More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1022 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  100 
 
 		 614 aa  1219    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  45.58 
 
 		 637 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  40.2 
 
 		 722 aa  476  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  44.86 
 
 		 729 aa  458  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  39.63 
 
 		 722 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  40.77 
 
 		 719 aa  435  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  41.29 
 
 		 759 aa  414  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  41.38 
 
 		 760 aa  405  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1298  SSS sodium solute transporter superfamily  42.52 
 
 		 575 aa  391  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.883366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5062  Na+/solute symporter  38.71 
 
 		 699 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3406  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.03 
 
 		 560 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210868 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  37.62 
 
 		 592 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  39.49 
 
 		 566 aa  369  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  39.41 
 
 		 572 aa  361  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1384  Na+/solute symporter  40.43 
 
 		 676 aa  360  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.604499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1177  Na+/solute symporter  41.4 
 
 		 559 aa  360  3e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1439  Na+ symporter  38.47 
 
 		 588 aa  360  4e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2050  Na+/solute symporter  38.41 
 
 		 593 aa  360  5e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500291 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2479  putative sodium symporter protein  38.59 
 
 		 593 aa  359  9e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.025526 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  38.2 
 
 		 573 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  40 
 
 		 591 aa  355  2e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0486  sodium:solute symporter family protein  38.51 
 
 		 594 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0630  sodium:solute symporter family protein  39.4 
 
 		 591 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1263  Na+/solute symporter  37.95 
 
 		 618 aa  352  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625499  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4040  putative sodium symporter protein  39.51 
 
 		 551 aa  351  2e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  37.76 
 
 		 567 aa  351  3e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4101  Na+/solute symporter  36.79 
 
 		 589 aa  349  8e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  39.59 
 
 		 572 aa  349  8e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002207  acetate permease ActP (cation/acetate symporter)  38.79 
 
 		 575 aa  348  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1496  Na+/solute symporter  39.89 
 
 		 558 aa  347  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289055  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1651  Na+/solute symporter  38.21 
 
 		 590 aa  347  3e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.466603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2278  putative sodium/solute symporter  38.41 
 
 		 567 aa  344  2.9999999999999997e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00160  sodium/solute symporter  38.31 
 
 		 575 aa  344  2.9999999999999997e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  38.9 
 
 		 572 aa  343  4e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  38.73 
 
 		 586 aa  343  7e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1581  Na+/solute symporter  38.05 
 
 		 578 aa  343  7e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.292931  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1514  Na+/solute symporter  38.11 
 
 		 578 aa  343  8e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136717 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  37.39 
 
 		 578 aa  342  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1042  Na+/solute symporter  37.56 
 
 		 609 aa  342  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972047  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4790  SSS sodium solute transporter superfamily  39.86 
 
 		 563 aa  342  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3155  ribonuclease E and G  39.02 
 
 		 589 aa  341  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  39.04 
 
 		 572 aa  341  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  37.56 
 
 		 578 aa  342  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  38.22 
 
 		 578 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1794  Na+/solute symporter  36.77 
 
 		 594 aa  340  4e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0136163  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  38.29 
 
 		 572 aa  339  7e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0279  Na+/solute symporter  37.15 
 
 		 622 aa  339  8e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0772633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1771  Na+/solute symporter  37.18 
 
 		 589 aa  339  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.509872 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  38.18 
 
 		 572 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  38.29 
 
 		 572 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4552  Na+/solute symporter  36.6 
 
 		 603 aa  338  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2254  Na+/solute symporter  37.62 
 
 		 622 aa  337  2.9999999999999997e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.61978  normal  0.0640181 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1960  SSS family Na(+)/solute symporter  37.46 
 
 		 622 aa  337  5e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.753241 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  37.06 
 
 		 578 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.58 
 
 		 582 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  37.12 
 
 		 578 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  37.12 
 
 		 578 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  37.12 
 
 		 578 aa  334  3e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  36.73 
 
 		 568 aa  333  4e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0871  Na+/solute symporter  38.14 
 
 		 593 aa  333  6e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0900  Na+/solute symporter  36.94 
 
 		 588 aa  330  4e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  41.92 
 
 		 582 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3556  sodium/solute symporter family protein  38.02 
 
 		 598 aa  326  6e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  41.75 
 
 		 582 aa  326  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3666  Na+/solute symporter  38.32 
 
 		 594 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5743  putative sodium symporter protein  37.76 
 
 		 619 aa  309  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0507  Na+/solute symporter  37.64 
 
 		 605 aa  306  9.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.318357  normal  0.0591632 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0088  sodium:solute symporter family protein  34.75 
 
 		 604 aa  301  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208798 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2229  Na+/solute symporter  36.83 
 
 		 605 aa  301  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.164942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0576  Na+/solute symporter  36.83 
 
 		 605 aa  301  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4952  sodium/solute symporter family protein  36.46 
 
 		 596 aa  299  9e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2047  Na+/solute symporter  37.81 
 
 		 548 aa  295  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.91078  normal  0.880017 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1525  putative membrane transport protein  53.21 
 
 		 713 aa  293  8e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4144  Na+/solute symporter  52.96 
 
 		 705 aa  281  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269765  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  54.18 
 
 		 681 aa  272  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3039  Na+/solute symporter  51.74 
 
 		 703 aa  271  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  54 
 
 		 678 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2396  Na+/solute symporter  49.81 
 
 		 726 aa  257  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  50 
 
 		 672 aa  253  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5518  Na+/solute symporter  51.81 
 
 		 671 aa  250  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5888  Na+/solute symporter  45.19 
 
 		 671 aa  250  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2189  Na+/solute symporter  45.19 
 
 		 671 aa  250  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2831  Na+/solute symporter  44.9 
 
 		 703 aa  249  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2052  solute/sodium symporter (SSS) family protein  50.6 
 
 		 671 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483179  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0630  solute/sodium symporter (SSS) family protein  50.6 
 
 		 671 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449761  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1792  sodium:solute symporter family protein  50.6 
 
 		 671 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.415447  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  50.6 
 
 		 671 aa  249  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1079  sodium:solute symporter family protein  50.6 
 
 		 671 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0786  solute/sodium symporter (SSS) family protein  50.6 
 
 		 671 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1940  sodium:solute symporter family protein  50.6 
 
 		 807 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0532  solute/sodium symporter (SSS) family protein  50.6 
 
 		 671 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0866  putative membrane transport protein  48.22 
 
 		 699 aa  248  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.201818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2214  Na+/solute symporter  44.87 
 
 		 671 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2052  Na+/solute symporter  46.92 
 
 		 702 aa  245  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.698797  normal  0.324787 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1087  Na+/solute symporter  47.65 
 
 		 671 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.215072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3111  solute/Na+ symporter  49.45 
 
 		 672 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392033  decreased coverage  0.0000204813 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2228  Na+/solute symporter  48.01 
 
 		 671 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  50.38 
 
 		 683 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2228  Na+/solute symporter  45.48 
 
 		 683 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1418  Na+/solute symporter  50.19 
 
 		 672 aa  240  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>