More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1439 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1263  Na+/solute symporter  62.91 
 
 		 618 aa  714    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625499  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0279  Na+/solute symporter  76.85 
 
 		 622 aa  907    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0772633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  58.18 
 
 		 572 aa  654    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4952  sodium/solute symporter family protein  61.06 
 
 		 596 aa  675    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  58.67 
 
 		 578 aa  636    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0507  Na+/solute symporter  70.25 
 
 		 605 aa  779    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.318357  normal  0.0591632 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2278  putative sodium/solute symporter  61.39 
 
 		 567 aa  657    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  58.52 
 
 		 572 aa  656    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1794  Na+/solute symporter  58.55 
 
 		 594 aa  643    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0136163  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1960  SSS family Na(+)/solute symporter  76.05 
 
 		 622 aa  908    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.753241 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0088  sodium:solute symporter family protein  62.25 
 
 		 604 aa  672    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208798 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  61.29 
 
 		 568 aa  683    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0576  Na+/solute symporter  70.58 
 
 		 605 aa  780    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1771  Na+/solute symporter  60.36 
 
 		 589 aa  646    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.509872 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  57.5 
 
 		 572 aa  648    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0486  sodium:solute symporter family protein  59.87 
 
 		 594 aa  640    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00160  sodium/solute symporter  67.74 
 
 		 575 aa  737    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1439  Na+ symporter  100 
 
 		 588 aa  1170    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  59.86 
 
 		 567 aa  661    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002207  acetate permease ActP (cation/acetate symporter)  67.74 
 
 		 575 aa  735    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3556  sodium/solute symporter family protein  70.78 
 
 		 598 aa  783    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3155  ribonuclease E and G  67.18 
 
 		 589 aa  745    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2229  Na+/solute symporter  70.58 
 
 		 605 aa  780    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.164942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0871  Na+/solute symporter  78.22 
 
 		 593 aa  899    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2254  Na+/solute symporter  75.88 
 
 		 622 aa  905    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.61978  normal  0.0640181 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3666  Na+/solute symporter  70.88 
 
 		 594 aa  780    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  60.27 
 
 		 573 aa  687    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2050  Na+/solute symporter  63.44 
 
 		 593 aa  716    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  57.84 
 
 		 572 aa  650    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1651  Na+/solute symporter  60.53 
 
 		 590 aa  659    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.466603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  63.88 
 
 		 592 aa  725    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1042  Na+/solute symporter  58.65 
 
 		 609 aa  660    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972047  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4552  Na+/solute symporter  68.99 
 
 		 603 aa  795    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  58.52 
 
 		 572 aa  637    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  58.01 
 
 		 572 aa  653    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  57 
 
 		 572 aa  651    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4101  Na+/solute symporter  80.81 
 
 		 589 aa  925    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0900  Na+/solute symporter  80.27 
 
 		 588 aa  915    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  58.16 
 
 		 578 aa  634  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  57.67 
 
 		 578 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  57.67 
 
 		 578 aa  628  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1514  Na+/solute symporter  57.65 
 
 		 578 aa  631  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1581  Na+/solute symporter  57.48 
 
 		 578 aa  630  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.292931  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  57.67 
 
 		 578 aa  628  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  57.5 
 
 		 578 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  56.97 
 
 		 578 aa  620  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  58.96 
 
 		 566 aa  621  1e-176  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2479  putative sodium symporter protein  53.76 
 
 		 593 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.025526 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  56.6 
 
 		 586 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  53.74 
 
 		 591 aa  557  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0630  sodium:solute symporter family protein  53.58 
 
 		 591 aa  554  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1177  Na+/solute symporter  53.99 
 
 		 559 aa  533  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1298  SSS sodium solute transporter superfamily  54.44 
 
 		 575 aa  533  1e-150  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.883366 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3406  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  52.6 
 
 		 560 aa  532  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210868 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  53.01 
 
 		 582 aa  528  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  53.53 
 
 		 582 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  53.18 
 
 		 582 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4040  putative sodium symporter protein  51.82 
 
 		 551 aa  511  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4790  SSS sodium solute transporter superfamily  53.5 
 
 		 563 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1496  Na+/solute symporter  51.2 
 
 		 558 aa  483  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289055  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5743  putative sodium symporter protein  50 
 
 		 619 aa  482  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2047  Na+/solute symporter  48.33 
 
 		 548 aa  434  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.91078  normal  0.880017 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  39.62 
 
 		 637 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  40.62 
 
 		 729 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  38.47 
 
 		 614 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  38.96 
 
 		 759 aa  360  4e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  39.11 
 
 		 719 aa  342  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  38.31 
 
 		 760 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0973  Na+/solute symporter  35.5 
 
 		 509 aa  272  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2702  Na+/solute symporter  33.15 
 
 		 506 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000021967 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0974  putative sodium symporter protein  31.72 
 
 		 560 aa  240  6.999999999999999e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3165  putative sodium symporter protein  31.84 
 
 		 553 aa  228  3e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1308  Na+/solute symporter  32.05 
 
 		 586 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1223  Na+/solute symporter  31.23 
 
 		 562 aa  217  4e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.704891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2908  Na+/solute symporter  32.49 
 
 		 509 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  41.98 
 
 		 681 aa  213  7e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  37.86 
 
 		 722 aa  211  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  46.72 
 
 		 722 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4144  Na+/solute symporter  39.2 
 
 		 705 aa  201  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269765  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  39.82 
 
 		 688 aa  191  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0518  sodium/solute symporter family protein  38.69 
 
 		 507 aa  190  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3039  Na+/solute symporter  39.41 
 
 		 703 aa  190  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  39.82 
 
 		 687 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  39.82 
 
 		 687 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1525  putative membrane transport protein  41.3 
 
 		 713 aa  187  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  29.96 
 
 		 577 aa  183  8.000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1384  Na+/solute symporter  30.77 
 
 		 676 aa  180  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.604499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0428  Na+/solute symporter  29.49 
 
 		 559 aa  179  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00400759  decreased coverage  0.0000917486 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3782  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.48 
 
 		 563 aa  179  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.804193  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  37.5 
 
 		 678 aa  177  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  37.98 
 
 		 683 aa  176  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2396  Na+/solute symporter  42.79 
 
 		 726 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  40.69 
 
 		 672 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3111  solute/Na+ symporter  36.58 
 
 		 672 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392033  decreased coverage  0.0000204813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1418  Na+/solute symporter  36.42 
 
 		 672 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181341 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  29.75 
 
 		 576 aa  169  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2228  Na+/solute symporter  38.4 
 
 		 683 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0866  putative membrane transport protein  41.7 
 
 		 699 aa  169  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.201818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2831  Na+/solute symporter  36.58 
 
 		 703 aa  169  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  28.26 
 
 		 549 aa  167  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>