More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1298 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1771  Na+/solute symporter  59.23 
 
 		 589 aa  654    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.509872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1177  Na+/solute symporter  66.9 
 
 		 559 aa  714    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4040  putative sodium symporter protein  65.72 
 
 		 551 aa  705    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0486  sodium:solute symporter family protein  58.7 
 
 		 594 aa  637    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0630  sodium:solute symporter family protein  60.03 
 
 		 591 aa  649    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1298  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 		 575 aa  1145    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.883366 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  60.71 
 
 		 591 aa  655    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3406  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  66.78 
 
 		 560 aa  725    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4790  SSS sodium solute transporter superfamily  66.96 
 
 		 563 aa  708    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1651  Na+/solute symporter  59.2 
 
 		 590 aa  655    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.466603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2479  putative sodium symporter protein  58.61 
 
 		 593 aa  678    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.025526 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1794  Na+/solute symporter  57.86 
 
 		 594 aa  633  1e-180  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0136163  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2278  putative sodium/solute symporter  57.94 
 
 		 567 aa  630  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  54.68 
 
 		 573 aa  629  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  56.93 
 
 		 567 aa  622  1e-177  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  57.36 
 
 		 586 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  54.61 
 
 		 572 aa  617  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  55.31 
 
 		 568 aa  611  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  53.54 
 
 		 572 aa  610  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  53.54 
 
 		 572 aa  608  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1514  Na+/solute symporter  55.61 
 
 		 578 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1581  Na+/solute symporter  55.44 
 
 		 578 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.292931  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1042  Na+/solute symporter  54.25 
 
 		 609 aa  611  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972047  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  55.28 
 
 		 578 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  53.77 
 
 		 572 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  53.54 
 
 		 572 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  54.44 
 
 		 578 aa  599  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1496  Na+/solute symporter  58.26 
 
 		 558 aa  599  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289055  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  54.77 
 
 		 578 aa  598  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  53.77 
 
 		 572 aa  599  1e-170  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  54.94 
 
 		 578 aa  598  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  54.94 
 
 		 578 aa  598  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  54.94 
 
 		 578 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  54.27 
 
 		 572 aa  597  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  54.94 
 
 		 578 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002207  acetate permease ActP (cation/acetate symporter)  54.77 
 
 		 575 aa  580  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2047  Na+/solute symporter  59.67 
 
 		 548 aa  581  1e-164  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.91078  normal  0.880017 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1263  Na+/solute symporter  51.86 
 
 		 618 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625499  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00160  sodium/solute symporter  53.94 
 
 		 575 aa  574  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  53.13 
 
 		 592 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2050  Na+/solute symporter  52.53 
 
 		 593 aa  575  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500291 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0088  sodium:solute symporter family protein  53.77 
 
 		 604 aa  570  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208798 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4552  Na+/solute symporter  53.65 
 
 		 603 aa  569  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4101  Na+/solute symporter  53.33 
 
 		 589 aa  567  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  53.36 
 
 		 566 aa  565  1.0000000000000001e-159  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3155  ribonuclease E and G  53.72 
 
 		 589 aa  561  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5743  putative sodium symporter protein  54.98 
 
 		 619 aa  560  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1439  Na+ symporter  54.44 
 
 		 588 aa  556  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1960  SSS family Na(+)/solute symporter  52.35 
 
 		 622 aa  552  1e-156  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.753241 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2254  Na+/solute symporter  52.03 
 
 		 622 aa  548  1e-155  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.61978  normal  0.0640181 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0279  Na+/solute symporter  51.38 
 
 		 622 aa  545  1e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0772633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3556  sodium/solute symporter family protein  53.05 
 
 		 598 aa  540  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0871  Na+/solute symporter  52.69 
 
 		 593 aa  540  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0900  Na+/solute symporter  53.07 
 
 		 588 aa  541  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  53.5 
 
 		 582 aa  535  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4952  sodium/solute symporter family protein  49.75 
 
 		 596 aa  531  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0507  Na+/solute symporter  53.88 
 
 		 605 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.318357  normal  0.0591632 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  53.68 
 
 		 582 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  54.02 
 
 		 582 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0576  Na+/solute symporter  53.22 
 
 		 605 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2229  Na+/solute symporter  53.22 
 
 		 605 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.164942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3666  Na+/solute symporter  52.37 
 
 		 594 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  42.36 
 
 		 722 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  43.95 
 
 		 729 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  42.35 
 
 		 637 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  42.36 
 
 		 722 aa  436  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  42.64 
 
 		 719 aa  422  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  42.52 
 
 		 614 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  41.68 
 
 		 759 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  42.54 
 
 		 760 aa  396  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0973  Na+/solute symporter  35.02 
 
 		 509 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0518  sodium/solute symporter family protein  35.24 
 
 		 507 aa  290  6e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2702  Na+/solute symporter  35.42 
 
 		 506 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000021967 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0974  putative sodium symporter protein  33.28 
 
 		 560 aa  264  3e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3031  Na+/solute symporter  33.45 
 
 		 509 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000436384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1308  Na+/solute symporter  32.54 
 
 		 586 aa  247  4e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2908  Na+/solute symporter  33.33 
 
 		 509 aa  242  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1223  Na+/solute symporter  32.09 
 
 		 562 aa  239  1e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.704891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  42.43 
 
 		 681 aa  228  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1525  putative membrane transport protein  50.91 
 
 		 713 aa  221  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3039  Na+/solute symporter  47.6 
 
 		 703 aa  221  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4144  Na+/solute symporter  50.24 
 
 		 705 aa  214  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269765  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2396  Na+/solute symporter  47.32 
 
 		 726 aa  210  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  48.61 
 
 		 678 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0866  putative membrane transport protein  49.07 
 
 		 699 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.201818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  39.26 
 
 		 687 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.91 
 
 		 672 aa  197  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  47.6 
 
 		 687 aa  197  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  43.03 
 
 		 683 aa  196  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  48.08 
 
 		 688 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2228  Na+/solute symporter  44.54 
 
 		 683 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2052  Na+/solute symporter  44.89 
 
 		 702 aa  193  8e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.698797  normal  0.324787 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  44.75 
 
 		 671 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2052  solute/sodium symporter (SSS) family protein  44.75 
 
 		 671 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483179  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1792  sodium:solute symporter family protein  44.75 
 
 		 671 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.415447  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1940  sodium:solute symporter family protein  44.75 
 
 		 807 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1079  sodium:solute symporter family protein  44.75 
 
 		 671 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0786  solute/sodium symporter (SSS) family protein  44.75 
 
 		 671 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0532  solute/sodium symporter (SSS) family protein  44.75 
 
 		 671 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1514  Na+/solute symporter  39.07 
 
 		 506 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>