More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1424 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  64.6 
 
 		 584 aa  758    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  63.57 
 
 		 584 aa  766    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  64.43 
 
 		 584 aa  774    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2840  SSS sodium solute transporter superfamily  65.25 
 
 		 661 aa  773    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  59.33 
 
 		 665 aa  712    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  63.92 
 
 		 584 aa  770    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1340  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  59.78 
 
 		 655 aa  749    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3288  Na+/solute symporter  64.92 
 
 		 655 aa  764    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2856  SSS sodium solute transporter superfamily  94.39 
 
 		 657 aa  1184    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2699  SSS sodium solute transporter superfamily  60.98 
 
 		 665 aa  716    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000107835 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1373  SSS sodium solute transporter superfamily  65.08 
 
 		 662 aa  770    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174329 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1424  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 		 659 aa  1299    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1517  SSS sodium solute transporter superfamily  61.82 
 
 		 664 aa  721    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000116414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  58.99 
 
 		 661 aa  696    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  63.05 
 
 		 659 aa  776    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  42.64 
 
 		 516 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.47 
 
 		 530 aa  452  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  42.64 
 
 		 516 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  42.64 
 
 		 516 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  42.47 
 
 		 516 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  42.47 
 
 		 516 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  42.47 
 
 		 516 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  42.64 
 
 		 516 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  42.47 
 
 		 516 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  42.12 
 
 		 516 aa  443  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  43.41 
 
 		 513 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.01 
 
 		 516 aa  442  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.95 
 
 		 516 aa  444  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  42.56 
 
 		 511 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1161  SSS sodium solute transporter superfamily  44.16 
 
 		 568 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.710493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0531  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.41 
 
 		 508 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5185  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.58 
 
 		 508 aa  405  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  42.55 
 
 		 561 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  39.04 
 
 		 577 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6314  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.51 
 
 		 536 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267295  normal  0.199401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0071  SSS sodium solute transporter superfamily  43.77 
 
 		 528 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2129  SSS sodium solute transporter superfamily protein  42.66 
 
 		 537 aa  399  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3167  SSS sodium solute transporter superfamily  42.14 
 
 		 536 aa  399  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  40.56 
 
 		 563 aa  399  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0970  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  40.17 
 
 		 516 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5018  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.04 
 
 		 557 aa  393  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000399279 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  40.31 
 
 		 513 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  38.46 
 
 		 554 aa  389  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4508  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.71 
 
 		 557 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0449  SSS sodium solute transporter superfamily  38.95 
 
 		 576 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0465  SSS sodium solute transporter superfamily  38.95 
 
 		 576 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2431  acetate permease  39.93 
 
 		 577 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.157146  normal  0.21776 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  39.02 
 
 		 515 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  38.33 
 
 		 519 aa  385  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  38.38 
 
 		 554 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  38.44 
 
 		 554 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2866  acetate permease  39.35 
 
 		 666 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0150163 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0556  acetate permease  39.33 
 
 		 572 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  38.54 
 
 		 539 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  39.73 
 
 		 559 aa  381  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  39.66 
 
 		 553 aa  382  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0347  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.5 
 
 		 534 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3949  acetate permease  37.62 
 
 		 551 aa  376  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.739246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  39.73 
 
 		 552 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  38.28 
 
 		 554 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  38.87 
 
 		 548 aa  376  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12100  SSS sodium solute transporter  43.03 
 
 		 532 aa  378  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  38.28 
 
 		 554 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  39.62 
 
 		 541 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  38.2 
 
 		 552 aa  378  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  37.63 
 
 		 515 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5152  SSS sodium solute transporter superfamily  47.33 
 
 		 516 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1538  SSS sodium solute transporter superfamily protein  47.51 
 
 		 551 aa  378  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.535704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3815  Na+/solute symporter  42.63 
 
 		 584 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2954  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  38.95 
 
 		 563 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5873  acetate permease  39.58 
 
 		 553 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  38.27 
 
 		 552 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  37.27 
 
 		 552 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4010  acetate permease  37.9 
 
 		 557 aa  373  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.642464 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  37.54 
 
 		 552 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1118  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.03 
 
 		 552 aa  372  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.191913  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3923  acetate permease  37.46 
 
 		 551 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281224  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3837  acetate permease  37.46 
 
 		 551 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0353587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  39.62 
 
 		 541 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1277  acetate permease  37.65 
 
 		 537 aa  375  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03939  acetate permease  36.84 
 
 		 549 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.68156  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3925  cation/acetate symporter ActP  36.68 
 
 		 549 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  37.95 
 
 		 552 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4785  SSS sodium solute transporter superfamily  39.24 
 
 		 563 aa  372  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782319  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  37.81 
 
 		 576 aa  372  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  36.84 
 
 		 549 aa  372  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5596  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  39.1 
 
 		 560 aa  372  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  38.65 
 
 		 541 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  36.84 
 
 		 549 aa  371  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0535  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  38.04 
 
 		 575 aa  372  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2487  acetate permease  38.75 
 
 		 520 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.869989  normal  0.753083 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4529  acetate permease  36.68 
 
 		 549 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  43.42 
 
 		 551 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  36.68 
 
 		 549 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  36.84 
 
 		 549 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  43.62 
 
 		 551 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0295  acetate permease  37.84 
 
 		 550 aa  371  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510607  hitchhiker  0.000229004 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3262  acetate permease  37.03 
 
 		 552 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2624  acetate permease  38.92 
 
 		 520 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.332014  normal  0.410104 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3879  acetate permease  39.27 
 
 		 576 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.262245  normal  0.214662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>