More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1223 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1223  Na+/solute symporter  100 
 
 		 562 aa  1111    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.704891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0974  putative sodium symporter protein  70.16 
 
 		 560 aa  752    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1308  Na+/solute symporter  78.06 
 
 		 586 aa  845    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3165  putative sodium symporter protein  58.33 
 
 		 553 aa  596  1e-169  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0973  Na+/solute symporter  42.34 
 
 		 509 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0518  sodium/solute symporter family protein  41.71 
 
 		 507 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3031  Na+/solute symporter  41.71 
 
 		 509 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000436384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2702  Na+/solute symporter  42.58 
 
 		 506 aa  353  4e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000021967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1514  Na+/solute symporter  42.58 
 
 		 506 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2908  Na+/solute symporter  39.54 
 
 		 509 aa  334  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1496  Na+/solute symporter  36.81 
 
 		 558 aa  279  8e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289055  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2479  putative sodium symporter protein  32.79 
 
 		 593 aa  269  8e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.025526 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  32.53 
 
 		 566 aa  265  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  34.55 
 
 		 729 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3406  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.69 
 
 		 560 aa  254  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210868 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  32.71 
 
 		 586 aa  250  5e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  31.52 
 
 		 637 aa  247  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  31.82 
 
 		 592 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  32.19 
 
 		 573 aa  244  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  32.41 
 
 		 567 aa  243  7e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4790  SSS sodium solute transporter superfamily  33.91 
 
 		 563 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0630  sodium:solute symporter family protein  32.23 
 
 		 591 aa  240  5e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1651  Na+/solute symporter  31.93 
 
 		 590 aa  239  1e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.466603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1177  Na+/solute symporter  31.69 
 
 		 559 aa  237  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1771  Na+/solute symporter  31.49 
 
 		 589 aa  236  6e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.509872 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  30.92 
 
 		 591 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00160  sodium/solute symporter  31.51 
 
 		 575 aa  233  6e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4040  putative sodium symporter protein  31.15 
 
 		 551 aa  233  7.000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4101  Na+/solute symporter  31.72 
 
 		 589 aa  233  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002207  acetate permease ActP (cation/acetate symporter)  31.96 
 
 		 575 aa  232  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  31.63 
 
 		 572 aa  232  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  31.16 
 
 		 572 aa  229  7e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0871  Na+/solute symporter  31.65 
 
 		 593 aa  228  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  31.07 
 
 		 572 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2278  putative sodium/solute symporter  32.07 
 
 		 567 aa  226  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  32.41 
 
 		 568 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1298  SSS sodium solute transporter superfamily  32.09 
 
 		 575 aa  225  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.883366 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  31.75 
 
 		 572 aa  225  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  33.47 
 
 		 572 aa  224  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0900  Na+/solute symporter  32.03 
 
 		 588 aa  224  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  31.06 
 
 		 572 aa  223  7e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  32.81 
 
 		 614 aa  220  5e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1439  Na+ symporter  31.23 
 
 		 588 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3556  sodium/solute symporter family protein  31.35 
 
 		 598 aa  217  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  32.41 
 
 		 572 aa  216  9e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  30.82 
 
 		 578 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3155  ribonuclease E and G  30.17 
 
 		 589 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  30.65 
 
 		 578 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  30.65 
 
 		 578 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  34.4 
 
 		 582 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  30.65 
 
 		 578 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  31.54 
 
 		 578 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3666  Na+/solute symporter  30.95 
 
 		 594 aa  213  7e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.91 
 
 		 582 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  33.93 
 
 		 582 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  30.61 
 
 		 578 aa  210  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  30.48 
 
 		 578 aa  209  8e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1514  Na+/solute symporter  33.13 
 
 		 578 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1581  Na+/solute symporter  33.13 
 
 		 578 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.292931  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  29.28 
 
 		 759 aa  207  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0507  Na+/solute symporter  31 
 
 		 605 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.318357  normal  0.0591632 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0576  Na+/solute symporter  31.15 
 
 		 605 aa  197  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2229  Na+/solute symporter  31.15 
 
 		 605 aa  197  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.164942  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4952  sodium/solute symporter family protein  30.77 
 
 		 596 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2047  Na+/solute symporter  31.23 
 
 		 548 aa  189  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.91078  normal  0.880017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  33.7 
 
 		 760 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5743  putative sodium symporter protein  39.86 
 
 		 619 aa  176  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1042  Na+/solute symporter  33.82 
 
 		 609 aa  176  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972047  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  30.63 
 
 		 513 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.81 
 
 		 530 aa  169  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.77 
 
 		 516 aa  169  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0486  sodium:solute symporter family protein  37.07 
 
 		 594 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355483  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  29.77 
 
 		 516 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  29.53 
 
 		 516 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0295  acetate permease  29.05 
 
 		 550 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510607  hitchhiker  0.000229004 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  29.77 
 
 		 516 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  29.77 
 
 		 516 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  29.53 
 
 		 516 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.53 
 
 		 516 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  29.77 
 
 		 516 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  29.77 
 
 		 516 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  29.77 
 
 		 516 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  29.77 
 
 		 516 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03080  SSS sodium solute transporter  28.41 
 
 		 528 aa  163  9e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  29.15 
 
 		 561 aa  162  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4533  acetate permease  29.05 
 
 		 549 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.612121  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  29.05 
 
 		 549 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4526  acetate permease  29.05 
 
 		 549 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  29.89 
 
 		 552 aa  162  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4668  acetate permease  29.05 
 
 		 549 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.962936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4617  acetate permease  29.05 
 
 		 549 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.309264 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1794  Na+/solute symporter  37.21 
 
 		 594 aa  161  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0136163  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1161  SSS sodium solute transporter superfamily  30.34 
 
 		 568 aa  161  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.710493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2050  Na+/solute symporter  36.58 
 
 		 593 aa  161  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500291 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1118  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.81 
 
 		 552 aa  160  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.191913  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  29.05 
 
 		 549 aa  160  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3925  cation/acetate symporter ActP  29.05 
 
 		 549 aa  160  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  29.05 
 
 		 549 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  29.05 
 
 		 549 aa  160  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  29.05 
 
 		 549 aa  160  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>