More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4127 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4508  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  68.3 
 
 		 557 aa  696    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1161  SSS sodium solute transporter superfamily  64.65 
 
 		 568 aa  643    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.710493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2129  SSS sodium solute transporter superfamily protein  66.18 
 
 		 537 aa  650    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 		 561 aa  1097    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3167  SSS sodium solute transporter superfamily  67.03 
 
 		 536 aa  647    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5018  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  68.3 
 
 		 557 aa  696    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000399279 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3815  Na+/solute symporter  63.71 
 
 		 584 aa  632  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6314  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  65.39 
 
 		 536 aa  625  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267295  normal  0.199401 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1538  SSS sodium solute transporter superfamily protein  61.95 
 
 		 551 aa  594  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.535704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0347  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  60.25 
 
 		 534 aa  565  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0071  SSS sodium solute transporter superfamily  57.3 
 
 		 528 aa  528  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03080  SSS sodium solute transporter  55.41 
 
 		 528 aa  525  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1075  SSS sodium solute transporter superfamily  57.14 
 
 		 546 aa  522  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.099805  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2994  Na+/solute symporter  56.39 
 
 		 632 aa  524  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.77047  normal  0.396474 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1814  SSS sodium solute transporter superfamily  55.54 
 
 		 545 aa  513  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06910  SSS sodium solute transporter  54.37 
 
 		 540 aa  512  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2862  Na+/solute symporter  55.9 
 
 		 537 aa  510  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12100  SSS sodium solute transporter  55.35 
 
 		 532 aa  509  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  53.74 
 
 		 543 aa  508  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252386  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3659  SSS sodium solute transporter superfamily  56.8 
 
 		 542 aa  505  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.641913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3373  SSS sodium solute transporter superfamily  55.1 
 
 		 536 aa  508  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.346982  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1967  SSS sodium solute transporter superfamily  55.18 
 
 		 552 aa  504  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.732438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2139  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  54.17 
 
 		 543 aa  504  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13340  SSS sodium solute transporter  54.23 
 
 		 556 aa  501  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0683463  normal  0.0921974 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  50.84 
 
 		 513 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  48.89 
 
 		 516 aa  496  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4055  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  53.36 
 
 		 541 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.647451  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0219  SSS sodium solute transporter superfamily  55.1 
 
 		 552 aa  497  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1378  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  53.27 
 
 		 538 aa  497  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4130  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  53.36 
 
 		 541 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4284  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  53.16 
 
 		 541 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.231008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0694  SSS sodium solute transporter superfamily  52.6 
 
 		 543 aa  495  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  48.71 
 
 		 516 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  48.89 
 
 		 516 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  48.71 
 
 		 516 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  48.71 
 
 		 516 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  48.71 
 
 		 516 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  48.52 
 
 		 516 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  48.89 
 
 		 516 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  48.62 
 
 		 516 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  48.52 
 
 		 516 aa  491  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  48.34 
 
 		 516 aa  491  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  49.91 
 
 		 530 aa  485  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1396  SSS sodium solute transporter superfamily  53.62 
 
 		 538 aa  483  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000408051 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  49.72 
 
 		 511 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5174  SSS sodium solute transporter superfamily  50.83 
 
 		 525 aa  471  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.11 
 
 		 659 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  42.67 
 
 		 665 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  43.09 
 
 		 584 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  45.23 
 
 		 519 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  43.43 
 
 		 584 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  42.39 
 
 		 661 aa  435  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  42.6 
 
 		 584 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.56 
 
 		 515 aa  435  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2699  SSS sodium solute transporter superfamily  43.12 
 
 		 665 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000107835 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.42 
 
 		 539 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  46.28 
 
 		 513 aa  429  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  43.73 
 
 		 554 aa  428  1e-118  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  45.02 
 
 		 559 aa  427  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  44.67 
 
 		 515 aa  428  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1517  SSS sodium solute transporter superfamily  43.28 
 
 		 664 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000116414  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0465  SSS sodium solute transporter superfamily  43.46 
 
 		 576 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0449  SSS sodium solute transporter superfamily  43.46 
 
 		 576 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  43.98 
 
 		 576 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  43.98 
 
 		 584 aa  421  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  42.83 
 
 		 554 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  42.65 
 
 		 554 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  42.01 
 
 		 551 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0535  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.81 
 
 		 575 aa  412  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  42.96 
 
 		 552 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2856  SSS sodium solute transporter superfamily  42.72 
 
 		 657 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  42.73 
 
 		 554 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1424  SSS sodium solute transporter superfamily  42.72 
 
 		 659 aa  415  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  42.37 
 
 		 552 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  42.55 
 
 		 552 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  42.75 
 
 		 541 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  41.71 
 
 		 552 aa  412  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  43.21 
 
 		 563 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3262  acetate permease  42.25 
 
 		 552 aa  412  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0143  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.35 
 
 		 524 aa  409  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  42.19 
 
 		 551 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  42.76 
 
 		 554 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  42.75 
 
 		 541 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03939  acetate permease  42.73 
 
 		 549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.68156  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3925  cation/acetate symporter ActP  42.55 
 
 		 549 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  41.64 
 
 		 552 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  42.73 
 
 		 549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3949  acetate permease  42.12 
 
 		 551 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.739246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4668  acetate permease  42.37 
 
 		 549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.962936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  42.73 
 
 		 549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1340  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.57 
 
 		 655 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  42.73 
 
 		 549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.57 
 
 		 541 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  42.73 
 
 		 549 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4622  acetate permease  42.73 
 
 		 549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4533  acetate permease  42.19 
 
 		 549 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.612121  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  41.18 
 
 		 552 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0556  acetate permease  44.36 
 
 		 572 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4526  acetate permease  42.19 
 
 		 549 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4617  acetate permease  42.19 
 
 		 549 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.309264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>