561  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.560167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  46.22 
 
 
637 aa  558  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2877  Na+/solute symporter  49.63 
 
 
695 aa  537  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.81009  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2364  Calcium-binding EF-hand-containing protein  49.63 
 
 
695 aa  536  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267814  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1384  Na+/solute symporter  48.86 
 
 
676 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.604499  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  40.79 
 
 
722 aa  478  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  38.24 
 
 
722 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  46.3 
 
 
719 aa  362  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  50.6 
 
 
614 aa  243  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  42.81 
 
 
729 aa  239  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  51.77 
 
 
759 aa  233  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  49.33 
 
 
760 aa  226  7e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1496  Na+/solute symporter  47.06 
 
 
558 aa  207  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289055  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2479  putative sodium symporter protein  37.61 
 
 
593 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.025526 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  45.1 
 
 
572 aa  193  9e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  45.59 
 
 
572 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2278  putative sodium/solute symporter  43.13 
 
 
567 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  37.28 
 
 
591 aa  191  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  45.1 
 
 
572 aa  191  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  45.59 
 
 
572 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  36.31 
 
 
573 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  44.61 
 
 
572 aa  189  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  45.1 
 
 
578 aa  189  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  44.61 
 
 
572 aa  189  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  40.83 
 
 
566 aa  188  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  44.61 
 
 
578 aa  188  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1651  Na+/solute symporter  43.56 
 
 
590 aa  187  5e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.466603  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1794  Na+/solute symporter  45.1 
 
 
594 aa  187  5e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0136163  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3406  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  48.02 
 
 
560 aa  187  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210868 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  40.17 
 
 
578 aa  187  8e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  44.12 
 
 
572 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  43.63 
 
 
578 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0486  sodium:solute symporter family protein  44.61 
 
 
594 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355483  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  43.63 
 
 
578 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  43.63 
 
 
578 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  43.63 
 
 
578 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1514  Na+/solute symporter  44.12 
 
 
578 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0136717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1581  Na+/solute symporter  44.12 
 
 
578 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.292931  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1570  Na+/solute symporter  26.21 
 
 
693 aa  184  6e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  43.5 
 
 
568 aa  183  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4040  putative sodium symporter protein  45.5 
 
 
551 aa  183  8.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  43.72 
 
 
582 aa  183  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1771  Na+/solute symporter  47 
 
 
589 aa  183  9.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.509872 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.72 
 
 
582 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  43.72 
 
 
582 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  41.71 
 
 
567 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0630  sodium:solute symporter family protein  41.99 
 
 
591 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  41.98 
 
 
586 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12120  predicted symporter  29.25 
 
 
591 aa  181  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593677  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4552  Na+/solute symporter  47.28 
 
 
603 aa  181  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1298  SSS sodium solute transporter superfamily  37.72 
 
 
575 aa  180  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.883366 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0088  sodium:solute symporter family protein  42.16 
 
 
604 aa  178  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.208798 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1177  Na+/solute symporter  45.45 
 
 
559 aa  179  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1263  Na+/solute symporter  41.71 
 
 
618 aa  179  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625499  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5743  putative sodium symporter protein  49.28 
 
 
619 aa  179  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1042  Na+/solute symporter  44.93 
 
 
609 aa  177  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972047  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2050  Na+/solute symporter  35.57 
 
 
593 aa  176  9e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500291 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3155  ribonuclease E and G  44.61 
 
 
589 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0279  Na+/solute symporter  44.28 
 
 
622 aa  175  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0772633  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2254  Na+/solute symporter  42.06 
 
 
622 aa  175  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.61978  normal  0.0640181 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  33.16 
 
 
592 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1960  SSS family Na(+)/solute symporter  42.06 
 
 
622 aa  174  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.753241 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002207  acetate permease ActP (cation/acetate symporter)  39.66 
 
 
575 aa  174  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3556  sodium/solute symporter family protein  42.31 
 
 
598 aa  173  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00160  sodium/solute symporter  38.82 
 
 
575 aa  171  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4101  Na+/solute symporter  43.28 
 
 
589 aa  171  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1439  Na+ symporter  44.85 
 
 
588 aa  171  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>