More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0088 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  62.36 
 
 		 572 aa  733    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2229  Na+/solute symporter  62.56 
 
 		 605 aa  677    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.164942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1651  Na+/solute symporter  64.97 
 
 		 590 aa  735    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.466603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1794  Na+/solute symporter  65.96 
 
 		 594 aa  745    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0136163  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  59.22 
 
 		 591 aa  645    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4952  sodium/solute symporter family protein  59.84 
 
 		 596 aa  665    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  62.91 
 
 		 578 aa  730    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1771  Na+/solute symporter  65.41 
 
 		 589 aa  736    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.509872 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  63.76 
 
 		 568 aa  742    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  61.53 
 
 		 586 aa  679    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1960  SSS family Na(+)/solute symporter  61.41 
 
 		 622 aa  691    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.753241 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3556  sodium/solute symporter family protein  62.04 
 
 		 598 aa  684    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  62.03 
 
 		 572 aa  736    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0088  sodium:solute symporter family protein  100 
 
 		 604 aa  1214    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208798 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0576  Na+/solute symporter  62.56 
 
 		 605 aa  677    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00160  sodium/solute symporter  61.79 
 
 		 575 aa  697    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1263  Na+/solute symporter  62.66 
 
 		 618 aa  719    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625499  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0486  sodium:solute symporter family protein  64.32 
 
 		 594 aa  719    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  65.17 
 
 		 592 aa  757    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1439  Na+ symporter  62.25 
 
 		 588 aa  686    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  63.18 
 
 		 578 aa  731    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  63.18 
 
 		 578 aa  738    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3155  ribonuclease E and G  65.12 
 
 		 589 aa  735    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  63.04 
 
 		 567 aa  735    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  63.01 
 
 		 578 aa  735    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0871  Na+/solute symporter  62.91 
 
 		 593 aa  693    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2254  Na+/solute symporter  60.94 
 
 		 622 aa  687    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.61978  normal  0.0640181 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3666  Na+/solute symporter  63.32 
 
 		 594 aa  679    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002207  acetate permease ActP (cation/acetate symporter)  62.3 
 
 		 575 aa  702    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0507  Na+/solute symporter  62.3 
 
 		 605 aa  673    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.318357  normal  0.0591632 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  64.25 
 
 		 573 aa  769    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1514  Na+/solute symporter  63.07 
 
 		 578 aa  736    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1581  Na+/solute symporter  62.91 
 
 		 578 aa  735    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.292931  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2050  Na+/solute symporter  63 
 
 		 593 aa  734    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  63.01 
 
 		 572 aa  742    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  59.59 
 
 		 566 aa  646    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  63.18 
 
 		 578 aa  738    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  62.68 
 
 		 572 aa  741    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2278  putative sodium/solute symporter  64.36 
 
 		 567 aa  722    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2479  putative sodium symporter protein  60.68 
 
 		 593 aa  684    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.025526 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1042  Na+/solute symporter  66.02 
 
 		 609 aa  748    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972047  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  63.07 
 
 		 578 aa  735    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4101  Na+/solute symporter  62.36 
 
 		 589 aa  691    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  62.91 
 
 		 578 aa  734    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4552  Na+/solute symporter  62.48 
 
 		 603 aa  716    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  64.71 
 
 		 572 aa  738    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  62.19 
 
 		 572 aa  720    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0279  Na+/solute symporter  60.47 
 
 		 622 aa  684    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0772633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0900  Na+/solute symporter  63.55 
 
 		 588 aa  694    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  63.24 
 
 		 572 aa  749    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0630  sodium:solute symporter family protein  57.77 
 
 		 591 aa  627  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1177  Na+/solute symporter  55.33 
 
 		 559 aa  580  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3406  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  55.78 
 
 		 560 aa  580  1e-164  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210868 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  54.74 
 
 		 582 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4040  putative sodium symporter protein  56.45 
 
 		 551 aa  578  1.0000000000000001e-163  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  55.07 
 
 		 582 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  55.07 
 
 		 582 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1298  SSS sodium solute transporter superfamily  53.77 
 
 		 575 aa  556  1e-157  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.883366 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4790  SSS sodium solute transporter superfamily  54.46 
 
 		 563 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5743  putative sodium symporter protein  53.41 
 
 		 619 aa  542  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1496  Na+/solute symporter  51.85 
 
 		 558 aa  533  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289055  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2047  Na+/solute symporter  48.63 
 
 		 548 aa  434  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.91078  normal  0.880017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  38.72 
 
 		 722 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  39.06 
 
 		 729 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  38.06 
 
 		 759 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  38.02 
 
 		 637 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  39.18 
 
 		 722 aa  371  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  39.2 
 
 		 760 aa  360  5e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  38.54 
 
 		 719 aa  351  3e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  34.73 
 
 		 614 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1525  putative membrane transport protein  49.5 
 
 		 713 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0973  Na+/solute symporter  41.47 
 
 		 509 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4144  Na+/solute symporter  47.5 
 
 		 705 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269765  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  46.5 
 
 		 681 aa  196  7e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3039  Na+/solute symporter  47.98 
 
 		 703 aa  196  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2396  Na+/solute symporter  46.53 
 
 		 726 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  46.45 
 
 		 678 aa  189  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0866  putative membrane transport protein  43.06 
 
 		 699 aa  182  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.201818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0974  putative sodium symporter protein  35.56 
 
 		 560 aa  182  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0518  sodium/solute symporter family protein  35.99 
 
 		 507 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.89 
 
 		 672 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3165  putative sodium symporter protein  36.08 
 
 		 553 aa  177  7e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2908  Na+/solute symporter  39.08 
 
 		 509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  40.26 
 
 		 683 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2831  Na+/solute symporter  46.57 
 
 		 703 aa  174  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2052  Na+/solute symporter  44.33 
 
 		 702 aa  173  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.698797  normal  0.324787 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2702  Na+/solute symporter  38.41 
 
 		 506 aa  173  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000021967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1514  Na+/solute symporter  38.74 
 
 		 506 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3111  solute/Na+ symporter  42.54 
 
 		 672 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392033  decreased coverage  0.0000204813 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  43.4 
 
 		 688 aa  172  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0630  solute/sodium symporter (SSS) family protein  42.16 
 
 		 671 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449761  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1940  sodium:solute symporter family protein  42.16 
 
 		 807 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  42.16 
 
 		 671 aa  172  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1418  Na+/solute symporter  42.11 
 
 		 672 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181341 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  42.92 
 
 		 687 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1792  sodium:solute symporter family protein  42.16 
 
 		 671 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.415447  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1079  sodium:solute symporter family protein  42.16 
 
 		 671 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2228  Na+/solute symporter  39.83 
 
 		 683 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  42.92 
 
 		 687 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0786  solute/sodium symporter (SSS) family protein  42.16 
 
 		 671 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>