More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0900 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1771  Na+/solute symporter  59.83 
 
 
589 aa  644    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.509872 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0279  Na+/solute symporter  74.76 
 
 
622 aa  897    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0772633  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1263  Na+/solute symporter  62.93 
 
 
618 aa  714    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625499  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0507  Na+/solute symporter  68.6 
 
 
605 aa  756    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.318357  normal  0.0591632 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1439  Na+ symporter  80.27 
 
 
588 aa  936    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4952  sodium/solute symporter family protein  64.1 
 
 
596 aa  699    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1794  Na+/solute symporter  60.37 
 
 
594 aa  651    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0136163  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  57.89 
 
 
572 aa  649    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2278  putative sodium/solute symporter  59.66 
 
 
567 aa  636    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  63.88 
 
 
592 aa  733    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1960  SSS family Na(+)/solute symporter  73.31 
 
 
622 aa  881    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.753241 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  59.66 
 
 
567 aa  655    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  58.12 
 
 
572 aa  648    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002207  acetate permease ActP (cation/acetate symporter)  67.4 
 
 
575 aa  738    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0088  sodium:solute symporter family protein  63.55 
 
 
604 aa  689    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.208798 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0576  Na+/solute symporter  67.6 
 
 
605 aa  750    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1651  Na+/solute symporter  60.17 
 
 
590 aa  653    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.466603  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00160  sodium/solute symporter  66.72 
 
 
575 aa  734    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0486  sodium:solute symporter family protein  60.7 
 
 
594 aa  651    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355483  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  58.84 
 
 
572 aa  659    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3155  ribonuclease E and G  68.7 
 
 
589 aa  761    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4101  Na+/solute symporter  78.44 
 
 
589 aa  910    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0871  Na+/solute symporter  82.41 
 
 
593 aa  942    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2254  Na+/solute symporter  73.31 
 
 
622 aa  882    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.61978  normal  0.0640181 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3666  Na+/solute symporter  71.26 
 
 
594 aa  798    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  60.31 
 
 
573 aa  689    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2050  Na+/solute symporter  65.2 
 
 
593 aa  742    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  58.29 
 
 
572 aa  649    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  58.12 
 
 
572 aa  646    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3556  sodium/solute symporter family protein  71.29 
 
 
598 aa  796    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1042  Na+/solute symporter  59.31 
 
 
609 aa  671    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972047  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4552  Na+/solute symporter  66.5 
 
 
603 aa  775    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  61.3 
 
 
568 aa  682    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  56.95 
 
 
572 aa  635    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0900  Na+/solute symporter  100 
 
 
588 aa  1173    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2229  Na+/solute symporter  67.6 
 
 
605 aa  750    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.164942  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  58.8 
 
 
578 aa  633  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  58.29 
 
 
578 aa  632  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  58.46 
 
 
578 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  58.46 
 
 
578 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  58.46 
 
 
578 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  58.63 
 
 
578 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  57 
 
 
572 aa  628  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1514  Na+/solute symporter  58.63 
 
 
578 aa  626  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0136717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1581  Na+/solute symporter  58.46 
 
 
578 aa  625  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.292931  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  58.63 
 
 
578 aa  627  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2479  putative sodium symporter protein  55.44 
 
 
593 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.025526 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  57.71 
 
 
566 aa  613  9.999999999999999e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  57.29 
 
 
586 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  54.58 
 
 
591 aa  568  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1177  Na+/solute symporter  54.43 
 
 
559 aa  536  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0630  sodium:solute symporter family protein  52.71 
 
 
591 aa  537  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3406  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  53.18 
 
 
560 aa  538  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210868 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  53.48 
 
 
582 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  53.31 
 
 
582 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1298  SSS sodium solute transporter superfamily  53.07 
 
 
575 aa  525  1e-147  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.883366 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  53.48 
 
 
582 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4040  putative sodium symporter protein  51.48 
 
 
551 aa  514  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5743  putative sodium symporter protein  50.32 
 
 
619 aa  495  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4790  SSS sodium solute transporter superfamily  51.37 
 
 
563 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1496  Na+/solute symporter  48.98 
 
 
558 aa  480  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289055  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2047  Na+/solute symporter  48.34 
 
 
548 aa  427  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.91078  normal  0.880017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  39.2 
 
 
722 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  39.24 
 
 
729 aa  368  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  37.38 
 
 
637 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  38.48 
 
 
722 aa  359  8e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  37.13 
 
 
614 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  38.15 
 
 
759 aa  338  9.999999999999999e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  39.22 
 
 
719 aa  331  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  38.75 
 
 
760 aa  324  3e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0973  Na+/solute symporter  33.04 
 
 
509 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0974  putative sodium symporter protein  31.88 
 
 
560 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3031  Na+/solute symporter  32.68 
 
 
509 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000436384  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1223  Na+/solute symporter  32.03 
 
 
562 aa  227  5.0000000000000005e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.704891  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3165  putative sodium symporter protein  30.9 
 
 
553 aa  222  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1308  Na+/solute symporter  32.89 
 
 
586 aa  218  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2702  Na+/solute symporter  32.33 
 
 
506 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000021967 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4144  Na+/solute symporter  40.51 
 
 
705 aa  201  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269765  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  46.12 
 
 
681 aa  189  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0518  sodium/solute symporter family protein  38.67 
 
 
507 aa  187  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2908  Na+/solute symporter  37.5 
 
 
509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3039  Na+/solute symporter  42.72 
 
 
703 aa  183  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1525  putative membrane transport protein  44.78 
 
 
713 aa  182  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2396  Na+/solute symporter  43.69 
 
 
726 aa  182  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  46.01 
 
 
678 aa  179  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3782  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.06 
 
 
563 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.804193  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  28.6 
 
 
577 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2831  Na+/solute symporter  38.64 
 
 
703 aa  174  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1514  Na+/solute symporter  39.04 
 
 
506 aa  171  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0866  putative membrane transport protein  43.28 
 
 
699 aa  169  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.201818  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  37.17 
 
 
688 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0556  acetate permease  29.8 
 
 
572 aa  162  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  36.76 
 
 
687 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.54 
 
 
530 aa  162  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  36.28 
 
 
687 aa  161  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2052  Na+/solute symporter  39.15 
 
 
702 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.698797  normal  0.324787 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.13 
 
 
672 aa  159  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2228  Na+/solute symporter  40.09 
 
 
683 aa  158  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  43.5 
 
 
671 aa  157  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1940  sodium:solute symporter family protein  43.5 
 
 
807 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>