More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1418 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A2052  solute/sodium symporter (SSS) family protein  82.09 
 
 		 671 aa  1061    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483179  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  63.66 
 
 		 688 aa  841    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  62.63 
 
 		 687 aa  832    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1792  sodium:solute symporter family protein  82.09 
 
 		 671 aa  1061    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.415447  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  62.92 
 
 		 687 aa  833    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2228  Na+/solute symporter  62.87 
 
 		 683 aa  807    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1418  Na+/solute symporter  100 
 
 		 672 aa  1357    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181341 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0532  solute/sodium symporter (SSS) family protein  82.39 
 
 		 671 aa  1066    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1940  sodium:solute symporter family protein  82.39 
 
 		 807 aa  1065    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2107  Na+/solute symporter  81.49 
 
 		 671 aa  1036    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5518  Na+/solute symporter  82.84 
 
 		 671 aa  1061    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  87.5 
 
 		 672 aa  1172    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2214  Na+/solute symporter  82.39 
 
 		 671 aa  1056    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1087  Na+/solute symporter  82.24 
 
 		 671 aa  1043    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.215072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  83.28 
 
 		 671 aa  1078    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1079  sodium:solute symporter family protein  82.09 
 
 		 671 aa  1061    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3039  Na+/solute symporter  52.27 
 
 		 703 aa  642    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4144  Na+/solute symporter  51.71 
 
 		 705 aa  645    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269765  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3111  solute/Na+ symporter  97.77 
 
 		 672 aa  1267    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392033  decreased coverage  0.0000204813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  61.83 
 
 		 683 aa  811    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5888  Na+/solute symporter  82.39 
 
 		 671 aa  1057    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1525  putative membrane transport protein  51.84 
 
 		 713 aa  640    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2228  Na+/solute symporter  81.49 
 
 		 671 aa  1040    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2189  Na+/solute symporter  82.39 
 
 		 671 aa  1057    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0630  solute/sodium symporter (SSS) family protein  82.69 
 
 		 671 aa  1071    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449761  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  53.93 
 
 		 681 aa  669    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0786  solute/sodium symporter (SSS) family protein  82.09 
 
 		 671 aa  1061    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2831  Na+/solute symporter  49.78 
 
 		 703 aa  629  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2396  Na+/solute symporter  51.91 
 
 		 726 aa  618  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  50.45 
 
 		 678 aa  615  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2052  Na+/solute symporter  49.93 
 
 		 702 aa  600  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.698797  normal  0.324787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5062  Na+/solute symporter  49.85 
 
 		 699 aa  600  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0866  putative membrane transport protein  49.48 
 
 		 699 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.201818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2192  Na+/solute symporter  49.92 
 
 		 769 aa  557  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.560167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  44.84 
 
 		 637 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2364  Calcium-binding EF-hand-containing protein  48.9 
 
 		 695 aa  536  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267814  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2877  Na+/solute symporter  48.89 
 
 		 695 aa  535  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.81009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  39.95 
 
 		 722 aa  501  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1384  Na+/solute symporter  47.89 
 
 		 676 aa  497  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.604499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  39.54 
 
 		 722 aa  476  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  39.25 
 
 		 719 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  42.49 
 
 		 729 aa  248  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  52.07 
 
 		 614 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  51.34 
 
 		 759 aa  231  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  50.68 
 
 		 760 aa  227  7e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1496  Na+/solute symporter  45.73 
 
 		 558 aa  208  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289055  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1298  SSS sodium solute transporter superfamily  37.36 
 
 		 575 aa  197  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.883366 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2050  Na+/solute symporter  34.58 
 
 		 593 aa  196  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500291 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  38.52 
 
 		 572 aa  194  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2479  putative sodium symporter protein  46.57 
 
 		 593 aa  192  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.025526 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  42.17 
 
 		 572 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  41.7 
 
 		 572 aa  191  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  41.74 
 
 		 572 aa  191  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  42.17 
 
 		 572 aa  190  9e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  41.74 
 
 		 572 aa  189  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  44.14 
 
 		 578 aa  189  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1794  Na+/solute symporter  43.75 
 
 		 594 aa  188  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0136163  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  41.74 
 
 		 572 aa  189  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1570  Na+/solute symporter  27.42 
 
 		 693 aa  189  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  39.85 
 
 		 573 aa  189  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  43.69 
 
 		 578 aa  188  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1651  Na+/solute symporter  44.44 
 
 		 590 aa  188  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.466603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  35.5 
 
 		 591 aa  187  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  37.5 
 
 		 578 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0486  sodium:solute symporter family protein  43.75 
 
 		 594 aa  187  5e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  42.02 
 
 		 582 aa  187  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  37.5 
 
 		 578 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  37.5 
 
 		 578 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  37.5 
 
 		 578 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  35.65 
 
 		 566 aa  187  6e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  44.98 
 
 		 578 aa  187  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2278  putative sodium/solute symporter  42.67 
 
 		 567 aa  186  8e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  42.79 
 
 		 568 aa  187  8e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.02 
 
 		 582 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1514  Na+/solute symporter  43.24 
 
 		 578 aa  186  9e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1581  Na+/solute symporter  43.24 
 
 		 578 aa  186  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.292931  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4040  putative sodium symporter protein  38.41 
 
 		 551 aa  186  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  42.02 
 
 		 582 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1177  Na+/solute symporter  37.94 
 
 		 559 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3406  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.95 
 
 		 560 aa  185  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210868 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  40.4 
 
 		 567 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0630  sodium:solute symporter family protein  35.59 
 
 		 591 aa  184  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  32.62 
 
 		 592 aa  183  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1771  Na+/solute symporter  44.2 
 
 		 589 aa  182  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.509872 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  34.88 
 
 		 586 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0088  sodium:solute symporter family protein  42.11 
 
 		 604 aa  181  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208798 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1263  Na+/solute symporter  41.92 
 
 		 618 aa  177  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625499  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1439  Na+ symporter  36.42 
 
 		 588 aa  177  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5743  putative sodium symporter protein  51.69 
 
 		 619 aa  177  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4552  Na+/solute symporter  48.35 
 
 		 603 aa  177  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00160  sodium/solute symporter  35.58 
 
 		 575 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4101  Na+/solute symporter  37.35 
 
 		 589 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2096  Na+/solute symporter  27.68 
 
 		 590 aa  173  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.566252  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1042  Na+/solute symporter  38.35 
 
 		 609 aa  172  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972047  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4790  SSS sodium solute transporter superfamily  35.6 
 
 		 563 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002207  acetate permease ActP (cation/acetate symporter)  34.97 
 
 		 575 aa  171  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2047  Na+/solute symporter  35.95 
 
 		 548 aa  171  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.91078  normal  0.880017 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4952  sodium/solute symporter family protein  39.04 
 
 		 596 aa  167  6.9999999999999995e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3155  ribonuclease E and G  38.93 
 
 		 589 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0871  Na+/solute symporter  35.17 
 
 		 593 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>