More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0974 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1223  Na+/solute symporter  70.36 
 
 
562 aa  752    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.704891  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1308  Na+/solute symporter  67.14 
 
 
586 aa  717    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0974  putative sodium symporter protein  100 
 
 
560 aa  1113    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3165  putative sodium symporter protein  62.41 
 
 
553 aa  633  1e-180  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0518  sodium/solute symporter family protein  43.43 
 
 
507 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0973  Na+/solute symporter  42.62 
 
 
509 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2702  Na+/solute symporter  42.08 
 
 
506 aa  355  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000021967 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3031  Na+/solute symporter  40.91 
 
 
509 aa  348  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000436384  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1514  Na+/solute symporter  41.7 
 
 
506 aa  343  4e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2908  Na+/solute symporter  38.86 
 
 
509 aa  327  5e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1496  Na+/solute symporter  37.45 
 
 
558 aa  300  6e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289055  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2479  putative sodium symporter protein  34.1 
 
 
593 aa  300  6e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.025526 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  32.99 
 
 
573 aa  273  7e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3406  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.51 
 
 
560 aa  271  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210868 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2050  Na+/solute symporter  32.11 
 
 
593 aa  267  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500291 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  32.26 
 
 
637 aa  267  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0630  sodium:solute symporter family protein  32.39 
 
 
591 aa  266  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  34.93 
 
 
729 aa  265  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1177  Na+/solute symporter  33.74 
 
 
559 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  33.1 
 
 
567 aa  262  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  31.94 
 
 
592 aa  259  6e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  31.21 
 
 
591 aa  259  7e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1651  Na+/solute symporter  32.55 
 
 
590 aa  259  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.466603  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4040  putative sodium symporter protein  33.74 
 
 
551 aa  258  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1771  Na+/solute symporter  32.78 
 
 
589 aa  257  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.509872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4790  SSS sodium solute transporter superfamily  33.39 
 
 
563 aa  257  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  32.81 
 
 
568 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  31.57 
 
 
566 aa  253  5.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  32.06 
 
 
586 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0486  sodium:solute symporter family protein  33.05 
 
 
594 aa  252  1e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355483  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1298  SSS sodium solute transporter superfamily  33.28 
 
 
575 aa  250  6e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.883366 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  32.52 
 
 
572 aa  249  8e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2278  putative sodium/solute symporter  32.47 
 
 
567 aa  248  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  31.2 
 
 
572 aa  242  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  30.98 
 
 
572 aa  242  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1439  Na+ symporter  31.72 
 
 
588 aa  241  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  31.19 
 
 
572 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0871  Na+/solute symporter  33.22 
 
 
593 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4101  Na+/solute symporter  32.7 
 
 
589 aa  240  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  31.07 
 
 
572 aa  241  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  30.7 
 
 
572 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  31.84 
 
 
572 aa  236  8e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00160  sodium/solute symporter  32.92 
 
 
575 aa  236  9e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  31.44 
 
 
578 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002207  acetate permease ActP (cation/acetate symporter)  33.15 
 
 
575 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  31.27 
 
 
578 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  31.26 
 
 
578 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0900  Na+/solute symporter  31.88 
 
 
588 aa  232  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1514  Na+/solute symporter  31.09 
 
 
578 aa  231  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0136717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1581  Na+/solute symporter  31.09 
 
 
578 aa  231  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.292931  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  31.26 
 
 
578 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  31.31 
 
 
578 aa  230  5e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  31.09 
 
 
578 aa  230  6e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  31.09 
 
 
578 aa  230  6e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3556  sodium/solute symporter family protein  31.46 
 
 
598 aa  229  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3666  Na+/solute symporter  31.88 
 
 
594 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  31.42 
 
 
759 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3155  ribonuclease E and G  30.89 
 
 
589 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  30.63 
 
 
614 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4952  sodium/solute symporter family protein  31.01 
 
 
596 aa  207  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0507  Na+/solute symporter  32.07 
 
 
605 aa  206  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.318357  normal  0.0591632 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.09 
 
 
582 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  34.6 
 
 
582 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2047  Na+/solute symporter  31.68 
 
 
548 aa  198  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.91078  normal  0.880017 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  35.23 
 
 
582 aa  197  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1042  Na+/solute symporter  34.86 
 
 
609 aa  184  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972047  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5743  putative sodium symporter protein  37.43 
 
 
619 aa  183  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0088  sodium:solute symporter family protein  35.56 
 
 
604 aa  182  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.208798 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  32.43 
 
 
760 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  30.32 
 
 
516 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  30.61 
 
 
516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  30.61 
 
 
516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  30.61 
 
 
516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  30.61 
 
 
516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  29.59 
 
 
516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.28 
 
 
516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  30.52 
 
 
516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1118  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.65 
 
 
552 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.191913  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  30.3 
 
 
516 aa  174  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.14 
 
 
516 aa  174  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  30.39 
 
 
516 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  29.43 
 
 
513 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1794  Na+/solute symporter  38.95 
 
 
594 aa  168  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0136163  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  30.09 
 
 
584 aa  163  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.86 
 
 
530 aa  163  6e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0279  Na+/solute symporter  36.17 
 
 
622 aa  163  9e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0772633  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4365  Na+/solute symporter  28.83 
 
 
554 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.158425  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1263  Na+/solute symporter  34.44 
 
 
618 aa  162  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625499  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  28.93 
 
 
577 aa  161  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2254  Na+/solute symporter  33.55 
 
 
622 aa  162  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.61978  normal  0.0640181 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  28.73 
 
 
665 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  28.57 
 
 
661 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  29.32 
 
 
541 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0428  Na+/solute symporter  26.45 
 
 
559 aa  161  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00400759  decreased coverage  0.0000917486 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.13 
 
 
541 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  34.01 
 
 
719 aa  160  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1960  SSS family Na(+)/solute symporter  33.23 
 
 
622 aa  160  7e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.753241 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  29.59 
 
 
511 aa  160  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  28.06 
 
 
584 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3262  acetate permease  27.78 
 
 
552 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>